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MILENA CARVALHO QUEIROZ MIRANDA – MEDICINA VI - UNIFASB 1 DNA e Replicação REFERÊNCIA 1. Aula de Juliana Leles 2. Sanarflix 3. Genética Médica – Thompson e Thompson VISÃO GERAL Genes: elementos que contém as informações que determinam as características de uma espécie como um todo e de cada indivíduo. Os cientistas definiram que a informações genéticas se constituíam das instruções para a produção de proteínas. Proteínas: macromoléculas versáteis que realização a maioria das funções celulares. Atuam como unidades fundamentais para as estruturas celulares e formam as enzimas que catalisam a maioria das reações químicas das células. Regulam a expressão gênica, permitem a comunicação intercelular e seu movimento. Cromossomos: estruturas em forma de cordão presentes no núcleo das células eucarióticas que transmitem a informação genética. Em estudos posteriores, descobriram que o DNA era o portador da informação genética e do mecanismo pelo qual a informação é copiada para ser transmitida de geração em geração. Sendo assim, o DNA pode ser copiado ou replicado. Porém, o DNA genômico não controla a síntese de proteínas diretamente, mas utiliza o ácido ribonucleico (RNA) como intermediário. Normalmente, quando a célula requer uma proteína específica a região do DNA é copiada sob forma de RNA (transcrição) que serão utilizados posteriormente como moldes para promover a síntese de proteínas (tradução). O fluxo da informação genética nas células é, portanto, de DNA para RNA e deste para proteína. Todas as células, desde a bactéria até os seres humanos, expressam sua informação genética dessa maneira. O armazenamento e a transferência da informação biológica são as únicas funções conhecidas do DNA. O RNA tem uma ampla variedade de funções e muitas classes são encontradas nas células: 1. RNA ribossomais: executam a síntese proteica 2. RNA mensageiro: carregam a informação genética dos genes para os ribossomos 3. RNA transportadores: traduzem a informação do RNA mensageiro em uma sequência especifica. COMPOSIÇÃO DO DNA Enquanto o DNA é encontrado apenas no núcleo das células, o RNA é produzido nele, mas migra para o citoplasma. A constituição de cada um também é diferente. Enquanto no RNA existe a ribose, no DNA encontramos a desoxirribose. ÁCIDOS NUCLEICOS ➔ Perpetuação da informação genética ➔ Fonte de energia no metabolismo – ATP ➔ Molécula sinal em respostas células – AMPc ➔ Componentes estruturais dos cofatores enzimáticos – NAD, FAD e coenzima A ➔ Constituintes dos ácidos nucleicos DNA e RNA DNA (polímero de nucleotídeos – ligação de fosfodiéster): consiste em duas cadeias longas de polipeptídios compostas por nucleotídeos. ➔ Cada fita é conhecida como fita simples ou cadeia de DNA MILENA CARVALHO QUEIROZ MIRANDA – MEDICINA VI - UNIFASB 2 Durante a transcrição dos genes, um sistema de enzimas converte a informação genética de um segmento de fita dupla de DNA em um filamento de RNA (fita única) com uma sequência de bases complementar a uma das fitas de DNA. No RNA, a cadeia principal é formada por um açúcar ligeiramente diferente do açúcar do DNA, diferenças. FUNÇÕES ➔ DNA: armazenamento e transmissão da informação genética – confere estabilidade ➔ RNA: ❖ RNA ribossômico: componentes estruturais dos ribossomos ❖ RNA mensageiro: contém a informação genética para a sequencia de aminoácidos das proteínas ❖ RNA transportador: identifica e transporta os aminoácidos das proteínas ❖ MicroRNA e RNA nucleolares *snRNA: atuam como reguladores da expressão gênica NUCLEOTÍDEOS Os nucleotídeos compõem a unidade funcional do DNA. Possuem 3 componentes: 1. Base nitrogenada (contém nitrogênio) 2. Pentose (é um açúcar composto por cinco átomos de carbono ligados, formando uma cadeia fechada) 3. Um ou mais fosfatos O grupo fosfato se liga ao carbono 5’ da pentose. Molécula que não contem fosfato: nucleosídeo. As bases