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Concepção Genética Lucas Silva • Estudos diziam que apenas entre 8% e 14% do DNA humano tem um papel importante na constituição do indivíduo. O restante seria considerado “DNA lixo”. o Entretanto, estudos recentes revelaram que a parte “inativa” do Genoma humano têm papel fundamental no gerenciamento da interação entre os genes ativos. o 50% da matéria escura do genoma humana seria constituído por pseudogenes. o Pseudogenes = Genes inativos que, anteriormente tinham funções, mas que ao longo da evolução perderam suas funções -> Seleção natural. Obs.: Processo de formação de uma célula cancerosa: Acumulação de 6 a 7 mutações em genes importantes e na mesma célula. E a matéria escura do genoma humano é fundamental na preservação do DNA ativo das células. • O dogma central diz que a partir de uma molécula de DNA pode ocorrer a replicação, a transcrição em uma molécula de RNAm e a tradução desse RNA para a síntese de uma proteína. • O dogma central não é unidirecional, existem vírus (HIV) capazes de desempenharem o papel inverso do Dogma central, ou seja, são capazes de sintetizar DNA a partir de moléculas de RNA devido a presença da enzima Transcriptase Reversa. • Essa transcrição é possível devido ao fato de que o RNA transcrito (RNAm) possui a mesma informação genética do seu DNA de origem. DNA e RNA • São constituídos pela polimerização de unidade chamadas nucleotídeos • Existem dois tipos: DNA e RNA • O DNA quase sempre se apresenta em uma fita dupla. Ao passo que o RNA quase aprese se apresenta em fita simples. Existem vírus de RNA que apresentam fita dupla e vírus de DNA que apresentam fita simples. • O RNA apresenta capacidade autocatalítica, ou seja, atua como enzima catalisando a própria síntese, diferente do DNA que necessita de um aparato de enzimas para fazer uma cópia própria. • O DNA apresenta maior estabilidade que o RNA, uma vez que devido a simplicidade são mais suscetíveis a mutações. • O DNA apresenta-se como uma fita dupla que tem um giro para a direita e uma volta completa possui cerca de 10,5 pares de bases nitrogenadas. Essas afirmações foram concluídas pelos estudos de James Watson Concepção Genética Lucas Silva • O DNA é uma molécula anfifílica/anfótera, ou seja, apresenta uma região hidrofílica e outra região hidrofóbica. É fundamental para manter a estrutura do DNA • A região onde se localiza o grupo fosfato se localiza apresenta carga negativa, portanto apresenta afinidade com a água. • A região central, onde se encontram as bases nitrogenadas são completamente hidrofóbicas e por isso a água não alcança as regiões internas do DNA. • A estrutura em dupla-hélice do DNA é uma resposta ao meio aquoso do ambiente celular, mantido apenas devido a presença de água no meio intracelular. Em casos de desidratação extrema ou em laboratórios é possível desestruturar a dupla- hélice do DNA assumindo uma estrutura plana. • Ligações químicas no DNA: Devido ao seu caráter anfifílico a molécula de DNA apresenta diversos tipos de ligações na sua estrutura. o Pontes de hidrogênio: ocorre entre as bases nitrogenadas o Ligações Fosfodiéster (covalentes): ocorre entre os grupamentos fosfato e as pentoses. o Interações hidrofóbicas: ocorre nas regiões hidrofóbicas das bases nitrogenadas. o Pontes de Van der Waals: Responsáveis pela inclinação das bases na molécula. Obs.: A ligação fosfodiester é uma ligação covalente altamente energética e difícil de quebrar o que proporciona ainda mais estabilidade a molécula de DNA. Nucleotídeo: o Um grupo fosfato o Uma pentose (açúcar) o Uma base nitrogenada (púrica e pirimídica) • O grupo hidroxila do Carbono 3’ da Pentose do primeiro nucleotídeo se liga ao grupo fosfato ligado a hidroxila do carbono-5’ da pentose do segundo nucleotídeo. • Todo nucleotídeo apresenta bases nitrogenadas ligadas ao Carbono 1 da pentose/ribose e um grupo fosfato ligado ao carbono 5. • O nucleotídeo isolado apresenta 3 átomos de fosforo e quando ele faz a ligação ele perde 2 • Pela disponibilidade espacial dos