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Biologia Molecular Revisão → OS ÁCIDOS NUCLEICOS → Extração de DNA → Reação de Cadeia pela Polimerase - PCR → Eletroforese em Gel de Agarose → Real Time - PCR Termociclador: com sistema óptico composto por uma fonte de iluminação ultra-violeta e um detector de fluorescência + um computador com software próprio para a aquisição de dados → Polimorfismos Genéticos Tipos de polimorfismos genéticos: → Polimorfismo de nucleotídeo único (SNPs) → Polimorfismo de inserção e deleção (indels) → Polimorfismos de microssatélites (STR) → Polimorfismos de minissatélites (VNTR) → Polimorfismos de sítios de restrição (RFLP) Polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) Substituição de um ou outro par de bases em uma sequência específica do genoma. Polimorfismos de inserção e deleção (indels) Polimorfismos de STR (Short Tandem Repeats) – microssatélites. Consiste em trechos de DNA repetidos em “tandem” em um local específico no genoma. Repetições constituídas de 2 a 9 pares de bases. Polimorfismos de STR/microssatélites Polimorfismos de VNTR (Variable Number of Tandem Repeats) – minissatélites. São sequências que se repetem em “tandem” constituídas de 10 a 64 pares de bases. O número de repetições encontradas varia de um local para outro dentro do genoma, e também varia entre indivíduos. Polimorfismos de inversão Diferem em tamanho, podendo estar presentes em qualquer uma das duas orientações nos genomas de indivíduos diferentes. RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) Identifica a presença de polimorfismos no DNA dos indivíduos de uma população, utilizando enzimas de restrição São enzimas produzidas por bactérias para se defender de vírus Atuam como “tesouras moleculares” Por que as enzimas de restrição são “tesouras moleculares”? Elas identificam sequências de pares de bases específicas no DNA e cortam o DNA nesses pontos específicos → Método de Sanger: → Reagentes do sequenciamento: → DNA molde → Primer → Buffer save money – Mg2+ e Tris- HCl → dNTPs: Desoxinucleotídeos (dATP, dCTP, dGTP, dTTP) → Enzima Taq polimerase → ddNTPs: Didesoxinucleotídeos (ddATP, ddCTP, ddGTP, ddTTP); Etapas do sequenciamento: Desnaturação: 96°C – 2 minutos Anelamento: 50°C – 15 segundos Extensão: 60°C – 4 minutos Etapas do sequenciamento: Purificação – remoção dos nucleotídeos não incorporados Sequenciador automático – eletroforese capilar Análise do cromatograma (bioinformática) Piro sequenciamento Ação de 4 enzimas diferentes: DNA polimerase ATP sulfurilase Luciferase Apirase Substratos utilizados: Adenosina 5’ fosfossulfato (APS) e Luciferina 1. Enzima Apirase: Promove a desfoforilação dos desoxiribonucleosídeos trifosfatos (dNTPs) em nucleosídeos monofosfatos (dNMPs) 2. Enzima Luciferase: Promove uma reação química que emite LUZ!!! Luciferina + ATP + O2 3. Enzima ATP sulfurilase: Transforma adenosina-fosfosulfato (APS) em ATP!!! 4. Enzima DNA polimerase: Insere os dNTPs sintetizando a fita de DNA complementar a fita molde. → CLONAGEM DE DNA ➢ Etapas da clonagem DNA: 1. Isolar o gene de interesse 2. Unir o gene ao vetor: DNA recombinante 3. Transformação 3.1 Choque térmico 3.2 Eletroporação (corrente elétrica) 3.3 Biobalística (canhão gênico) 4. Seleção dos clones recombinantes 5. Multiplicação ou expressão do gene de interesse . luciferase Oxi-luciferina + CO2 + AMP + PPi +
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