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UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO JOÃO DEL-REI – UFSJ CAMPUS CENTRO OESTES DONA LINDU CURSO DE FARMÁCIA Atividade Assíncrona 04 – ED AMINOÁCIDOS E SUAS PROPRIEDADES - POLIPEPTÍDEO Essa atividade deverá ser entregue até 06/07 até às 12:00 h e os resultados serão discutidos na próxima aula. Fazer em dupla e enviar para email jasilvaa@gmail.com Discentes: Grazielly I. Licco e Laís S. Costa ROTEIROS DE ESTUDOS 01.Qual aminoácido? a) contribui o menor grau de impedimento estérico às proteínas? R: Cisteína b) está positivamente carregado em pH fisiológico? R: Lisina, Arginina e Histidina. c) possui uma cadeia lateral aromática, é hidrofóbico e neutro em qualquer pH? R: Fenilalanina e Triptofano. d) possui uma cadeia lateral de hidrocarboneto saturado; é importante nas interações hidrofóbicas? R: Alanina, Valina, Leucina, Isoleucina e Metionina e) único aminoácido possuidor de cadeia lateral com pKa próximo a 7; importante como participante do sítio ativo de algumas enzimas? R: Histidina f) único aminoácido com um α-amino grupo modificado; influencia a estrutura protéica por forçar um dobramento da cadeia? R: Prolina 02.Responda sobre os aminoácidos: a) Quais são as características comuns a todos os aminoácidos? R: Todos os 20 aminoácidos comuns são denominados alfa aminoácidos, e tem um grupo carboxila e um grupo amino ligados ao carbono alfa, que é um centro quiral. mailto:jasilvaa@gmail.com b) O que são "zwitterions"? R: Quando um aminoácido sem um grupo R ionizável é dissolvido em água em pH neutro, ele permanece na solução como um íon bipolar, ou zwitteríon (do alemão “íon híbrido”), que pode agir como ácido ou base. c) Que parte dos aminoácidos podem liberar H+ para a ação tamponante dos Aminoácidos? R: Glicina d) O que representa o ponto isoelétrico da curva de titulação dos aminoácidos? R: Outra importante peça de informação derivada da curva de titulação de um aminoácido é a relação entre a sua carga final e o pH da solução. O pH característico no qual a carga elétrica final é zero é chamado de ponto isoelétrico ou pH isoelétrico, designado por pI. 03. Classificar os aminoácidos em termos da natureza química dos seus grupos radicais: a) ionizáveis ou não ionizáveis R: Ionizáveis: Aminoácidos com o grupo R carregado positivamente têm como característica uma cadeia lateral maior e insaturada, além de possuir mais um grupo amina ligado, como a arginina e histidina. Enquanto os aminoácidos com o grupo R carregado negativamente possuem uma cadeia lateral curta, saturada e com uma ligação do grupo carboxila na cedia, como a presente no aspartato e no glutamato. Não ionizáveis: Para aminoácidos não carregados, as cadeias laterais liberam –OH quando colocadas em meio aquoso. Ex: Serina, treonina, asparagina e glutamina b) ácidos ou básicos R: ácidos: Os dois aminoácidos que apresentam grupos R com carga negativa final em pH 7,0 são o aspartato e o glutamato, cada um dos quais tem um segundo grupo carboxila. Ex.: Ac. aspártico Ac. Glutâmico Básicos: Os aminoácidos nos quais os grupos R têm uma carga positiva significativa em pH 7,0 são a lisina, com um segundo grupo amino primário na posição «em sua cadeia alifática; a arginina, com um grupo guanidínio positivamente carregado; e a histidina, com um grupo imidazol aromático. c) polares ou não polares R: Polares: Os grupos R desses aminoácidos contêm grupos funcionais que formam ligações de hidrogênio com a água. Essa classe de aminoácidos inclui a