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Terceira lista de exercícios. 1) Como é a estrutura molecular básica dos aminoácidos? Os aminoácidos apresentam uma estrutura geral que consiste num grupo amino, um grupo carboxílico e uma cadeia lateral R, de dimensão e características variáveis, ligados a um carbono saturado (Cα). Podem ser encontrados 20 diferentes aminoácidos em proteínas. 2) Como é a classificação dos aminoácidos em relação aos grupos radicais? Os aminoácidos são classificados em polares, não-polares e neutros, dependendo da natureza da cadeia lateral. As ligações entre aminoácidos denominam-se ligações peptídicas e estabelecem-se entre o grupo amina e o grupo carboxilo de dois aminoácidos diferentes, com a perda de uma molécula de água. 3) O que é um carbono alfa e um estereoisômero? O carbono que está a um carbono de distância de um grupo aldeído ou cetona é denominado carbono alfa. Os estereoisómeros (isómeros estereoquímicos) são compostos que apresentam a mesma fórmula de estrutura mas diferem na fórmula estereoquímica, ou seja, os átomos assumem diferentes posições relativas no espaço. 4) Por que os radicais apolares dos aminoácidos ficam voltados para o interior das proteínas, protegido da água? As cadeias laterais de alanina, valina, leucina e isoleucina tendem a sagrupar no interior da proteínas, estabilizando a estrutura proteica por meio de interações hidrofóbicas. Ficam no interior da proteína por ter medo da água, (não interage com a água, ou seja, não forma ligações com a água, pois a água é polar e esse aminoácido são apolar). 5) Por que os radicais polares dos aminoácidos ficam voltados para o exterior das proteínas, interagindo com a água? Os grupos R desses aminoácidos são mais solúveis em água, ou mais hidrofílicos do que aqueles dos aminoácidos apolares, porque eles contêm grupos funcionais que formam ligações de hidrogênio com a água. Essa classe de aminoácidos inclui a serina, treonina, cisteína, asparagina e glutamina. Os grupos hidroxila da serina e treonina e os grupos amida da asparagina e glutamina contribuem para suas polaridades. 6) O que são ligações hidrofóbicas? Interações hidrofóbicas são um tipo de interação intermolecular no qual compostos apolares sofrem consequências das ações dinâmicas dos compostos polares 7) Quais são as principais funções dos grupos R dos aminoácidos? O grupo R é responsável pela diferenciação dos aminoácidos. Função: Os aminoácidos são usados para a síntese de proteínas. 8) Como o pH influência a carga final da glicina, ou seja, se ela vai ser positiva, negativa ou neutra? A carga final da Glicina vai ser considerada neutra. 9) Como é nomeada a ligação que une dois aminoácidos em uma proteína? A ligação peptídica é aquela que ocorre entre um carbono e um nitrogênio, resultantes da desidratação entre dois aminoácidos quaisquer. Ligação peptídica é o nome dado para a interação entre duas ou mais moléculas menores (monômeros) de aminoácidos, formando, dessa maneira, uma macromolécula denominada proteína. 10) Qual é a importância de se manter o pH constante nos seres vivos? Um pH levemente alcalino do sangue aumenta a oxigenação das células e a imunidade. 11) Explique como os aminoácidos podem funcionar como compostos tampões. Essas regiões demonstram que os aminoácidos são responsáveis por uma função tamponante (evitam variações bruscas de pH). Como a forma dipolar é a que ocorre no pHi, toda vez que o pH cai abaixo do valor do pHi (acidificação do meio), o aminoácido recebe o H+ adicionado através da extremidade COO- tornando-se um cátion. 12) As proteínas podem ser classificadas com relação às estruturas em primária, secundária, terciária e quaternária, diferencie as estruturas? A estrutura primária corresponde à sequência linear dos aminoácidos unidos por ligações peptídicas. Em algumas proteínas, a substituição de um aminoácido por outro pode causar doenças e até mesmo levar à morte. A estrutura secundária corresponde ao primeiro nível de enrolamento helicoidal. É caracterizada por padrões regulares e repetitivos que ocorrem localmente, causada pela atração entre certos átomos de aminoácidos próximos. Os dois arranjos locais mais comuns que correspondem a estrutura secundária são a alfa- hélice e a beta-folha ou beta-pregueada. A estrutura terciária corresponde ao dobramento da cadeia polipeptídica sobre si mesma. Na estrutura terciária, a proteína assume uma forma tridimensional específica devido o enovelamento global de toda a cadeia polipeptídica. Enquanto muitas proteínas são formadas por uma única cadeia polipeptídica. Outras, são constituídas por mais de uma cadeia polipeptídica. A estrutura quaternária corresponde a duas ou mais cadeias polipeptídicas, idênticas ou não, que se agrupam e se ajustam para formar a estrutura total da proteína. 13) O que são as proteínas conjugadas? Proteínas conjugadas ou heteroproteínas são aquelas que liberam por hidrólise outros componentes químicos em adição aos aminoácidos. A porção não- constituída por aminoácidos de uma proteína conjugada é chamada de grupo prostético. 14) A sequência de aminoácido em uma proteína é igual para todos os indivíduos de uma espécie? Explique-se. Esse código é universal, sendo o mesmo para todas as espécies de seres vivos do planeta. As únicas exceções são encontradas no RNA produzido por mitocôndrias de algumas espécies. Podemos dizer, portanto, que o código genético apresenta três características importantes: - Especificidade: Uma trinca sempre codificará o mesmo aminoácido. - Universalidade- Todos os seres vivos utilizam o mesmo código genético para codificar os aminoácidos. - Redundância- Um aminoácido pode ser codificado por diferentes trincas.
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