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Bases celulares e moleculares 2 Organização genômica Procarionte x Eucarionte: Eles se diferem pela presença de carioteca (envoltório nuclear). . DNA: Duas longas cadeias polipeptídicas; Subunidade de nucleotídeos = pentose-fosfato + base nitrogenada; Adenina, guanina, timina e citocina; Sentido da vida: 5’ – 3’; Ligação entre nucleotídeos = glicosídica. Ligação entre fitas = de hidrogênio. RNA: Ácido ribonucleico – açúcar ribose; Geralmente é unifilamentar; Contém a base uracila no lugar da timina; Carregador momentâneo de instruções moleculares – transcrição. RNA mensageiro (RNAm): contêm informação genética para síntese de proteína; RNA ribossômico (RNAr): constituinte estrutural e catalítico do ribossomo (faz parte da sua estrutura), atuando na síntese proteica; RNA transportador (RNAt): transporta aminoácidos do citoplasma para o RNAm nos ribossomos, durante a tradução. Pequenos RNAs nucleares (snRNA): participam do processo de recomposição do RNAm, splicing. roRNA, curto RNA de interferência (siRNA), RNAs longos não codificadores (IncRNA): são importantes na regulação da expressão gênica e na inibição da atividade de elementos de transposição. Compactação do DNA: Aproximadamente 2 m de DNA; Distribuídos em 46 cromossomos; Aproximadamente 20.000 genes; Cromatina = DNA + proteínas associadas. (histonas e proteínas cromossômicas não histonas). OBS: -- Heterocromatina: forma altamente condensada da cromatina. -- Eucromatina: forma mais relaxada da cromatina. Genoma: Sequência de DNA de todos os cromossomos e mitocôndrias. Gene: sequência completa de ácidos nucleicos necessários para a síntese de um produto gênico funcional (polipeptídios ou RNA). O genoma humano fica entre o genoma nuclear e o mitocondrial. Forms de treino: Texto 9 – USP – Aspectos da complexidade dos genomas. Quantidade de material genético: A quantidade de DNA existente nos núcleos das células de eucariotos foi uma das primeiras características estudas do material genético, e era medida pela citofotometria. Através dessa técnica, foi possível verificar que o tamanho do genoma é constante para cada espécie em particular. A quantidade de DNA no genoma é o valor C. O valor C não exprime uma relação direta com o grau de complexidade do organismo, normalmente os eucariontes possuem o valor maior, mas existem exceções. O genoma humano tem cerca de 53% do DNA repetitivo. Densidade do gene: Nos organismos multicelulares, entre 25-50% dos genes que codificam proteínas ocorrem uma única vez no genoma e por isso são chamados genes solitários ou de cópia única. Os demais genes pertencem à famílias, que reúnem dois ou mais genes similares. Um conjunto de genes que surge a partir da duplicação de uma gene ancestral e que produz proteínas com sequências de aminoácidos parecidas constitui uma família gênica. Pseudogene: gene que devido à mutações foi inativado ou possui baixa atividade em relação à transcrição e à tradução. Genes repetitivos em tandem: Genes que codificam histonas, RNAs ribossômicos e RNAs transportadores ocorrem em arranjos de sequências repetidas em tandem, ou seja, as cópias repetidas são adjacentes e em mesma orientação. DNA satélite: consistem em um segmento de DNA relativamente simples, curto e altamente repetitivo, que se difere do resto do DNA pela composição de bases. Correspondem de 5 a 10% do genoma total. Um dos componentes principais da heterocromatina. Sabe-se pouco sobre sua função. Centrômeros: estrutura do cromossomo, constituída por DNA e proteínas, altamente diferenciada e que exerce várias funções relacionadas à mitose. O DNA centromérico está arranjado em nucleossomos. Telômeros: estruturas formadas por DNA repetitivo e proteínas, estão presentes nas extremidades dos cromossomos de organismos eucarióticos. São parte essencial dos cromossomos, por protege-os da degradação. VNTRs: minissatélites e microssatélites: o nome se dá pois o número de cópias de cada unidade de repetição varia muito entre indivíduos de uma mesma população, caracterizando polimorfismo genético. São utilizados em identificação individual, testes de paternidade e estudos de mapeamento genético. DNAs repetitivos dispersos – móveis: São elementos infiltrados no genoma, que possuem capacidade de proliferação independente em relação ao resto do genoma. “DNA parasita” ou móvel. Elementos de inserção: sequência que podem mudar de posição no cromossomo, gerando interrupção da sequência codificadora. Transposons: são maiores que os elementos de inserção e contêm um ou mais genes que codificam proteínas, eles são indispensáveis para a mobilização do elemento. Elementos semelhantes a retrovírus: são fraquelas por longas repetições terminais diretas, as LTRs, de long terminal repeats, eles se mobilizam por retrotransposição e são capazes de codificar uma transcriptase reversa. Long Interspersed Elements – LINEs: ele não possui LTRs, mas apresenta sequencias codificadoras de proteínas com alta homologia com transcriptase reversa, sendo assim, ele pode realizar a retrotransposição. Existem alguma evidências de que esse elemento seria responsável por algumas mutações relacionadas a doenças hereditárias como distrofia muscular e hemofilia. Short Interspersed elements – SINEs: é cerca de 10% do genoma humano (sequência Alu), há casos de doenças hereditárias causadas pela inserção de um elemento Alu em genes funcionais. Todo o DNA restante, presente nos genomas dos organismos e que não podem ser classificados em nenhuma dessas categorias é nomeado de DNA espaçador. Só que existe muitas estruturas e funções ainda desconhecidas no meio dessa classificação, então isso pode mudar. Resumindo: Tandem: um seguido do outro, lado a lado, um grudadinho no outro. Projeto genoma: Quase metade do genoma humano consiste de sequência repetitivas, e a maior parte delas, cerca de 45% do total, são derivados de sequências relacionadas aos elementos de transposição. A maior parte do conteúdo repetitivo do nosso genoma é representada por elementos móveis que já perderam a capacidade de se mover. Apenas dois tipos ainda são capazes de mobilização: as sequência Alu e o elemento LINE, que juntos representam 60% do DNA repetitivo do nosso genoma. Surpreendentemente, cerca de um milhão de cópias de Alu devem estar presentes no genoma humano. Gabriela Domingues Werner
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