nitrogenadas são derivadas de dois compostos: 1. As purinas (adenosina e guanina): anéis duplos de carbono-nitrogênio 2. Pirimidinas (citosina, timina quando DNA e uracila quando RNA): anéis simples de carbono- nitrogênio. DNA: pentose sem o grupo hidroxila – desoxirribose – estabilidade da molécula. RNA: pentose com hidroxila – ribose – oxigênio reativo – molécula mais instável – degradação mais fácil Os purínicos e pirimidínicos se ligam fazendo com que as fitas do DNA fiquem equidistantes uma da outra. Os nucleotídeos se juntam através de uma ligação de fosfodiéster, por isso o sentido da vida é 5’ (fosfato) e 3’ (hidroxila). Adenosina e timina: dupla ponte de hidrogênio (normalmente é o local por onde começam as replicações já que possuem ligações mais fáceis de serem quebradas). Guanina e citosina: tripla ponte de hidrogênio O DNA tem o formato de dupla hélice, como um parafuso, que se enrola envolta de si mesmo e de histonas (proteínas) facilitando na hora de transforma-se em cromossomo. Ligações fosfodiéster: liga os nucleotídeos um no outro Ponte de hidrogênio: liga as bases nitrogenadas 5’-3’ – sentido da vida – é o sentido na qual a DNA polimerase trabalha – enzima que faz a adição dos nucleotídeos (faz leitura). MECANISMO PARA A HERIDITARIEDADE Se cada fita possui uma sequência exatamente complementar a sequência da fita associada, cada fita pode atuar como molde para a síntese de uma NOVA fita complementar. ORGANIZAÇÃO DO MATERIAL GENÉTICO ➔ Núcleo ➔ Complexo que engloba o DNA: cromatina ➔ Representação de 46 cromossomos é denominada de cariótipo humano ➔ Função genotípica: replicação ➔ Função fenotípica: expressão gênica ➔ Função evolutiva: variabilidade ➔ Mutações, transferência horizontal de genes... Apenas uma parte muito pequena codifica proteínas – éxons e a parte que não codifica – íntrons. Além dos genes, o material genético é composto por uma enorme quantidade de DNA intercalante que é essencial na expressão gênica. MILENA CARVALHO QUEIROZ MIRANDA – MEDICINA VI - UNIFASB 3 ➔ A estrutura de dupla hélice do DNA é mantida por ligações de hidrogênio e empilhamento de bases OBS.: cada gene está associado a sequências de DNA regulador, as quais são responsáveis por assegurar que cada gene será ativado e desativado no devido tempo, expresso no nível adequado e apenas em determinados tipos celulares. DNA: dupla fita em sentidos opostos, se ligando por pontes de hidrogênio em torno de um eixo comum. CROMOSSOMOS Para que seja formado um cromossomo é preciso que a molécula de DNA que será usada consiga replicar, sendo suas cópias formadas, separadas e fielmente distribuídas entre as células-mãe no processo de divisão celular. As proteínas que se ligam ao DNA e formam os cromossomos eucarióticos são divididas em duas classes: ➔ as histonas ➔ proteínas cromossômicas não histonas. O complexo dessas duas classes de proteínas com o DNA nuclear eucariótico é conhecido como cromatina. ➔ Heterocromatina: fortemente condensada – principalmente nos centrômeros e telômeros. ➔ Eucromatina: forma menos condensada As histonas são responsáveis pelo nucleossomo – DNA enrolado em um núcleo de histonas. Esse processo ocorre por vários estágios de divisão celular denominado de ciclo celular. Organizados por: 1. Mitose 2. Meiose Durante a interfase os genes são expressos e os cromossomos são replicados. As duas réplicas são mantidas dentro de uma mesma célula formando um par de cromátides-irmãs. Durante esse período, os cromossomos estão estendidos e muito de sua cromatina está disposta no núcleo na forma de longas linhas enroladas, de modo que os cromossomos individuais não podem ser distinguidos facilmente. Apenas durante um período muito breve da mitose, os cromossomos são condensados, permitindo queas duas cromátides-irmãs sejam separadas e distribuídas aos núcleos-filhos. Os cromossomos altamente condensados nas células em divisão são denominados cromossomos