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Organização do DNA e Estrutura dos Cromossomos 1953 Estrutura do DNA (Watson & Crick) 1972 1a molécula DNA recombinante (P.Berg) 1977 Sequenciamento de DNA (Maxam & Gilbert) ... 1985 1a discussão sequenciamento G.H. PCR (K. Mullis) tecnologia DNA recombinante Linha do Tempo 1950 Dupla Hélice DNA (Rosalind Franklin) 1950 - Rosalind Franklin 1953 - James Watson & Francis Crick 1977 - Frederick Sanger 1996 - Ian Wilmut & Dolly 2001 - Cientistas de todo o mundo A “PARTE” pelo “TODO” … Estrutura dos Ácidos Nucléicos Célula Humana Cromossomo DNA (dupla fita) Genoma = cromossomo ou set cromossômico que contém todo o DNA que um organismo (ou organela) possui Cromossomos Virais 1. única ou dupla fita de DNA ou RNA 2. circular ou linear 3. cercado por proteínas TMV T2 bacteriophage bacteriophage Organização do DNA Cromossomos Procarióticos 1. A maioria contém um cromossomo de DNA dupla fita circular 2. outros consistem de um ou mais cromossomos que podem ser circulares ou lineares 3. tipicamente arranjado em uma região condensada chamada nucleóide. Problema: O genoma de E. coli (4.6 Mb), medido linearmente, pode chegar a 1.000 vezes maior que a célula de E. coli. O genoma humano (3.4 Gb) pode chegar a 2.3 m se esticado linearmente Organização do DNA Mais sobre o tamanho do Genoma: C = Quantidade total de DNA em um genoma haploide (1n) É amplamente variável de espécie para espécie e não mostra relação com a complexidade estrutural ou organizacional. Exemplos C (pb) 48,502 T4 168,900 HIV-1 9,750 E. Coli 4,639,221 Lilium formosanum 36,000,000,000 Zea mays 5,000,000,000 Amoeba proteus 290,000,000,00 0 Drosophila melanogaster 180,000,000 Mus musculus 3,454,200,000 Canis familiaris 3,355,500,000 Equus caballus 3,311,000,000 Homo sapiens 3,400,000,000 Soluções: 1. Super-helicoidização 2. Domínio das alças A dupla hélice de DNA enrola-se sobre o seu próprio eixo, num processo controlado por enzimas (Topoisomerases) (ocorre em moléculas de DNA Circular e linear) Definição CROMOSSOMOS É uma unidade do genoma constituída de cromatina (DNA + proteínas) ao longo da qual se dispõem os genes. Visível como entidade morfológica somente durante a divisão celular. Cromatina complexo de DNA e proteínas cromossômicas ~ duas vezes mais proteínas que DNA Dois principais tipos de proteínas: 1. Histonas abundante, proteínas básicas com carga positiva que se ligam ao DNA 5 tipos: H1, H2A, H2B, H3, H4 massa ~ igual ao DNA evolutivamente conservadas 2. Não-histonas e todas as outras proteínas associadas com o DNA difere amplamente em tipo e estrutura quantidade varia muito Estrutura do Cromossomo Empacotamento do DNA nos cromossomos: Nível 1 Voltas de DNA ao redor das histonas para criar a estrutura do nucleossomo. Formação das alças de DNA. Nível 4 Nível 2 Nucleossomos conectados por fio de DNA como colar de contas (beads on a string). Nível 3 Empacotamento dos nucleossomos numa fibra cromatínica de 30-nm. Cromatina Características da Cromatina • 70% proteína – Histonas (proteínas básicas) – não Histonas (proteínas ácidas) • DNA e RNA (~25% e 5% respectivamente) – Altamente repetitivo – Moderadamente repetitivo – Sequencias únicas Características da Cromatina • DNA altamente