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Funções dos nucleotídeos: participam da sinalização celular, atuando como elo químico essencial na resposta das células aos hormônios e outros estímulos extracelulares. Ex. cAMP; atuam como moeda energética Ex: ATP, UTP, CTP, TTP e GTP; são constituintes dos ácidos nucleicos: o DNA-desoxirribonucleotídeo e o RNA-ribonucleotídeo. Gene: segmento de DNA que contém a informação necessária para a síntese de um produto biológico funcional. Exemplo: proteína. Estrutura dos nucleotídeos Um nucleotídeo é formado por um fosfato, uma pentose (ribose ou desoxirribose) e uma base nitrogenada. Carbonos da pentose • 1: ligação glicosídica com a base nitrogenada; • 5: ligação éster com o fosfato; Ribonucleotídeos e Desoxirribonucleotídeos Ribonucleotídeos: são formados por um fosfato, uma pentose (ribose) e uma base nitrogenada. Sua terminação é ‘ATO’ e também pode ser chamada de ‘INA + 5’monofosfato’. Ribonucleosídeos: são formados por uma pentose (ribose) e uma base nitrogenada. A terminação é ‘INA’. Desoxirribonucleotídeos: são formados por um fosfato, uma pentose (desoxirribose) e uma base nitrogenada. A terminação é ‘ATO’ ou ‘DESOXI + base nitrogenada + INA + 5’monofosfato’ Desoxirribonucleosídeos: são formados por uma pentose (desoxirribose) e uma base nitrogenada. A terminação é ‘INA’. Bases nitrogenadas Polimerização Como as ligações fosfodiéster (covalentes) são formadas sempre partindo do carbono 5’ para o 3’, a hidroxila (OH) do carbono 3 vai receber um grupamento fosfato. E, quando isso ocorrer, vai liberar energia (anabolismo). As bases nitrogenadas sempre estarão voltadas para o lado interno da molécula. Características dos ácidos nucléicos A hidroxila (OH) das pentoses formam pontes de hidrogênio com a água. As cargas negativas dos fosfatos são neutralizadas por interações iônicas cm cargas positivas das proteínas ou íons metálicos. Extremidades: • 5’: é aquela que não possui nucleotídeo na posição 5’ • 3’: é aquela que não possui nucleotídeo na posição 3’ Bases nitrogenadas: • Adenina e Timina/Uracila: 2 ligações de hidrogênio • Citosina e Guanina: 3 ligações de hidrogênio Ponto importante: as ligações de hidrogênio fazem o pareamento das bases e as de Van de Waals ou dipolo-dipolo (ajuda a minimizar o contato das bases como a água, são importantes na estabilidade estrutural tridimensional dos ácidos nucleicos) fazem o empilhamento para estabilizar as bases. As ligações de hidrogênio entre as bases permitem uma associação complementar de duas fitas de DNA, ou de uma fita simples de RNA com o DNA (durante a replicação do DNA). Formas tridimensionais do DNA Forma A: hélice para a direita, 1 volta compreende 11 bases nitrogenadas. Mais larga. Situações de desidratação de DNA; Forma B: hélice para a direita, 1 volta compreende 10,5 bases nitrogenadas. DNA de Watson-Crick. Forma mais estável. Forma Z: hélice para a esquerda, 1 volta compreende 12 bases nitrogenadas. Mais delgada. Presente em pequenos trechos do DNA B (função incerta). Cada espécie de DNA possui uma temperatura de desnaturação característica; ocorre geralmente em torno dos 80ºC, as ligações de hidrogênio se romperão e a molécula ficará de forma aleatória • O DNA é uma substância viscosa a temperatura ambiente, mas variações de pH e temperatura, muito bruscas, farão com que ele mude a sua forma. • Quanto maior seu conteúdo de pares de bases GΞC, maior será a temperatura de desnaturação; quanto menor seu conteúdo de pares de bases A=T menor será sua temperatura de desnaturação. Replicação do DNA (um processo semiconservativo) Enzima responsável pelo processo: DNA polimerase. Cada fita mãe atua como molde para guiar a síntese das fitas filhas. As fitas são antiparalelas, não são idênticas nem na composição nem na sequência de bases. Na