Durante o desenvolvimento embrionário do coração, as estruturas que se formam para permitir a separação adequada dos átrios e ventrículos e a formação dos septos interatrial e interventricular são o septo primum, o septo secundum e o septo membranoso. O septo primum cresce a partir do teto do átrio primitivo, enquanto o septo secundum cresce a partir do teto do átrio direito. O septo membranoso se forma a partir do crescimento do septo muscular interventricular.
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