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GENÉTICA LUIZA LOPES CARVALHO Codigo genetico Leitura de uma molécula de RNAm no sentido 5’->3’ em grupos de três nucleotídeos (CÓDONS). No Código Genético ‘’Universal’’ usado por todos os organismos, de bactérias a seres humanos, 61 códons determinam aminoácidos específicos. Os 3 restantes são Códons de término de cadeia (UAA, UAG e UGA). Já o códon de início: AUG. Existem 20 aminoácidos essenciais O Código obedece a três regras principais: Os Códons são lidos na direção 5’->3’, os códons não são sobrepostos e a mensagem não tem interrupções, e a mensagem é traduzida em uma fase de leitura fixa (constante) determinada pelo códon de início. Características do Código Genético: -DEGENERADO: Um mesmo aminoácido pode ser codificado por mais de um Códon. Exceção: Triptofano e Metionina são codificados por apenas um códon. -‘’UNIVERSAL’’: Todas as espécies partilham de um mesmo Código Genético- Há exceções. *As exceções mais importantes à essa universalidade ocorrem nas mitocôndrias dos mamíferos, nas leveduras e em outras espécies -> UGA é um códon de término, mas de Triptofano. ->A Metionina interna é codificada por AUG e AUA. ->Nas mitocôndrias de mamíferos, AGA e AGG são códons de parada e não códons que codificam Arginina. OBS: Às vezes, um determinado tRNA pode reconhecer especificamente vários Códons. Essa capacidade decorre da oscilação da base na extremidade 5’ do Anticódon. OBS: Os códons de parada são lidos por proteínas específicas e não por moléculas especializadas de tRNA. OBS: O fato de qualquer um dos quatros nucleotídeos na terceira posição especificar o mesmo aminoácido pode ter evoluído como um mecanismo de segurança, para minimizar os erros de leitura de tais Códons. Traducao Ocorre em três etapas: -Iniciação: Ligação do ribossomo ao mRNA ligação do primeiro tRNA. -Alongamento: Translocação do ribossomo e formação de todas as ligações peptídicas. -Terminação: Liberação da cadeia polipeptídica, dissociação do ribossomo ao mRNA. A região codificadora de proteína do RNA mensageiro consiste em uma série ordenada de unidades de três nucleotídeos chamados de Códons, que especificam a ordem dos aminoácidos. Principais participantes: -TIPOS DE RNA: rRNA- Forma Ribossomos (Maquinaria de síntese de proteínas) tRNA- Leva aminoácidos corretos até o Ribossomo. mRNA- Especifica a sequência correta de aminoácidos na Proteína. -RNA TRANSPORTADOR: *Quando o RNA transportador está carregando o aminoácido é chamado de AMINOACIL tRNA. *Extremidade 3’- Ligação com o aminoácido (Haste receptora). *Não apresenta cap5’ e cauda poli-A Rna pol 1 e 3 não apresentam cauda. *Cada tRNA tem 2 sítios importantes: ANTICÓDON E SÍTIO DE LIGAÇÃO COM AMINOÁCIDO *Cada Aminoácido é trazido ao ribossomo por uma molécula específica de RNA t que se pareia a um códon do RNAm. União do tRNA com o Aminoácido: *AMINOACIL- tRNA SINTETASE- Responsável por acoplar os aminoácidos aos seus tRNA específicos, que reconhecem o Códon apropriado (Ela apresenta sítios de ligação para o ATP, Aminoácido e RNAt). Além disso, apresenta o sítio de edição, para se evitar o erro de acoplamento. *Quebra-se ATP e libera dois fosfatos inorgânicos; Formando o adenosina monofosfato (AMP). GENÉTICA LUIZA LOPES CARVALHO *União entre o nucleotídeo monofosfatado ao aminoácidoAMINOÁCIDO ADENILADO. *Posteriormente cliva-se a ligação do AMP com o aminoácido- Liga-se o aminoácido a extremidade 3’do tRNA. OBS: Cada um dos 20 aminoácidos é ligado ao tRNA apropriado por uma única tRNA Sintetase específica. OBS: O Ribossomo aceita ‘’cegamente’’ qualquer tRNA carregado que possua uma interação correta entre códon e anti-códon, contendo ou não o aminoácido correto- Importância da Aminoacil- tRNA Sintetase. -RIBOSSOMOS *Coordena o correto reconhecimento do mRNA por cada um dos tRNA e catalisa a formação de ligações peptídicas. *Diversas proteínas associadas a Rna’s ribossomais. *Nucléolo: Produtor de ribossomos. *Dois tipos: Ribossomo 70s (procariontes e mitocôndrias) e 80s (eucariontes). ‘’S’’- Coeficiente de sedimentação. Subunidade maior: 50s (procariontes) e 60s (eucariontes). Contém o Centro da Peptidiltransferase- Formação da ligação peptídica. Subunidade menor: 30s (procariontes) e 40s (eucariontes). Contém o Centro de decodificação. *Apresenta 3 Sítios: A, P e E A: Aminoacil- tRNA P: Peptidil- tRNA (apresencadeia polipeptídica nascente) E: EXIT; RNA t não está transportando nada (Cada sítio de ligação é formado na interface entre as subunidades maiores e menores) Tradução em Procariontes: INICIAÇÃO: Reconhecimento do