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DATA: 02/09/2021 Juliana Oliveira – T. IV-B Perguntas da aula anterior 1- Qual é o propósito da PCR (reação da cadeia de polimerase)? É necessária uma grande quantidade de DNA para realizar esse procedimento? Justifique. A reação em cadeia da polimerase, ou PCR, é uma técnica para fazer muitas cópias de uma região específica do DNA, in vitro (em um tubo de ensaio, ao invés de um organismo). Não é necessário utilizar uma quantidade grande, só uma parte específica, pois está prática possibilita a amplificação de sequências de DNA. 2- Porque não se amplifica (ou se replica) todo o genoma de um organismo durante a PCR? Quem garante a especificidade da sequência a ser amplificada? Não se amplifica todo o genoma durante a PCR, apenas a parte desejada. O Primer é complementar a região genica e dá a especificidade, identificando a região a qual vai ser utilizada. 3- Durante o processo de replicação do DNA na célula eucariota, a enzima helicase rompe as pontes de hidrogênio, como essa separação da dupla hélice é feita durante a PCR? Durante a PCR a separação ocorre através da elevação da temperatura entre 94º a 98º, ocorrendo à desnaturação. 4- Na PCR utilizamos primers (iniciadores) obtidos a partir de sequências de DNA já conhecidas, empresas habilitadas confeccionam esses elementos. Na célula viva ocorre essa etapa? Quem produz os primers e por que os primers são necessários? Técnicas de diagnostico molecular e polimorfismo Objetivos de aprendizagem Compreender as principais técnicas de biologia molecular utilizadas para diagnóstico − Extração de DNA − PCR − Eletroforese − Sequenciamento Correlacionar os resultados obtidos através das técnicas de biologia molecular com um provável resposta clínica Bibliografia Aula 05 - Prof. Estela Araujo Costa DATA: 02/09/2021 Juliana Oliveira – T. IV-B Sim, ocorre e durante a replicação do DNA em células, os primers são produzidos pela ação da RNA- polimerase especial (primase), sendo necessário pois limitada o início de onde vai ocorrer a transcrição. 5- Podemos afirmar que a enzima DNA polimerase utilizada para as reações de PCR é diferente da DNA polimerase presente em nossas células? Por qual motivo? É diferente, pois na PCR é utilizada a Taq polimerase, é uma bactéria resistente a altas temperaturas o qual a fita precisa sofrer para ocorrer a separação da dupla hélice. SEQUENCIAMENTO DE DNA SEQUENCIAMENTO DO GENOMA ❖ CONCEITO − Total da informação genética de um organismo, podendo ser nuclear (comossomos) e mitocandrial − O sequenciamento é um processo de determinação da ordem precisa de nucleotídeos em um pedaço de DNA (A, G, C, T), sendo o primeiro passo para obter uma descrição completa da composição molecular de cada organismo, já que todas as informações necessárias para construção de um indivíduo estão presentes no DNA. − O gene possui regiões codificadoras (EXYONS) e não codificadoras (INTRONS) − A ccmparação de genomas de diversos indivíduos permite correlacionar características, síndromes e mutações de determinados lócus do genoma. − Esse sequenciamento é feito através de um equipamento e precisa de componentes para sua realização, sendo eles o material genético, arcabouço e nucleotídeos. ❖ PORQUE SE SEQUENCIAR UM GENOMA? − É o primeiro passo para obter uma descrição completa da composição molecular de cada organismo poiS todas informações necessária para construção estão presentes no DNA genômico − A ccmparação de genomas de diversos indivíduos permite correlacionar características, síndromes e mutações de determinados lócus do genoma. − É o processo de determinação da ordem precisa de nucleotídeos na molécula de DNA. Inclui qualquer método de tecnologia que é usado para determinar a ordem das quatro bases nitrogenadas: A, T, C e G Entender a importância da relação da função proteínas genes, DATA: 02/09/2021 Juliana Oliveira – T. IV-B TECNOLOGIAS DE SEQUENCIAMENTO DE DNA/METODOS Para localizar a sequencia existem diversos metodos: - PRIMARIO OU SEQUENCIAMENTO DE PRIMEIRA GERAÇÃO: Interrupção da cadeia (ddNTPs) Sanger ➢ METODO ▪ Baseia-se no principio em que, num dado momento da extensão (semelhante à PCR), uma pequena porcentagem de moléculas irá incorporar um ddNTP e neste caso a reação de alongamento da cadeia será automaticamente interrompida naquele sítio. ▪ DdNTP: nucleotídeos modificados - didesoxiribonucleotídeos, é quando acaba a extensão do deslacamento da cadeia ▪ Em cada reação, um ddNTP é incorporado aleatoriamente na posição do dNTP correspondente - provocando a terminação da polimerização ➢ APLICAÇÃO ➢ COMPONENTES NECESSÁRIOS ▪ DNA ▪ Enzima (Taq Pol) ▪ Primer ▪ ddNTP (dideoxinucleotideotrifosfato) o dATP (desoxiadenosina trifosfato) o dTTP (desoxitimidina trifosfato) o dCTP (desoxicitosina trifosfato) o dGTP (desoxiguanosina trifosfato) o ddNTP (dideoxinucleotideotrifosfato) ➢ PROCEDIMENTO - SEQUENCIAMENTO DE NOVA GERAÇÃO ➢ METODO ▪ Baseado no princípio de detecção dos raios luminosos emitidos dos diferentes PPi liberados a partir da síntese do DNA. ▪ Ocorre a obtenção de um grande número de sequências em um menor tempo, já que ocorrem muitas reações de sequenciamento simultaneamente; DATA: 02/09/2021 Juliana Oliveira – T. IV-B ▪ É uma forma mais barata; ▪ As reações são pequenas e muitas podem ser realizadas de uma vez em um chip; ▪ Pelo fato de as reações serem feitas em paralelo, os resultados são obtidos muito mais rápido; ▪ Não utiliza ddNTP (interrupção da cadeia), pois se baseia no comprimento de onda emitido pelos fluorocromos ▪ O sequenciador utilizado é muito tecnológico e possui geralmente o tamanho de um pendrive. Além de possuir uma velocidade cerca de 20.000 vezes maior que o método Sanger. ➢ APLICAÇÃO ▪ Esse método é utilizado para análise do sequenciamento de genomas (vírus, bactérias). Foi utilizado este tipo para o estudo do Sars-Cov2, no projeto da vacina contra a Covid-19. erísticas de um indivíduo, podemos tratá-lo melhor porque conhecemos sua disposição especial para contrair doenças. Esse benefício é enorme para a sociedade, até porque economiza pesquisas do Einstein, sobre o sequenciamento do genoma humano.
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