Na transcrição em eucariotos, o processo ocorre no núcleo da célula. O transcrito primário de mRNA dos eucariotos é amplamente processado, passando por uma série de alterações. Isso inclui a aquisição de revestimento (cap) na extremidade 5' e cauda poli-A na extremidade 3', além da remoção exata de íntrons (splicing) para a formação de mRNA maduro com mensagens contínuas. Vale ressaltar que a transcrição em eucariotos é mais complexa do que em procariotos.
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