verdade, elas são complementares entre si. A composição das bases do DNA geralmente varia de uma espécie para outra. DNA provenientes de diferentes tipos celulares apresentam sempre a mesma composição de bases. A composição de bases não se altera com a idade do organismo, estado nutricional ou modificação ambiental. Em todos os DNA’s celulares, o número de resíduos de Adenina é o mesmo que o de Timina, e o de Citosina é o mesmo que Guanina. Logo, podemos afirmar que A+C=G+T. Estrutura do RNA São moléculas poliméricas não ramificadas, compostas de nucleosídeos monofosfatados unidos por ligações fosfodiéster. São moléculas menores que o DNA, contém ribose ao invés da desoxirribose e uracila no lugar da Timina. É uma fita simples capaz de se dobrar de forma complexa. Entre os RNA’s também há diferença quanto a função, tamanho e modificações estruturais especiais. • RNA mensageiro: intermediários que transportam a informação genética de um gene até o ribossomo; • RNA transportador: moléculas adaptadoras que participam da transferência de aminoácidos. • RNA ribossômico: componente estrutural dos ribossomos (síntese de proteínas). Hibridização Capacidade de duas fitas complementares de DNA de parear uma com a outra. Possibilita a detecção de sequências de DNA semelhantes em duas espécies diferentes ou em uma única espécie. Ocorre hibridização dos pais para formar os filhos. Desaminação e depurinação Desaminação: é o nome dado a perda de anéis púricos ou pirimídicos, podendo ser permanente quando as enzimas de reparo não dão conta; toda a uracila que aparecer no DNA, significa que a citosina perdeu um grupamento amina. Depurinação: é o nome dado a saída da base nitrogenada, formando, assim, açúcar com o fosfato; esse processo é mais rápido e mais comum ocorrer em purinas do que nas pirimídicas. O DNA também pode ser danificado por reagentes químicos introduzidos no ambiente como produtos da atividade industrial. Duas classes proeminentes de tais agentes são: agentes desaminantes, particularmente o ácido nitroso ou compostos que podem ser metabolizados em ácido nitroso ou nitritos e agentes alquilantes. • Os agentes alquilantes podem alterar certas bases do DNA Danos ao DNA O ácido nitroso, formado a partir de precursores orgânicos, como nitrosaminas, e de nitrito e sais de nitrato, é um reagente potente que acelera a desaminação das bases descritas anteriormente. As células possuem um elaborado sistema de defesa para destruir essas espécies reativas, incluindo enzimas como catalase e a superóxido dismutase, que convertem a espécie reativa do oxigênio em produtos inócuos. O ácido nitroso é muito tóxico para o organismo, que leva a alterações de DNA. O nitrito é encontrado em embutidos como no salame, salsicha, mortadela que lhes confere uma coloração rosada. Além do seu papel como subunidade dos ácidos nucléicos, os nucleotídeos possuem uma variedade de outras funções em cada célula: como transportador de energia, componentes de cofatores enzimáticos e mensageiros químicos. A hidrólise dos nucleosídeos trifosfato fornece a energia química para direcionar uma grande variedade de reações bioquímicas. O ATP é de longe o mais largamente usado para esse propósito, ele é a moeda energética da célula, mas o UTP, o GTP e o CTP são também usados em algumas reações. • Os sistemas evoluíram para sintetizar ATP em maior abundância. DNA e RNA Pentose: Desoxirribose; Função: Armazenar e transmitir a informação genética; Bases nitrogenadas: A=T e CΞG; Hélice: Dupla-hélice; Tamanho: Maior; Propriedades: Polímero; Esqueleto: Hidrofílico; Pentose: Ribose; Função: Transportar aminoácidos e produzir proteínas; Bases nitrogenadas: A=U e CΞG; Hélice: Hélice simples; Tamanho: Menor; Propriedades: Polímero; Esqueleto: Hidrofílico;
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