nucleotídeos na molécula de DNA a Citosina e a Guanina conseguem fazer 3 ligações, ao passo que a Timina e Adenina só conseguem fazer 2 ligações. • A ligação de hidrogênio (fraca) é estrategicamente favorável ao DNA pois este está sendo transcrito o tempo todo, demandando pouco energia, o que não seria viável com ligações covalentes. • O sentido 5’3’ refere-se ao sentido do carbono que está chegando com o carbono que já está presente. Concepção Genética Lucas Silva Obs.: o DNA é formado por vários nucleotídeos os quais precisam se ligar por meio de ligações fosfodiester. Para isso, o nucleotídeo é posicionado junto ao carbono 3’, posição em que está localizado um grupo hidroxila que sairá facilmente da estrutura dessa molécula com o objetivo de que se posicione outros nucleotídeos. ➔ Pentoses do Nucleotídeo: o Ribose: Açúcar presente no RNA o Desoxirribose: Açúcar presente no DNA • A mudança entre os açucares promove uma grande mudança na estabilidade da molécula, devido a mudança do Radical Hidroxila. • A presença de um Radical Hidroxila a mais, no açúcar do RNA (ribose), auxilia nas diversas mudanças conformacionais dessa molécula, o que permite muitas interações intermoleculares dentro deles mesmo, aumentando sua instabilidade devido a grande reatividade. • Essa instabilidade no RNA é fundamental para o desempenho de suas funções celulares, o que não seria possível com o DNA. • A presença dos radicais hidroxilas nos carbonos 1, 3 e 5 são fundamentais para a estrutura do DNA, pois é onde iram se conectar as bases nitrogenadas, o grupo fosfato e outro nucleotídeo. ➔ Bases Nitrogenadas • Purinas: Adenina e Guanina • Pirimidinas: Citosina, Timina e Uracila • Sempre uma Purina irá se ligar a uma Pirimidina. Isso ocorre devido a simetria do DNA, que só pode constar três anéis aromáticos em sequência. • As bases púricas apresentam dois anéis aromáticos e são moléculas maiores que as pirimídicas que apresentam apenas um anel. • Para que o DNA atue e esteja na sua forma correta, as bases púricas devem estar ligadas às suas correspondentes das bases pirimídicas devido a grande afinidade desses pares. • A citosina e a guanina, na molécula de DNA, só conseguem fazer 3 ligações de hidrogênio. • A Timina e Adenina, na molécula de DNA, apesar de terem a possibilidade de fazerem mais só conseguem fazer duas ligações de hidrogênio devido a disposição espacial. • Devido ao caráter hidrofóbico das bases nitrogenadas, o DNA é forçado a apresentar a conformação em dupla-hélice, responsável por esconder as bases no centro da molécula. • As bases, no DNA, não estão dispostas no mesmo plano, devido a rotação da molécula. Concepção Genética Lucas Silva Obs.: Todas as bases nitrogenadas possuem afinidades e podem se ligar umas às outras, entretanto essa afinidade pode ser maior ou menor depende da base. O DNA possui mecanismo de reparo para consertar os pareamentos não esperados (p. ex. adenina ligado a citosina). Estrutura do DNA • A posição do DNA (5’ 3’) depende de onde a síntese começa. • A informação genética de um gene pode ser decodificada para produção de proteínas. • Devido a complementariedade das bases, cada fita serve de molde para a replicação de uma nova fita. • Uma mudança alteraria a informação codificada, como também se perpetuaria pelo processo de replicação. • A estrutura em hélice do DNA é uma resposta em relação ao meio aquoso devido as suas partes hidrofóbicas (bases) que ficam para dentro e a parte hidrofílica fica para fora. • O DNA fora do meio aquoso apresenta estrutura plana. • Um giro completo do DNA apresenta em média 10 pares de base. • Em qualquer parte do DNA a distância entre as fitas é sempre constante (2nm).Obs.: No DNA existe os sulcos maiores e menores que são entradas para as enzimas terem acesso ao DNA e desempenharem suas funções como transcrição e replicação. ➔ FORMAS ESTRUTURAIS DA DUPLA-HÉLICE • Forma B (DNA-B) o Forma padrão (predominante/estável) o Rotação para a direita o Predominante no DNA cromossômico o 10,5 pares de bases por volta • Forma A (DNA-A) o Variante