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SUSANA FIGUEIREDO UFC DOGMA CENTRAL RNA – VISÃO GERAL » Hidroxila na posição ´da aldopentose » Uracila no lugar da timina » Fita simples: maior versatilidade de funções » Função no armazenamento e transmissão da informação e na catálise (ribozima) TRANSCRIÇÃO » A informação genética de um segmento de DNA será usada para a síntese de uma fita de RNA, com uma sequência de bases complementar a uma das fitas de DNA » Envolve apenas segmentos limitados do DNA: Restrição da expressão da informação genética » Componentes do processo transcricional: • Molde • RNA polimerase • Ribonucleotídeos 5´-trifosfato » Somatório de todas as moléculas de RNA produzidas: transcriptoma » A transcrição não necessita de um iniciador » Sentido da transcrição 5´→ 3´ ETAPAS GERAIS DA TRANSCRIÇÃO » Iniciação » Alongamento » Terminação RNA POLIMERASE » Requer um molde de DNA e os ribonucleosídeos- trifosfatos » Requer íons Mg +2 ou Zn +2 » Não requer iniciador/primer » A transcrição é iniciada quando há interação com promotores TRANSCRIÇÃO PELA RNA-POLIMERASE » O mecanismo da reação RNA-polimerase é muito parecido ao da DNA-polimerase » Mecanismo catalítico da síntese de RNA pela RNA-polimerase. É essencialmente o mesmo mecanismo usado pelas DNA-polimerases » A reação envolve dois ions de Mg2+, coordenados para os grupos fosfato dos nucleosídeos trifosfatos (NTP) que chegam e para três residuos Asp, que são altamente conservados nas RNA-polimerases de todas as espécies » Um íon Mg2+ facilita o ataque pelo grupo hidroxila 3´no fosfato alfa do NTP » O outro ion Mg2+ facilita o deslocamento do pirofosfato » Ambos os ions metálicos estabilizam o estado de transição pentacovalente » Cerca de 17 pares de bases são desenrolados a cada momento » A RNA-polimerase e a bolha de transcrição movem-se da esquerda para a direita ao longo do DNA, facilitando a síntese de RNA » O DNA é desenrolado à frente e enrolado novamente à medida que o RNA é transcrito » À medida que o DNA é enrolado novamente, o híbrido RNA-DNA é deslocado e a fita de RNA expulsa » O movimento de uma RNA-polimerase ao longo do DNA tende a criar superespirais positivas (DNA superespiralados) à frente da bolha de transcrição e superespirais negativas (DNA superdesespiralizado) antes dela » A RNA-polimerase está em contato estreito com o DNA à frente da bolha de transcrição, bem como com as fitas separadas de DNA e RNA no interior e imediatamente antes da bolha » Um canal nas proteínas canaliza novos NTP para o sítio ativo da polimerase » O footprint da polimerase envolve cerca de 35 pb de DNA durante o alongamento » Velocidade de alongamento: 50 a 90 nucleotídeos FITA MOLDE E NÃO MOLDE » Fita não-molde (fita codificante): • Fita complementar à fita molde • Será idêntica ao RNA sintetizado, com U ao invés de T • Pode estar presente em qualquer uma das fitas de um dado cromossomo » Fita molde: • Servirá de molde, modelo PROMOTORES » Local específico no DNA onde as RNA- polimerases se ligam para que seja iniciada a transcrição » Determina o ponto onde deve ser iniciada a transcrição, mas ele próprio não é transcrito » Diferentes promotores, similaridade de sequencia » Em E.coli: regiões -70 e +30 do local de início da transcrição » Diferentes promotores com similaridade de sequência » Regiões -10 e -35 e elemento UP em E.coli » Elemento UP (upstream promotor): ocorre entre as sequencias -40 e -60 dos promotores de alguns genes » Está relacionado à subunidade alfa da RNA- polimerase, também de reconhecimento RNA POLIMERASE DE E.COLI » Bactérias: uma única polimerase » Não possuem um sítio ativo separado para edição 3´→ 5´ » Possibilidade de erros aumentada » Muitas moléculas de RNA são produzidas a partir de um mesmo gene. Após a tradução esse RNA será destruído. Caso haja erros de transcrição não haverá tantos danos à celula » Ela própria faz o papel de deselicoidizar e reelicoidizar o DNA » 40 nucleotídeos /s REGULAÇÃO DA TRANSCRIÇÃO » Qualquer etapa (iniciação, alongamento e terminação) » Ligação de proteínas (próximas ou distantes do promotor) podem ativar ou reprimir a transcrição » Mecanismos de regulação da transcrição fazem parte da regulação da própria síntese de proteína TERMINAÇÃO » Sinais independentes de p (proteina rho): • Formação de grampo • Presença de tres pares AU na extremidade 3´do grampo » Sinais dependentes de p: TRANSCRIÇÃO EM EUCARIOTOS » RNA polimerase I • Síntese de RNA pré-ribossomal (pré-RNAr) que são precursores dos RNA ribossomais (18S,5,8S e 28S) • Os promotores para a síntese dessa polimerase possuem sequencias bastante diversificadas entre as espécies »RNA polimerase II • Síntese do RNAm e de outros RNAs especializados • Reconhecem milhares de promotores »RNA polimerase III • Síntese do RNAt, RNAr 5S e RNAs INIBIDORES DA TRANSCRIÇÃO » Actinomicina D (Euc e Proc) e acridina: • Inserção entre C ≡ G • Deformidade do DNA, impedindo o movimento da RNA polimerase (fase de alongamento) » Rifampicina (Proc): • Inibe a síntese de RNA bacteriano ligando-se à subunidade beta da RNA polimerase • Bloqueia o início da transcrição » Amanitina do cogumelo Amanita phalloides: • Bloqueio da Pol II e III em células animais PROCESSAMENTO DO RNA » Ocorre tanto em procariotos quanto eucariotos » Ribizimas: moléculas de RNAs que atuam como enzimas nessas reações de processamento » Processo mais evidente em RNAm de eucariotos e em RNAt de eucariotos e procariotos » Splicing » Adição do capacete 5´: • Resíduo de 7-metilguanosina ligado ao resíduo 5´terminal do RNAm • Funções: o Proteger o RNAm de ribonucleases o Ligar-se ao complexo de proteínas ligadoras de capacete a fim de participar da ligação do RNAm ao ribossomo para iniciar a tradução » Adição da cauda poliA: • Funções: o Coordenação da transcrição e tradução o Proteçao do RNAm TRANSCRIÇÃO REVERSA
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