A NAD e a FAD são coenzimas que transportam elétrons dos processos metabólicos aeróbicos anteriores a respiração oxidativa, que são o ciclo de Krebs, glicose, beta-oxidação, glicogenólise, entre outros. Os processos que ocorrem antes da respiração oxidativa são processos que quebram carbonos, a quebra dos carbonos gera moléculas de ATP e moléculas de H+, é aí que o NAD e o FAD entram, carregando o H+ para a membrana interna das mitocôndrias. Na membrana interna das mitocôndrias o NADH e o FADH2 irão perder os íons de hidrogênio, que irão acidificar o meio, ativando a ATP sintase, que irá produzir muitas ATP's.
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