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BCM 1 - Prof: Micheli @medbyrafap 26/08/2021 Aminoácidos bioquímica Questões Norteadoras: 1. Quais os grupos ion izáveis dos aminoácidos? 2. Definir pKa. 3. Qual forma molecular é predominante quando o pH do meio é igual ao pka? E quando o pH < pka? E quando pH > pka? 4. Definir ponto isoelétrico de um aminoácido. 5. E s c r e v e r a s f o r m a s i ô n i c a s predominantes da glicina e suas cargas líquidas em pH 1; pH 2,34; pH 7,0; pH 9,76 e pH 12. 6. Qual característica encontrada nos aminoácidos permite que essas moléculas atuem como um tampão? 7. Qual a importância bioquímica da ionização dos aminoácidos? Assunto: Ionização, pKa e eletroforese: - pH do meio influencia na forma do aminoácido pKa = vai influenciar na forma como esse aminoácido vai enfrentar o meio. Terá uma forma predominante. - Aminoácidos tem 2 grupos funcionais: amina e carboxila (grupos ionizáveis, ou seja, capazes de ter cargas). - Todos os 20 aminoácidos tem pelo menos 2 grupos ionizáveis. Tem-se o carboxila e o amina em todos eles. - Cadeia lateral também pode se ionizar em alguns aminoácidos, logo alguns deles eles - terão 3 grupos ionizáveis. - Variam de 2 a 3 grupos ionizáveis. - A ionização depende do pH do meio e do pKa dos grupos ionizáveis. Para o tampão ser bom é preciso que o pH dele fique perto do pKa, ou seja, a faixa de tamponamento pH + 1 = faixa de tamponamento máxima ou pH - 1 = valor mínimo. - Se ele vai se ionizar dependendo do pH e do pKa, as caracteristicas do aminoácido pode contribuir para bons tampões. Qual característica essencial para funcionar como tampão ? O que um bom tampão é? R: ácidos ou bases fracas, logo os aminoácidos funcionam como base ou ácido fraco. • 20 Aminoácidos, os quais são as unidades fundamentais das proteínas (polipeptideos, também são formadas de aa); • São L- aminoácidos (esquerda); • Apolares (hidrofóbicos)= se tiver só C e H; • Polares (hidrofílicos): sem carga, carga negativa e carga positiva; • Grupo R: varia em estrutura, tamanho e carga elétrica, o que afeta a SOLUBILIDADE de cada aminoácido. Define a polaridade e o grau de ionização. • Em pH fisiológico (7,2-7,4 neutro): grupos estão na forma ionizada; • Amino, carboxila, hidrogênio e uma cadeia lateral (R) • NH2 -> NH3+ • COOH -> COO- BCM 1 - Prof: Micheli @medbyrafap 26/08/2021 Características da forma zwitteriônica: Íons híbrido (forma Zwitteriônica), pois o pH do meio influencia e estimula uma auto protonação e desprotonação. Carga neutra, pois o + (mais) com o - (menos) anula. O que são ácidos e bases de acordo com Bronsted-Lowry? Ácidos = doam prótons se tornando base conjugada; Bases = recebem prótons se tornando ácido conjugado. OBS = hora podem doar, hora podem receber. O que é o Ka de um ácido? Qual a relação entre essa constante e a força do ácido? Ka = constante de acidez, a relação é que quanto maior Ka maior é a tendência de liberar H+, ou seja mais forte é o ácido. E, consequentemente, pH mais ácido (↓). Ka baixo, mais fraco é o ácido, menor a tendencia de liberar H+ e, assim, menos ácido é o meio, porém ainda sim ácido. E o pKa? O que significa esse valor e qual a relação entre o pKa de uma grupo ionizável e o pH do meio em ele se encontra? R: pKa = é a constante de acidez expressa pelo logaritmo negativo do Ka. pKa = - log Ka pKa informa a força do ácido, ou seja, se é forte ou fraco; O pKa é o valor de pH onde se tem 50% protonado (ácido) e 50% desprotonado (base