O agente causador da Esquistossomose pode variar de acordo com a espécie. Para a Esquistossomose vesical ou hematúria, o agente causador é o Schistossoma haematobium. Para a Esquistossomose japônica, o agente causador é o Schistosoma japonicum. Para a Semelhante a esquistossomose japônica, o agente causador é o Schistosoma mekongi. Para a Esquistossomose intestinal, o agente causador é o Schistosoma intercalatum. E para a Esquistossomose mansoni ou moléstia de Pirajá da Silva, o agente causador é o Schistosoma mansoni.
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