repetitivo (10% do genoma) – DNA satélite – contém mais proporção de pb AT ou GC – encontra-se, geralmente, em blocos no cromossomo – apresenta sequências em tandem • Moderadamente repetitivo – genes que codificam as histonas – genes que codificam os RNAr e RNAt • DNA de sequências únicas – contém todos os demais genes estruturais Núcleo: Núcleo Eucromatina Heterocromatina Constitutiva Facultatitutiva Barra 300nm Hetrocromatina • Características gerais • Ausência de atividade gênica • Replicação tardia – Constitutiva • permanece condensada durante todo o ciclo celular • concentra-se em blocos • encontra-se em ambos homólogos (= tamanho e local) • geralmente não apresenta genes estruturais • detém a maior parte do DNA satélite Heterocromatina Inativação de cromossomo paterno em pulgões – Heterocromatina Facultativa: • aparece em apenas um cromossomo do par homólogo • envolve todo o cromossomo ou set cromossômico • não apresenta particularidades quanto à composição de DNA • Ex. Inativação de 1 cromossomo X em mulheres na espécie humana (corpusculo de Baar) Cromossomo Eucariótico: Constrição Secundária Centrômero (Constrição primária) Braço longo q Telômeros Braço curto p Cromátides Centrômero Centromere satellite on Macropus rufogriseus metaphase chromosomes (K. Bulazel) Quanto ao centrômero: Classificação: Quanto ao tamanho Grande Médio Pequeno Onde: r = razão entre braços ic = índice centromérico l = braço longo c = braço curto Quanto a posição do centrômero Classificação dos Cromossomos (Centrômero) Telocêntrico: Centrômero na extremidade Acrocêntrico: Centrômero quase na extremidade Submetacêntrico: Centrômero deslocado do centro, braços de tamanhos diferentes Metacêntrico: Centrômero no centro, braços de tamanhos iguais Cromossomos Humanos 3 17 21 (D e G) Braço Curto (p) Braço Longo (q) Cromossomo r ic Metacêntrico 1,00 – 1,49 50,0 – 40,1 Submetacêntrico 1,50 – 2,99 40,0 – 25,1 Acrocêntrico 3,00 - ∞ 25,0 – 0,01 Telômero: do grego: Telos = final Meros = parte Manter a estabilidade estrutural dos cromossomos Ancorar o cromossomo no envoltório nuclear Iniciar o pareamento dos cromossomos homólogos Principais funções Algumas sequências de telômeros conhecidas: Grupo Organismo Repetição (5' > 3') Vertebrados Humano, Rato, Xenopus TTAGGG Fungos filamentos Neurospora crassa TTAGGG Micetozoários Physarum, Didymium Dictyostelium TTAGGG AG(1-8) Protozoários (Kinetoplastea) Trypanosoma, Crithidia TTAGGG Protozoários ciliados Tetrahymena Paramecium Oxytricha, Stylonychia, Euplotes TTGGGG TTGGG(T/G) TTTTGGGG Protozoários (Apicomplexa) Plasmodium TTAGGG(T/C) Plantas superiores Arabidopsis thaliana TTTAGGG Clorófitos Chlamydomonas TTTTAGGG Insetos Bombyx mori TTAGG Nemátodos Ascaris lumbricoides TTAGGC Leveduras Saccharomyces cerevisiae Candida glabrata Candida albicans Candida tropicalis Candida maltosa Candida guillermondii Candida pseudotropicalis Kluyveromyces lactis TGTGGGTGTGGTG ou G(2-3)(TG)(1-6)T GGGGTCTGGGTGCTG GGTGTACGGATGTCTAACTTCTT GGTGTA[C/A]GGATGTCACGATCATT GGTGTACGGATGCAGACTCGCTT GGTGTAC GGTGTACGGATTTGATTAGTTATGT GGTGTACGGATTTGATTAGGTATGT Constrição secundária Região Organizadora de nucléolos Sítios de rDNA DNA moderadamente repetitivo Marcador cromossômico RON ou NOR Cromossomos