serina, treonina, cisteína, asparagina e glutamina. Os grupos hidroxila da serina e treonina e os grupos amida da asparagina e glutamina contribuem para suas polaridades. A cisteína é um caso isolado aqui porque sua polaridade, devida ao seu grupo sulfidrila, é bastante modesta. Apolar: Os grupos R nesta classe de aminoácidos são apolares e hidrofóbicos. As cadeias laterais de alanina, valina, leucina e isoleucina tendem a se agrupar no interior de proteínas, estabilizando a estrutura proteica por meio de interações hidrofóbicas. d) hidrofílicos ou hidrofóbicos R: Hidrofóbico: Possuem radical "R" geralmente formado exclusivamente por carbono e hidrogênio - grupamentos alquila. Ex: Alanina, Fenilalanina, Isoleucina, Leucina, Metionina, Prolina, Triptofano e Valina. Hidrofílico: Possuem radicais "R" contendo hidroxilas, sulfidrilas e grupamentos amida. Ex: Glicina, Aspargina, Cistina, Glutamina, Serina, Tirosina e Treonina; e) alifáticos ou aromáticos R: Aromáticos: Fenilalanina, tirosina e triptofano, com suas cadeias laterais aromáticas, são relativamente apolares (hidrofóbicos). Todos podem participar em interações hidrofóbicas. O grupo hidroxila da tirosina pode formar ligações de hidrogênio e é um importante grupo funcional em algumas enzimas. A tirosina e o triptofano são significativamente mais polares do que a fenilalanina, devido ao grupo hidroxila da tirosina e ao nitrogênio do anel indol do triptofano. Alifáticos: Os grupos R nesta classe de aminoácidos são apolares e hidrofóbicos. As cadeias laterais tendem a se agrupar no interior de proteínas, estabilizando a estrutura proteica por meio de interações hidrofóbicas, esta hidrofobicidade aumenta à medida que aumenta o número de átomos de carbono na cadeia de hidrocarbonetos. Ex: alanina, valina, leucina e isoleucina f) lineares ou ramificados R: Lineares: Os aminoácidos com o grupo R linear são aqueles que não possuem ramificações de CH, ou seja, fazem uma cadeia reta e têm como ramificação apenas o grupo amina e o H. Ex: Lisina, metionina e arginina. Ramificados: Os aminoácidos com cadeia ramificada são constituídos por ligações de CH ao longo da cadeia. Ex: Treonina, Isoleocina, valina, leocina. g) pequenos e grandes. R: 04. Desenhe as estruturas dos seguintes aminoácidos. Dê as suas abreviações de uma e de três letras, e suas classificações de acordo com a natureza da cadeia lateral: a) Alanina Abreviação: Ala / A Classificação: Alifático e apolar b) Prolina Abreviação: Pro / P Classificação: Alifático e apolar c) Cisteína Abreviação: Cys / C Classificação: Polar e não carregada d) Fenilalanina Abreviação: Phe / F Classificação: Aromático e) Lisina Abreviação: Lys / K Classificação: Carregada positivamente (básica) f) Aspartato Abreviação: Asp / D Classificação: carregado negativamente (ácido) 05. Os aminoácidos formam polímeros lineares através de ligações peptídicas, que correspondem à atração eletrostática entre o grupo carboxila negativamente carregado de um aminoácido e o grupo amino positivamente carregado do aminoácido seguinte. Com relação à ligação peptídica responda: a) Quais são as partes dos aminoácidos envolvidos nas ligações peptídicas? R: É formada pela remoção de elementos de água (desidratação) do grupo a- carboxila de um aminoácido e do grupo alfa-amino do outro, b) Por que os aminoácidos envolvidos em tais ligações são chamados de resíduos? R: Pois são a parte restante após a perda de elementos de água, um átomo de hidrogênio de seu grupo amino e a metade hidroxila de seu grupo carboxila. c) Por