QUESTÕES- BIOLOGIA MOLECULAR

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QUESTÕES- BIOLOGIA MOLECULAR
01. Descreva como acontece a transcrição na célula procarionte.
Iniciação: primeiro acontece a montagem do complexo de iniciação, RNA polimerase + fator
Sigma, o fator Sigma varrer a o DNA a procura da sequência promotor, arranhar pô se liga
fortemente ao promotor e abre a dupla hélice do DNA desenrolando a fita;
Alongamento: agora acontece a liberação da RNA pol do promotor, a fita híbrida (recebe esse
nome porque é formada de DNA e RNA pareados rapidamente) de DNA e RNA é sintetizada,
por fim o Reino é removido e o DNA reestruturado.
Terminação: reconhecimento do sítio determinação e a liberação do DNA e RNA. Na ponta
do RNA faz-se uma espécie de grampo que serve para proteção para que ele não se degrade,
indica que o RNA foi finalizado e que o processo de transcrição acabou.
02. Descreva como acontece a transcrição na célula eucarionte.
A RNA pol II necessito de fatores gerais de transcrição: posicionamento correto da
polimerase, a TFIID reconhece o promotor (TATA box) e o TFIIB liga ao fator TFIID para
fazer o posicionamento correto; Auxilia na sequência da dupla fita do DNA, a TFIIH vai
dupla fita e fazer liberação da RNA pol II do promotor.
A RNA pol também necessitam de proteínas modificadores de cromatina que possibilita o
acesso do DNA e facilita a montagem da maquinaria de iniciação da transcrição sobre o
DNA, além de precisar das proteínas modificadores e mediadores que atraem a polimerase
para o ponto inicial da transcrição.
Iniciação: RNA pol vai se ligar a todos os fatores gerais. Reconhecimento da TATA Box pelo
TFIID, abertura da dupla fita de DNA feita TFIIH pelo e a formação da bolha.
Alongamento: acontece a liberação dos fatores e logo em seguida a liberação do promotor, a
poesia isso acontece associação dos fatores de extensão e a extensão do transcrito de DNA
(síntese);
Terminação: reconhecimento das sequências de terminação, formação do campo, liberação do
RNA e liberação da RNA Pol.
03. Cite os tipos de reparo do DNA e descreva cada um deles.
Atividade exonucleotídica do DNA polimerase: adição de nucleotídeos errados muda a
geometria da molécula, então polimerase vai e verifica a geometria exata do pareamento de
bases antes de adicionar um novo nucleotídeo, a remoção catalítica do nucleotídeo pareado é
realmente acontece no sentido 3'-5';
Sistema MutS/MutL: esse tipo de reparar acontece pós síntese da cadeia de DNA, a proteína
MutS detecta o potencial de distorção da hélice DNA, se liga a fita de DNA e vai deslizando e
conferindo se está tudo certo caso esteja errado elas detecta esta alteração e se comunicam
com a MutL, que a proteína que promove a degradação da fita de DNA, remover no
pareamento errado, após isso ela chama polimerase para fazer o reparo;
Excisão de bases- DNA glicosilase: faz o reconhecimento da alteração específica da base, a
DNA glicosilase remove a base do nucleotídeo e AP endonuclease reconhece a lesão e
remove nucleotídeo, após isso a DNA polimerase adiciona um novo nucleotídeo. Esse é um
reparo pontual onde só é removido a base diferente do sistema MutS/MutL que remove o
fragmento inteiro;
Excisão de nucleotídeos: um complexo multienzimático verifica e remove distorções na
dupla hélice, nesse tipo de reparo se remove nucleotídeo inteiro, diferente do reparo excisão
de base que remove apenas a base nitrogenada. O complexo enzimático vai correr sobre o
DNA e verificar as alterações (dímeros) e vai remover essas alterações, aí ele casa e vai abrir
as fitas, a polimerase vai sintetizar nova fita e a glicose vai unir a fita nova a fita velha.
Quebra na fita dupla de DNA: relacionado à exposição a radiação, agentes oxidantes e
outros. Ocorre a junção de extremidades não homólogas ou homólogas quebradas, as fitas são
vão se sobrepor e se ligar em regiões homólogas (iguais) ou não homólogas, age como um
remendo para que não aconteça a perda da molécula de DNA inteira.
04. O que é e qual é a função do miRNA?
É um rna pequeno com 22 nucleotídeos seguidos e não são codificantes, mas conseguem se
ligar a outra sequência de mRNA mensageiro, assim consegue silenciar ou regular o mRNa.
Silenciamento pós transcricional ou regulação gênica.
05. Como acontece o capeamento da extremidade 5’ do mRNA?
O capeamento da extremidade 5' é adição de alguma guanina modificada chamada de guepe
na extremidade 5'. Se inicia com adição GMP na extremidade 5' feita pela Guaniltransferase,
após isso a fosfatase remove o fosfato da extremidade 5', a metiltransferase vai e adiciona um
grupo metil e uma guanosina no lugar onde foi retirado o fosfato.
06. Qual é a função do capeamento da extremidade 5’?
Proteção contra ribonucleases, direcionamento- exportação para o citosol- e é bastante
importante para o início da tradução.
07. Como acontece a adição da cauda poli A na extremidade 3’ ?
Também chamada de poliadenilação, os fatores CstF e CPSF se ligam a sequência específica
sobre o RNA em formação, as outras proteínas se associam aos fatores e clivam RNA,
produzindo uma extremidade, essa é adicionado uma adenosina pela poliadeneato- polimerase
(PAP) e assim as proteínas de ligação a poli A determinam o fim da cauda na extremidade 3'.
08. Após o reparo do DNA, algumas proteínas ainda podem permanecer defeituosas ou
até mesmo mal enoveladas. Explique detalhadamente o destino de uma proteína mal
enovelada dentro da célula.
Quando uma proteína está na mal enovelada ela será corrigida pela chaperonas, as chaperonas
auxiliam no dobramento das proteínas, ela vai reconhecer os erros de enovelamento pela a
exposição dos aminoácidos hidrofóbicos e vai retirar a proteína errada e guardar dentro da
molécula e fazer o reparo do enovelamento, as principais famílias de chaperona que atua
nesse processo é a Família hpSp 60 quem reconhece as proteínas que já foram processadas
durante o processo pós-traducional e vai passar pelo complexo de golgi e depois é corrigida, e
a família hpSp 70 que vai fazer a correção antes do processo de pós tradução e não passa pelo
complexo de golgi. Mas se caso as chaperonas não reconhecerem o erro essas proteínas
podem ter dois caminhos, elas podem ser direcionadas a degradação em proteossomos, que
são várias proteínas que formam uma espécie de enzima- protease, uma enzima que destrói
proteínas, eles reconhecem proteínas mal enovelada pela marcação que elas sofrem chamada
de ubiquitina, ou se caso as proteínas não sejam degradadas elas vão ficar na célula
provocando um acúmulo de proteínas mal enoveladas que causar a doenças.