Códon de início por parte do Ribossomo: SEQUÊNCIA DE SHINE-DALGARNO É complementar a uma sequência localizada próxima à extremidade 3’ de um dos componentes do Ribossomo (RNA ribossomal 16s). Três fatores de início: IF1, IF2 e IF3 -IF1: Evita que os tRNAs se liguem à porção da subunidade menor que fará parte do sítio A. -IF2: É uma GTPase (proteína que se liga e hidrolisa GTP) -IF3: Associa-se à subunidade menor ao fim de um ciclo de tradução, auxiliando na dissociação do ribossomo 70s em suas subunidades maior e menor. O início da tradução é o único momento em que um tRNA se liga ao Sítio P sem ocupar previamente o Sítio A- Aminoacil- tRNA que transforma Metionina Formilada, o qual carrega o primeiro aminoácido: N- formil metionina. A subunidade maior só se associa à menor no fim do processo de início, imediatamente antes da formação da primeira ligação peptídica- Última etapa do Início. ETAPAS DA INICIAÇÃO: -IF3 se liga a Subunidade menor do ribossomo -Começa a procurar pelo primeiro a AUG- Início. -Aminoacil- tRNA transportando a Metionina Formilada sendo reconhecido pelo IF2, o qual conduz o Aminoacil até a Subunidade menor do Ribossomo. -Ocorre o Pareamento (Sítio P); GTP é quebrado— Recruta a Subunidade maior--- Forma-se o complexo traducional. -Saem os IF2 e IF3. OBS: RNA m policistrônico--- Cada AUG de início apresenta uma sequência de Shine-Delgarno diferente. ETAPAS DA ELONGAÇÃO: -EF-Tu: TEM GTP LIGADO A ELE *Auxilia a entrada do Aminoacil-tRNA no sítio A ->Liga-se a GTP e ao RNAT ->Controla se é o aminoacil t RNA correto (Reconhece o Pareamento) ->GTP é quebrado e ativa a ligação do aminoacil t RNA no sítio A e EF-Tu é liberado. -EF-Ts: Auxilia a ligação EF-TU-GDP do ribossomo e a regeneração de EF-Tu-GTP; Interação com o GTP -Ação da PEPTIDIL TRANSFERASE, após a saída do EF- Tu por conta da hidrólise de GTP. -Chega o EF-G e se liga ao complexo ribossomal (avalia se está tudo correto-- AÇÃO DE REPARO); GTP hidrolisado que antes estava ligado ao EF-G Promove a Translocação do ribossomo GENÉTICA LUIZA LOPES CARVALHO TERMINAÇÃO: - 3 códons de término: UAG, UAA e UGA *Não são reconhecidas por um RNAt, mas por fatores de liberação (proteicos) RF1- Reconhece as trincas UAA e UAG RF2 -Reconhece as trincas UAA e UGA RF3-Ajuda a catalisar o término da cadeia, não reconhece códons de parada. Tradução em Eucariontes: INICIAÇÃO: Sem Shine- Dalgarno: Diferença significativa entre os dois sistemas de tradução. Os mRNA eucarióticos recrutam os ribossomos por meio de uma modificação química chamada de CAP 5’, localizada na extremidade 5’ do mRNA. Uma vez ligado ao mRNA, o ribossomo desloca-se na direção 5’->3’, até encontrar um códonde início (AUG)- Rastreamento. 5 fatores de iniciação (eIF’s)- Garantem o perfeito encaixe. ETAPAS: -eIF2 ligado ao GTP- Garante a ligação do Aminoacil tRNA ao Sítio P da subunidade menor (1) -Antes do RNAm ser transportado ao Citoplasma os fatores eIF4 e eIF4G se ligaram ao CAP5’ (2) -Há o reconhecimento do complexo 1 com o complexo 2; Ou seja, o complexo 1 reconheceu o complexo 2 a partir da intermediação de fatores adicionais de tradução. -O ATP é hidrolisado, a partir disso o tRNA se move sobre o mRNA buscando o primeiro AUG (primeiro AUG após o CAP). -Ao ocorrer o pareamento, o GTP associado ao fator de iniciação 2 é hidrolisado. -Outros fatores se dissociam e recrutam a subunidade maior do ribossomo. PEPTIDIL TRANSFERASE- Cliva a ligação da Metionina com RNA t especial e sintetiza a ligação peptídica entre a metionina e o próximo aminoácido trazido por outro tRNA. OBS: Sítio A e E nunca estão simultaneamente ocupados. ELONGAÇÃO: -Uma vez formado o Ribossomo com o tRNA iniciador carregado no sítio P, a síntese polipeptídica pode iniciar. Existem três eventos importantes que precisam ocorrer para a adição correta de cada aminoácido. Primeiro, o Aminoacil- tRNA correto é trazido ao A do Ribossomo, de acordo com o Códon que está nesse sítio. Segundo, uma ligação peptídica é formada entre o Aminoacil- tRNA no sítio A e a cadeia polipeptídica ligada ao Peptidil- tRNA no Sítio P. Esta reação da Peptidiltransferase resulta na transferência do polipeptídeo crescente do tRNA no sítio P para o aminoácido do tRNA carregado no sítio A. Terceiro, o peptidil- tRNA resultante do sítio A e seu códon associado devem ser translocados para o sítio P, para que o Ribossomo esteja preparado para outro ciclo de reconhecimento de códon e formação de ligação peptídica. TERMINAÇÃO: -eRF: Reconhece todos os 3 códons de parada. GENÉTICA LUIZA LOPES CARVALHO
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