quê todos os aminoácidos, individualmente, são solúveis em água mas nem todos os peptídeos são hidrossolúveis? R: Alguns peptídeos não são solúveis em água pois possuem outros componentes químicos associados além dos aminoácidos, assim são conhecidas como proteínas conjugadas. Esses componentes podem ser lipídios, açúcares ou metais. d) De que depende a solubilidade de uma proteína? R: A solubilidade de proteínas é reduzida em presença de alguns sais, um efeito chamado de salting out. A adição de certos sais na quantidade correta pode precipitar seletivamente algumasproteínas, enquanto outras permanecem em solução. 06. Dentre os peptídeos, responda as questões a seguir: a) Qual a sequência de aminoácidos no peptídeo abreviado como KQNY? R: K - Lisina, Q - glutamina, N - asparagina, Y – tirosina b) Qual a sequência de aminoácidos no peptídeo abreviado como RLWEQ? R: R - Arginina, L - leucina, W - triptofano, E - glutâmico, Q - glutamina c) Qual a abreviação de uma letra para o aminoácido que possui uma cadeia lateral aromática capaz de formar ligações de hidrogênio? R: W - Triptofano d) Qual a abreviação de uma letra para o aminoácido que possui uma cadeia lateral com enxofre e é capaz de formar uma ponte dissulfeto? R: M- Metionina 07. Escrevendo as reações de ionização dos grupamentos carboxila (pKa1 = 1,99) e (pKa2 = 3,99) e do grupamento amina (pKa3 = 9,9) do aminoácido aspartato: (valor da questão: 0.5): a) complete a tabela abaixo com as formas iônicas predominantes nos pH assinalados: PH=1,0 pH=1,99 pH=3,0 pH=3,9 pH=7,4 pH=9,9 pH=12 Formas iônicas COOH COOH NH3 + COOH/C OO- COOH NH3+ COO- COOH NH2+ COO- COOH/C OO- NH3+ COO- COO- NH3+ COO- COO- NH3+/NH 2 COO- COO- NH2 b) suas cargas líquidas nos pHs: PH=1,0 pH=1,99 08. Os aminoácidos podem atuar como bases e ácidos fracos. Em relação à glicina, responda: Uma solução de 100mL de glicina a 0,1M em pH 1,72 foi titulada com uma solução de NaOH a 2M. O pH foi monitorado e os resultados foram inseridos no gráfico abaixo. Os pontos chave na titulação são designados de I a V. Para cada uma das afirmações, identifique o ponto chave apropriado e justifique sua escolha. a) A glicina está presente predominantemente como espécie + H3N-CH2-COOH. R: ponto I, pois em pH menor que seu pI a glicina tem carga final positiva, tendendo a se deslocar em direção ao seu eletrodo negativo. Desta forma, quanto mais distante o pH do ponto de pI, maior será a carga elétrica final, assim, em pH 1 a glicina existe quase inteiramente como +H3N-CH2-COOH. b) A carga líquida média da glicina é +1/2. R: ponto II, em um pH de 2,34, onde há uma igual mistura de +H3N-CH2-COOH e +H3N-CH2-COO–, a média ou a carga final positiva é igual a 0,5 c) Metade dos grupos amino está ionizada. R: Ponto II, em um pH de 2,34, há uma igual mistura de +H3N-CH2-COOH e +H3N- CH2-COO– d) O pH é igual ao pKa do grupo carboxil R: Ponto II, para a glicina, o pH no ponto médio é 2,34, portanto seu grupo -COOH tem um pKa de 2,34, o pKa alterado da glicina é provocado pela repulsão entre o próton que está saindo e o grupo amino próximo positivamente carregado no átomo de carbono alfa e) O pH é igual ao pKa do grupo amino protonado R: Ponto IV, o pKa do grupo amino na glicina é alterado para baixo em relação ao pKa médio de um grupo amino. Esse efeito se deve parcialmente aos átomos de oxigênio eletronegativos nos grupos carboxila, que tendem a puxar os elétrons na direção deles, aumentando a tendência do grupo amino em abrir mão de um próton. Assim, o grupo a-amino