Neurotransmissores derivados em sua maioria de proteínas ficam armazenados em vesículas em um neurônio pré-sináptico; após sua liberação na fenda sináptica podem se ligar a receptores localizados na membrana sináptica de um neurônio pós-sináptico. São exemplos de neurotransmissores excitatório e inibitório, respectivamente:
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