mitóticos. A presença de uma segunda sequência especializada de DNA, chamada de centrômero, permite que uma cópia de cada cromossomo duplicado e condensado seja levada para cada célula-filha no momento da divisão celular. Um complexo proteico chamado de cinetócoro é formado no centrômero e liga o fuso mitótico aos cromossomos duplicados, permitindo que eles sejam separados. Uma terceira sequência forma os telômeros (extremidades dos cromossomos). Essas estruturas permitem que as extremidades sejam replicadas de maneira eficiente e sinalizam a diferença das extremidades com as partes das moléculas quebradas que precisam de reparo. COMPOSIÇÃO DO RNA ➔ Fita simples ➔ Estão localizados no núcleo e citoplasma Principais tipos: ➔ RNA transportador ➔ RNA mensageiro ➔ RNA ribossômico ➔ Micro RNA RNA TRANSPORTADOR Esse RNA possui uma estrutura em formato de trevo que possui uma partícula denominada de anticódon que lê o código genético, ou seja, o códon do RNA mensageiro (constituído por nucleotídeos) ➔ A cada três nucleotídeos – trinca – eu tenho um aminoácido correspondente. ➔ Mecanismos essenciais na tradução para a síntese das proteínas. É o RNA transportador que define a posição dos aminoácidos nas proteínas. RNA MENSAGEIRO Regiões regulatórias na porção 5’ e 3’ e no meio encontra- se a região codificante – códon – sequência de nucleotídeos necessária para produzir a proteína. 1 trinca de bases nitrogenadas = 1 códon RNA é complementar ao molde do DNA. MILENA CARVALHO QUEIROZ MIRANDA – MEDICINA VI - UNIFASB 4 RNA RIBOSSÔMICO + Abundante na célula ➔ Possui estrutura tridimensional especifica visando promover a estabilidade e atividade catalítica nos ribossomos ➔ Combina-se com o RNA mensageiros para formar os polirribomossomos. DOGMA CENTRAL DA GENÉTICA MOLECULAR Genoma = 46 cromossomos Para que a célula se divida é preciso que haja duplicação do material genético. Em cada órgão e tecido só ocorrerá a expressão dos genes que são necessários para função fisiológica daquele local. ➔ Transcriptoma e Proteoma: específico para cada órgão e tecido – transcrição gênica ➔ Proteoma: expressão das proteínas FLUXO DA EXPRESSÃO GÊNICA A replicação do DNA possibilita o fluxo da informação genética de uma geração para a seguinte – transferência vertical. VISÃO GERAL DA REPLICAÇÃO A replicação do DNA é semiconservativa, ou seja, é processo pelo qual cada fita parenteral serve como molde para a síntese de uma nova fita mãe. O pareamento das bases complementares é a chave para uma replicação precisa (A-T, C-G, A-U). Para que a dupla fita seja usada como molde é preciso que elas sejam separadas ou desnaturadas para tornar as bases disponíveis ao pareamento. Essa separação acontece por meio da Enzima Helicase. ➔ Célula eucariótica: a replicação acontece na fase S do ciclo celular e é um processo uni ou bidirecional, tendo várias origens em cada fita sendo ativadas de pouco a pouco. ➔ Célula procariótica: cromossomo circular, única origem de replicação – ocorre nos dois sentidos É preciso primeiramente entender que essa replicação ocorre em um local específico da célula – sequência iniciadora. Essa sequência é rica em ligações adenina- timina já que são as mais fáceis de serem quebradas (possuem apenas duas pontes de hidrogênio entre elas). ➔ Formação do repissomo: conjunto de proteínas e enzimas que garantem a replicação do DNA. ❖ Forquilha de replicação: separação das duas fitas e para isso é preciso que o DNA perca o formato helicoide e que haja separação das pontes de hidrogênio – se deslocam rapidamente. Quando todas as forquilhas se fundem quer dizer que todo o material genético foi replicado. Em resumo: DNA Helicase: quebra as pontes de hidrogênio entre as bases nitrogenadas Proteínas SSB: proteínas que se ligam às cadeias moldem separadas pela DNA Helicase impedindo que essas voltem a se ligar e mantem assim a estabilidade da forquilha de replicação DNA girase: torna