tem um pKa menor do que o de um de uma amina alifática. f) A glicina possui sua capacidade tamponante máxima. R: Ponto II e IV, pois nestes pontos ela apresenta duas formas, uma protón-doadora e outra proton-aceptora (50%) g) A carga liquida média da glicina é zero. R: Ponto III, nessa região está acontecendo o ponto isoelétrico (pI), onde 100% das moléculas de glicina contém carga nula. h) O grupo carboxil foi completamente titulado (primeiro ponto de equivalência) R: Ponto II, pois pH da solução é igual ao pK do grupo carboxílico. i) A glicina está completamente titulada (segundo ponto de equivalência) R: Ponto V, pois é nesse pH que todos os componentes da glicina já foram titulados j) A espécie predominante é + H3N-CH2-COO-. A carga líquida média da glicina é -1 R: Ponto III. A titulação da glicina prossegue e encontra outro ponto importante no pH 5,97. Aqui a remoção do primeiro próton está completa e a remoção do segundo apenas começou. Nesse pH, a glicina está presente em grande parte como o íon bipolar (zwitteríon) +H3N-CH2-COO– l) A glicina está presente predominantemente como uma mistura 50:50 de + H3N-CH2-COOH e + H3N-CH2- COO R: Ponto II, em pH muito baixo, a espécie iônica predominante da glicina é a forma completamente protonada, +H3NCH2COOH. No primeiro estágio da titulação, o grupo carboxílico perde seu próton, assim no ponto médio desse estágio, as concentrações de +H3NCH2COOH, +H3NCH2COO- estão equivalentes. m) Este é o ponto isoelétrico? R: Ponto III, pois para a glicina, que não possui qualquer grupo ionizável em sua cadeia lateral, o ponto isoelétrico é simplesmente a média aritmética dos dois valores de pK. n) Este é o ponto final da titulação? R: Ponto V, pois é quando glicina está completamente titulada o) Estas são as piores regiões de poder tamponante? R: Ponto I, III e V. Pois a glicina não se encontra em duas formas iônicas, apenas uma. 09. A proteína insulina consiste de dois polipeptídios chamados de cadeia A e B. As insulinas de seres humanos, gato e patos têm a mesma seqüência de aminoácido com exceção de seis resíduos, como mostrado a seguir. Dê acordo com a tabela abaixo: A8 A9 A10 B1 B2 B27 Humano Thr Ser Ile Phe Val Thr Gato Lys Ser Pro Phe Ala Ser Pato Glu Asn Pro Ala Ala Ser a) O pI da insulina humana é maior ou menor que o pI da insulina do gato? Justifique: R: Humano PI (Thr) = 2,63 + 10,43 = 6,53 2 PI (Ser) = 2,21 + 9,15 = 5,68 2 PI (Ile) = 2,36 + 9,6 = 5,98 2 PI (Phe) = 1,83 + 9,13 = 5,48 2 PI (Val) = 2,32 + 9,62 = 5,97 2 PI (Thr) = 2,63 + 10,43 = 6,53 2 PI (Humano) = 6,53 + 5,68 + 5,98 + 5,48 + 5,97 + 6,53 = 6,02 6 Gato PI (Lys) = 2,18 + 8,95 = 6,015 2 PI (Ser) = 2,21 + 9,15 = 5,68 2 PI (Pro) = 1,99 + 10,6 = 6,295 2 PI (Phe) = 1,83 + 9,13 = 5,48 2 PI (Ala) = 2,34 + 9,69 = 6,015 2 PI (Ser) = 2,21 + 9,15 = 5,68 2 PI (Gato) = 6,015 + 5,68 + 6,295 + 5,48 + 6,015 + 5,68 = 5,56 6 b) O pI da insulina pata é maior ou menor que o pI da insulina do gato? Justifique: Pato PI (Glu) = 2,19 + 9,67 = 5,93 2 PI (Asn) = 2,02 + 8,8 = 5,41 2 PI (Pro) = 1,99 + 10,6 = 6,295 2 PI (Ala) = 2,34 + 9,69 = 6,015 2 PI (Ala) = 2,34 + 9,69 = 6,015 2 PI (Ser) = 2,21 + 9,15 = 5,68 2 PI (Pato) = 5,93 + 5,41 + 6,295 + 6,015 + 6,015 + 5,68 = 5,89 6 Gato PI (Lys) = 2,18 + 8,95 = 6,015 2 PI (Ser) = 2,21 + 9,15 = 5,68 2 PI (Pro) = 1,99 + 10,6 = 6,295 2 PI (Phe) = 1,83 + 9,13 = 5,48 2 PI (Ala) = 2,34 + 9,69 = 6,015 2 PI (Ser) = 2,21 + 9,15 = 5,68 2 PI (Gato) = 6,015 + 5,68 + 6,295 + 5,48 + 6,015 + 5,68 = 5,56 6
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