conjugada). Um valor de pKa mais baixo indica um ácido mais forte. Ou seja, o valor mais baixo indica que o ácido se dissocia mais completamente na água. ↑Ka, mais forte é o ácido,↓pKa ↓Ka, mais fraco é o ácido, ↑ pKa Exemplo: BCM 1 - Prof: Micheli @medbyrafap 26/08/2021 Ácido acético Ka = 0,000176, pKa = 4,8 HCl Ka = 10 milhões, pKa = -7 Logo, percebe-se que o HCl é um ácido forte e o ác. acético é um ácido fraco, pois seu pKa é maior que o Ka. Aminoácidos são anfóteros (moléculas anfipróticas), ou seja, atuam como ácidos ou bases. Sendo assim, um bom tampão biológico. Grupo amino (NH3+) e grupo carboxila (COO-), podem sofrer protonações e desprotonações reversíveis, comportando-se como ácidos e bases fracos. • NH2 = base • COO- = ácido • Recebeu H+ = está protonado • Perdeu seu H+ = está desprotonado Depende do pH do meio e do pKa dos grupos ionizados para saber se esta neutro, protonado ou desprotonado. NH2 = base, pKa = alto 9,02-9,86 COOH = ácido, pKa = baixo 1,8-2,84 1 = Ácido 7= neutro 12 = alcalino "B" ao ser colocado no meio ácido agiu como base em "A", ou seja, recebeu H+ (protonado) no carboxila, devido ao pKa1 da carboxila = 2,34. É base e ácido conjugado, já que faz o processo inverso. A carboxila do meio “A” protonou (+1). “B” ao ser colocado no meio alcalino agiu como ácido no meio “C”, ou seja, doou H+ (desprotonou) do próton amino para o meio, o qual estava com pouco H+ (alcalino). É um ácido e uma base conjugada, já que faz o processo inverso. pH < pKa's = protonada (carga +1); caráter básico (pois recebe) pH > pKa's = desprotonada (carga -1); caráter ácido (pois doa) pH = pKa1 (2,34) = em relação ao COO- 50% na forma A (protonada) e 50% na forma B (desprotonada) pH = pKa2 (9,6) = em relação ao NH3+ 50% forma B (protonada) e 50% forma C (desprotonada) Conclusão: - Em meio ácido, os aminoácidos estão protonados (carga +1 ) . A forma zwitteriônica se comporta como base (recebe H+ no COO-); - Em meio neutro (pH fisiológico), o aminoácido se apresenta como um íon dipolar (neutro) de carga 0; - Em meio alcalino, os aminoácidos estão desprotonados (carga -1). A forma zwitteriônica se comporta como ácido (doa/perde H+ no NH3+). - Quem determina a forma predominante (protonada, desprotonada ou zwitteriônica) BCM 1 - Prof: Micheli @medbyrafap 26/08/2021 do aminoácido é o pH do meio e os pKa’s dos aminoácidos. - Quanto mais próximo o pH do tampão estiver do pKa, melhor a capacidade tamponante da solução tampão, ou seja, ele poderá resistir a variações no pH.. - pKa influencia em quantas faixas tampões OBS: Ionização da Glicina: Curva de titulação de aminoácidos (glicina): Pegaram os aminoácidos e colocaram eles numa solução acida para ser titularizados. Coloca a solução no erlenmeyer e em cima coloca a bureta com uma base. Aa e pH acido no pote e base na bureta, ou seja, colocou b a se n o me i o á c i d o p a r a v e r o comportamento do aa. Assim, viram que ele poderia sem um tampão. A curva passou a apresentar estágios distintos, revelando os pKas dos grupos ionizáveis, as regiões com poder de tamponamento e o pI. Tem 2 regiões de tamponamento, ou seja, precisa ser perto, no máximo uma unidade pra cima dos pKas ou uma unidade para baixo. Antes de por base o pH era ácido e quando foi colocando a base o pH foi subindo, ou seja, ficando menos ácido. Antes de chegar no ponto 1 o meio está BEM ácido e está abaixo do pKa 1, logo a forma protonada esta dominando (pois não precisa doar H+). No ponto 1 esta o Pka da carboxila = 2,34. É nesse ponto 1 onde está 50% da carboxila A (protonado) e 50% B (desprotonado). Ainda adicionando base no meio, depois que passa o pKa 1 da carboxila se tem mais quantidade na forma desprotonada, pois esta aumentando o pH levando ao neutro. Quando chega no ponto 2, chega-se no pI = ponto BCM 1 - Prof: Micheli @medbyrafap 26/08/2021 isoelétrico (pH onde eu tenho predominando o aminoácido na sua forma 100 % neutra = 5,97). Depois que passa do ponto 2, ainda adicionando base, chega no ponto 3, onde o pKa do grupo amino é 9,6, vai se ter nesse pH 50% na forma B (protonado) e 50% na forma C (desprotonado), desprotonando o grupo amina. Depois que passar o ponto 3 terá 100% na forma desprotonada. Obs: - Estudar a dissociação dos prótons de uma aminoácido em solução observando-se a variaçãodo pH do meio; - A curva de titulação corresponde a representação gráfica do comportamento anfótero dos aminoácidos e evidencia a atuação deles como tampões; - À medida que a base é adicionada, a curva passa a apresentar estágio distintos, revelando os pKas dos grupos ionizáveis, as regidos com poder de tamponamento e o pI (ponto isoelétrico). pI (ponto isoelétrico)= pH no qual a carga elétrica = 0 (zwitteríon) Glutanato: Tem 3 grupos disponíveis (amino, carboxila e carboxila na cadeia lateral). • pKa 1 = da carboxila do carbono α • pKR = pKa da carboxila lateral • pK2 = amino Abaixo do pK1 = protonada (carboxila e a cadeia lateral) pKa = 2,19. No pKR = 4,25 da carboxila lateral, metade da carboxila do lateral protonada e metade desprotonada. pK2 = amino metade protona e metade desprotonada. pI para 3 usa-se o pK1 + o pKR e divide por 2. Encontra a carga 0 e a carga +1. pI = 3,22. BCM 1 - Prof: Micheli @medbyrafap 26/08/2021 Obs: utiliza-se os pKas imediatamente anterior e posterior a forma neutra, pois quer determinar o pH onde a carga é zero, por isso, usa-se o pK1 + pKR = pI Histidina: pI pega o que está antes do neutro e depois, logo o pI é o pKr + pK2 Eletroforese: Método que vc pode usar para separar as proteínas, ou seja, pode ser separada pelo peso ou pela carga elétrica quando submetidas a um campo elétrico. Você aplica uma correntes elétrica, se o aminoácido possuir carga positiva (protonado) ele vai migrar para o lado negativo, e os aminoácido negativos (desprotonado) vão em direção ao polo positivo. Já os aminoácidos que estão neutros ficam no local de origem. • Por carga = vai em direção a carga oposta • Por peso = mais pesado fica mais em cima e o mais leve desce. Técnica focalização isoelétrico: - Usa-se o ponto isoeletrico = pI - Coloca-se uma mistura de proteínas numa fita de gel e aplica-se uma corrente elétrica. A proteína começa a migrar nessa fita que possui um gradiente de pH imobilizado. Assim, quando a proteína encontra o pH equivalente ao seu pI ela fica neutra e para. Ou seja, quando seu pH equivale ao pI é no ponto 0. Focalização isoelétrica: Junta a de focalização com a eletroforese, BCM 1 - Prof: Micheli @medbyrafap 26/08/2021 pega a fita de gel, onde separou os aminoácidos por pontos elétricos e acoplo ele na cuba onde aplica a carga elétrica do polo negativo pro polo positivo, dai os aminoácidos vão correr no gel e então os separa em cargas positivas e negativas. Sabendo-se que o pI para a glicina é 6,1, para qual eletrodo, positivo ou negativo, a glicina migrará quando submetida a um campo elétrico em pH 2,35? R: Onde na curva? pH = 2,35 Π = 6,1 pH = 0 Migra para o positivo, pois ele é negativo pq?