a molécula de DNA compacta e biologicamente ativa, se não fosse ela, o DNA ocuparia grande espaço no interior da bactéria e determinaria síntese descontrolada de RNA mensageiro -> morte celular. Impede o super enovelamento do DNA. DNA polimerase: é capaz de sintetizar uma nova fita de DNA a partir de uma fita molde. Além disso, possui a função exonucleasses, ou seja, faz a correção da fita, tirando os nucleotídeos que por ventura estejam no local errado. Primase: faz um primer de RNA, ou um trecho curto de ácido nucleico complementar ao molde, que fornece uma extremidade 3' para a DNA polimerase trabalhar. DNA ligase: enzima de adesão de DNA. Ela acaba por ligar dois pedações de DNA complementares para formar uma molécula de DNA única e contínua. MILENA CARVALHO QUEIROZ MIRANDA – MEDICINA VI - UNIFASB 5 RNAse: é um tipo de nuclease que catalisa a degradação do RNA em componentes menores – retira os primes. DNA polimerase age colocando nucleotídeos completares no local para que a fita saia completa. Polimerases de DNA somente podem adicionar nucleotídeos à extremidade 3' de uma fita existente de DNA (elas utilizam o grupo -OH livre encontrado na extremidade 3' como um "gancho", adicionando um nucleotídeo a este grupo na reação de polimerização). Como, então, a DNA polimerase adiciona o primeiro nucleotídeo em um novo garfo de replicação? Sozinha, ela não pode! O problema é resolvido com a ajuda de uma enzima chamada primase. A primase faz um primer de RNA, ou um trecho curto de ácido nucleico complementar ao molde, que fornece uma extremidade 3' para a DNA polimerase trabalhar. Um primer típico tem cerca de cinco a dez nucleotídeos. O primer inicia a síntese de DNA, isto é, faz com que ela comece. Uma vez que o primer de RNA está em seu lugar, a DNA polimerase o "amplia", adicionando nucleotídeos um por um para fazer uma nova fita de DNA que é complementar à fita molde. ➔ Muitos fármacos atuam nessas enzimas, as quinolonas por exemplo, inibem a ação da DNA girase. Após o desenrolamento do DNA, ocorre a ação de uma nova enzima a DNA polimerase, que age de 2 formas. Na fita líder ela age de maneira contínua e rápida. Já na fita "retardada" ela de maneira descontínua e interrupta, formando vários fragmentos, que são denominados fragmentos de Okasaki. Função do telômero: proteção da parte codificante do DNA. ATENÇÃO - Semiconservativa, uni e bidirecional - Existe uma fita líder e outra descontínua com fragmentos de Okazaki - Se inicia nas bolhas de replicação (múltiplas forquilhas) - Várias origens de replicação (genoma de humanos e outros mamíferos contêm cerca de 10.000 origens de replicação pelos cromossomos a intervalos de 30.000 a 300.000 pares de bases) - Atuam enzimas similares as das células procarióticas - Nos fragmentos de Okazaki, os primers são removidos por RNAse e não por uma DNA polimerase de reparo - A finalização da replicação é feita com a formação de estruturas nas terminações dos cromossomos: telômeros. - Os telômeros são replicados com a ajuda das telomerases. TELÔMEROS A DNA polimerase não pode replicar o segmento terminal do DNA do filamento descontínuo de um cromossomo linear. Os telômeros são sequências repetitivas, se a célula não possui a enzima telomerases, ela acaba por não conseguir fixar essas ultimas sequência e vai cada vez mais perdendo informações. ➔ Telômero: tem estrutura única que favorece um mecanismo simples para adição de telômeros feita pela enzima telomerases contendo RNA. Além disso, os telômeros são responsáveis pela proteção do material genético, já que existemvárias enzimas celulares – endonucleases - que degradam o material genético. Tipos celulares com telomerases ativa: 1. Células germinativas 2. Células tronco 3. Células cancerosas ➔ Síndrome de Verme: sintomas de envelhecimento em pacientes ainda jovens. ➔ Telômeros menores que os indivíduos normais.
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