humanos: numerados em pares do 1 ao 23. Cromossomos autossômicos: Existem 22 pares de cromossomos idênticos em ambos os sexos Cromossomos sexuais: o par 23 é diferente conforme o sexo, XX no sexo feminino e XY no sexo masculino. Cariótipo Cariótipo O conjunto de cromossomas de uma célula que, pelo seu número, forma e tamanho caracteriza uma dada espécie A espécie humana tem 46 cromossomos emparelhados dois a dois Cariótipo de várias espécies… Espécie Nº de cromossomas Espécie Nº de cromossomas Drosófila 8 Humano 46 Centeio 14 Macaco 48 Coelho 44 Rato 44 Cobaia 16 Carneiro 54 Trigo 42 Cavalo 64 Caracol 24 Galo 78 Minhoca 32 Carpa 104 Porco 40 Borboleta 380 http://saber.sapo.cv/wiki/Dros%C3%B3fila http://saber.sapo.cv/wiki/Humanohttp://saber.sapo.cv/wiki/Centeio http://saber.sapo.cv/wiki/Macaco http://saber.sapo.cv/wiki/Coelho http://saber.sapo.cv/wiki/Rato http://saber.sapo.cv/wiki/Cobaia http://saber.sapo.cv/wiki/Carneiro http://saber.sapo.cv/wiki/Cavalo http://saber.sapo.cv/wiki/Caracol http://saber.sapo.cv/wiki/Galo http://saber.sapo.cv/wiki/Minhoca http://saber.sapo.cv/wiki/Carpa http://saber.sapo.cv/wiki/Porco http://saber.sapo.cv/wiki/Borboleta Bandamento cromossômico • Bandamento C • Bandamento G, Q e R • Coloração com Fluorocromos base-específicos: CMA3, DAPI, Quinacrina • Hibridação in situ fluorescente Pareamento cromossômico Localizar regiões específicas da cromatina Verificar alterações numéricas e estruturais Permite estudos evolutivos em grupos afins 5 6 7 8 1 2 43 X y 9 Bandamento C Bandamento G A B C E D G F Quinacrina mostarda Bandamento R Fluorocromos base-específicos FISH Cariótipo O conjunto de cromossomas de uma célula que, pelo seu número, forma e tamanho caracteriza uma dada espécie A espécie humana tem 46 cromossomas emparelhados dois a dois Bandamento G A B C E D G F Fluxo Laminar – Luz UV Meio de Cultura Celular Antibiótico Fito- hemaglutinina Material de Coleta Líquido Amniótico Sangue Periférico Vilosidade Coriônica Biópsia de Tecido Preparação Papa Leucocitária Estufa de Cultura 37˚C – 72 h Separação de Células Brancas Vídeos/Mononuclear Cell Isolation from Whole Blood.mp4 2ª Etapa Vídeos/Making chromosome spreads for karyotyping.avi Vídeos/Making chromosome spreads for karyotyping.avi Cariótipo Hoje em dia… Vídeos/Making chromosome spreads for karyotyping.avi Vídeos/SmartType Demonstration.mp4 http://mapadocrime.com.sapo.pt/mutacoes%20estruturais.html Mutações cromossômicas Numéricas Euploidias e Aneuploidias Euploidias • Quando o cariótipo (um conjunto de todos cromossomos da espécie) alterado para mais ou para menos. • Haploidia ou Monoploidia: É quando ocorre nos seres à perda de um conjunto completo dos cromossomos. Éx: zangões. • Poliploidia: Ocorre quando os seres recebem um conjunto completo dos cromossomos. Estes seres triplóides (3n), tetraplóides (4n), pentaplóide (5n), hexaplóide (6n) e assim por diante. Podem ser autopoliplóides e alopoliplóides. Poliploidia (autoploidia) Resultam na morte do feto Aneuploidias • Quando há um aumento ou diminuição no número de cromossomos por falhas na anáfase I ou anáfase II. As aneuploidias podem ser: monossomia, nulissomia polissomia. Monossomia A monossomia é quando há perda de um dos cromossomos, indicado por 2n – 1. exemplos • Síndrome de Turner: atinge indivíduos do sexo feminino (cariótipo 45,X0). • maioria dos casos se resultam em aborto. • reconhecida no início da puberdade, ausência de menstruação, não desenvolvimento dos órgãos sexuais, ausência de pelos pubianos. • estatura baixa, alterações cardíacas e ósseas, pescoço alado, e fisionomia senil. SÍNDROME DE TURNER 45, X0 http://av.rds.yahoo.com/_ylt=A0Je5X2qdhpIA2gAxjKHBqMX;_ylu=X3oDMTBwanIybjRqBHBndANhdHdfaW1nX3Jlc3VsdARzZWMDc3I-/SIG=12k8m55hd/EXP=1209780266/**http%3a//www.drscope.com/privados/pac/pediatria/p1pcl3/img/f5c.jpg Polissomia • Síndrome de Klinefelter: indivíduos do sexo masculino, (47, XXY). • São estéreis, testículos e pênis com um tamanho inferior ao normal, não tendo a capacidade de produzir espermatozóides. • Escassez dos pêlos pubianos, crescimento das mamas,e retardamento intelectual. • Alta estatura SÍNDROME DE KLINEFELTER 47, XXY • Síndrome de Down: • trissomia do cromossomo 21. • (47,XX, ou 47,XY): • Cabeça pequena com face achatada. • Olhos como os cantos externos puxados para cima. • Pescoço curto e largo e baixa estatura. • Dedos curtos . Linha reta na palma da mão • Coeficiente intelectual baixo • Boca pequena com língua normal. • Baixa expectativa de vida Polissomia CARACTERÍSTICAS CARÍÓTIPO DA SINDROME DE DOWN O gráfico demonstra a relação envelhecimento e idade materna relacionada com casos de Síndrome de Down. IDADE MATERNA OCORRÊNCIA DA SÍNDROME DE DOWN 15 A 29 ANOS 1/1500 30 a 34 ANOS 1/800 35 a 39 ANOS 1/270 40 a 44 ANOS 1/100 ACIMA DE 45 ANOS 1/50 http://images.google.com.br/imgres?imgurl=http://bp2.blogger.com/_iWEC71LBbiA/R0Y59gjoqsI/AAAAAAAAAHo/WM2OfRb9_lw/s320/Uma_pessoa_com_sindrome_de_Down_1.jpg&imgrefurl=http://voceeoquevocequerser.blogspot.com/2007/11/uma-pessoa-com-sndrome-de-down.html&h=300&w=300&sz=21&hl=pt-BR&start=15&tbnid=C0FJkBi4M_BomM:&tbnh=116&tbnw=116&prev=/images%3Fq%3Dadulto%2Bcom%2Bs%25C3%25ADndrome%2Bde%2BDown%26gbv%3D2%26ndsp%3D20%26hl%3Dpt-BR%26sa%3DN Trissomia 21 completa 94,3% Trissomia 21/mosaicismo normal 2,4% Casos de translocação (D/G = G/G) 3,3% Outras Síndromes: SÍNDROME DE PATAU: retardo mental, Palato fendido, lábiol leporino, e surdez. Horas de vida 47, XX (ou XY) + 13 TRISSOMIA DO 13 SÍNDROME DE PATAU SÍNDROME DE EDWARDS: retardo mental, pés tortos, estatura baixa, malformação das orelhas, Lábio leporino, problemas cardíacos e problemas de visão 47,XX +18 ou 47, XY +18 TRISSOMIA DO 18 SÍNDROME DE WILLIAMS FACE DE GNÔMO OU FADINHA http://images.google.com.br/imgres?imgurl=http://www.fiocruz.br/biosseguranca/Bis/infantil/williams1.jpg&imgrefurl=http://www.fiocruz.br/biosseguranca/Bis/infantil/sindrome-willians.htm&h=257&w=180&sz=15&hl=pt-BR&start=2&tbnid=nqch76ORgGOduM:&tbnh=112&tbnw=78&prev=/images%3Fq%3Dsindrome%2Bde%2Bwillians%26gbv%3D2%26hl%3Dpt-BR%26sa%3DG SÍNDROME DE AMBRAS HIPERTRICOSE CONGÊNITA http://images.google.com.br/imgres?imgurl=http://www.portalmedico.org.br/biblioteca_virtual/belas_artes/imagens/gonzales_.jpg&imgrefurl=http://www.portalmedico.org.br/biblioteca_virtual/belas_artes/cap9.htm&h=230&w=150&sz=21&hl=pt-BR&start=12&tbnid=D7VV8rGR0nM4pM:&tbnh=108&tbnw=70&prev=/images%3Fq%3Dsindrome%2Bde%2Bambras%26gbv%3D2%26hl%3Dpt-BR%26sa%3DG