da forma B pela redução da umidade, da água no ambiente químico. Ocorre devido a mudanças no ambiente celular o Predominante em híbridos (DNA-RNA ou RNA-RNA) o 11 pares de bases por volta • Forma Z (DNA-Z) o Rotação para a esquerda o 12 pares de base por volta o Devido a sequencias repetidas C e G (G pode assumir conformação syn) o Suspeita-se que é importante para a regulação da expressão para a regulação da expressão genica e recombinação Concepção Genética Lucas Silva • Outras conformações: Sequencias especificas que levam a variações na conformação do DNA. o Forma circular o DNA helicoidal o DNA tetraplex • Gene é uma sequência genômica de DNA ou RNA que codifica diretamente produtos moleculares funcionais sejam RNA, proteínas ou cadeias polipeptídicas. • Nem todos os genes sofrem tradução, muitos dos genes são apenas transcritos. • O conjunto de genes formam os cromossomos, que é a união do DNA com proteínas histonas. Sendo a união dos dois chamados de cromatina. • Pseudogenes: Possuem estrutura semelhante aos genes, mas não apresentam uma região promotora, portanto eles não apresentam função. • Os genes estão organizados nos cromossomos e esses estão aos pares formando o cariótipo humano. • Os genes se encontram aos pares – Genes alelos – Cromossomos homólogos (diploide 2n) ➔ Estrutura dos genes • Éxons: Regiões codificantes do gene. Determinam a sequência de aminoácidos da proteína. • Íntrons: Regiões não codificante de um gene. São sequencias que, apesar de serem transcritas não fazem parte da molécula final de RNAm. • Região promotora: Região responsável pelo início da transcrição. • Região de terminação: Região responsável pelo termino da transcrição. Obs.: O tamanho cumulativo dos íntros constitui uma porção muito maior do comprimento total do gene do que o dos éxons. O material genético está na forma de cromatina. Constituída principalmente por DNA associado a proteínas básicas chamadas Histonas. Formada por filamentos denominados nucleóssomos ou cromatossomos. Quando o DNA esta compactado é denominado cromossomo. Cada cromossomo humano consiste em uma dupla hélice de DNA contínua e única, isto é, cada cromossomo no núcleo é uma molécula de DNA de fita dupla linear e longa. ➔ Cromatina: • Organização dos DNA associados a proteínas. A cromatina está distribuída por todo núcleo e é relativamente homogênea em sua aparência microscópica. Porém seu genoma condensa-se e aparece como cromossomos durante a divisão celular. Concepção Genética Lucas Silva • A molécula de DNA existe na cromatina como um complexo com uma família de proteínas cromossômicas básicas denominadas histonas e com um grupo heterogêneo de proteínas não- histonas estão muito menos bem caracterizadas. • Cada complexo de DNA com histonas centrais é chamado de nucleossomo, que é a unidade estrutural básica da cromatina. • Heterocromatina: Apresenta coloração mais intensa, é a cromatina mais condensada e inativa, ou seja, não é transcrita. • Eucromatina: Apresenta coloração menos intensa, é a cromatina menos condensada e mais ativa (10%). ➔ Estrutura dos cromossomos: Cada filamento de cromatina é formado de eucromatina e heterocromatina. Cada cromossomo consiste na condensação máxima do material genético sob a forma de cromatina. É o grau máximo de condensação que ocorre durante a divisão celular. Cada cromossomo apresenta duas cromátides irmãs. O centrômero é a região de constrição primaria do cromossomo. É onde se localiza o cinetócoro, estrutura formada por proteínas que garantem a conexão das cromátides irmãs no fuso mitótico. Os braços do cromossomo vão desde o centrômero até as extremidades nos telômeros. Os telômeros são as extremidades dos braços cromossômicos. São regiões que não possuem genes, apenas pequenas repetições de nucleotídeos cuja função é garantir proteção ao cromossomo. ➔ Tipos de cromossomos: • Metacêntricos: centrômero central • Submetacêntricos: braços desiguais • Acrocêntricos: centrômero subterminal • Telocêntricos: centrômero terminal
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