http://images.google.com.br/imgres?imgurl=http://www.acreditesequiser.net/wp-content/uploads/2007/11/lobisomem.jpg&imgrefurl=http://www.acreditesequiser.net/category/mutantes/page/3/&h=300&w=303&sz=18&hl=pt-BR&start=1&tbnid=JMlIgJVKHR3lHM:&tbnh=115&tbnw=116&prev=/images%3Fq%3Dsindrome%2Bde%2Bambras%26gbv%3D2%26hl%3Dpt-BR%26sa%3DG http://images.google.com.br/imgres?imgurl=http://pequenos.nireblog.com/blogs/pequenos/files/homelobo.jpg&imgrefurl=http://board.monstersgame.es/viewtopic.php%3Fp%3D884046%26sid%3D87a7c0d1123b09db19030d438b86839d&h=399&w=336&sz=86&hl=pt-BR&start=5&tbnid=nym7DabYxhtF5M:&tbnh=124&tbnw=104&prev=/images%3Fq%3Dsindrome%2Bde%2Bambras%26gbv%3D2%26hl%3Dpt-BR%26sa%3DG http://images.google.com.br/imgres?imgurl=http://bp1.blogger.com/_daBaK24Cl9g/RrhyRO73OtI/AAAAAAAAAJE/d2rRrXuTs_M/s400/01bdrg.jpg&imgrefurl=http://wwwdianna-paseando-por-terra.blogspot.com/2007/08/la-hipertricosis-congnitael-sndrome-del.html&h=208&w=200&sz=17&hl=pt-BR&start=15&tbnid=H-IC8EHCVdQIBM:&tbnh=105&tbnw=101&prev=/images%3Fq%3Dsindrome%2Bde%2Bambras%26gbv%3D2%26hl%3Dpt-BR%26sa%3DG PROGERIA ENVELHECIMENTO PRECOCE Estruturais Mutações Cromossômicas Estruturais • Uma mutação é definida como qualquer alteração permanente na estrutura do DNA. Pode ocorrer em qualquer célula, tanto em células da linhagem germinativa como em células somáticas. • As mutações podem alterar o número de genes dos cromossomos, como as deleções, duplicações e isocromossomia. • Podem também alterar a localização dos genes nos cromosomos, como as inversões e translocações. Deleções É quando ocorre à perda de um pedaço do cromossomo, em alguns casos essa perda é de quase todo o cromossomo, já em outros é só de uma pequena porção. A sobrevivência do individuo vai depender da importância deste gene fragmentado.Se caso for um fragmento sem muita importância, não irá interferir em nada, porém, se o fragmento que se perdeu for de grande ou demuita importância, poderá ser letal. SÍNDROME DO MIADO DO GATO DELEÇÃO DO BRAÇO CURTO DO CROMOSSÔMO 5 Duplicação Quando há um fragmento duplicado no cromossomo, fazendo com que ocorra a repetição dos genes. • A duplicação ocorre quando a troca de fragmentos entre os cromossomos e seu homólogo na meiose é errada. • Quando um cromossomo “doa” erroneamente um fragmento para seu homólogo, ele apresentará uma deficiência e sua par um “pedaço” a mais. • Os gametas vão ter a quantidade de material genético alterada para mais ou para menos. Isocrossomos São cromossomos que se formam a partir de um erro que ocorre durante a meiose ou mitose. Este erro acontece quando o centrômero se divide longitudinalmente e não transversalmente, o que leva a separação dos braços, causando uma deficiência em um e duplicação no outro. Translocação A translocação ocorre quando há uma deslocação de um fragmento de um cromossomo para outro cromossomo não-homólogo. Inversões A inversão é um rearranjo INTRACROMOSSÔMICO no qual um segmento interno do cromossomo foi quebrado 2 vezes, girou 180 graus e se reuniu. Paracêntrica: Quando o centrômero está fora da inversão Pericêntrica: Inversões que envolvem o centrômero Inversões a b c d e f g a b d c e f g a b c d g f e Normal Paracêntrica Pericêntrica
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