A diarreia pode ocorrer por quatro mecanismos diferentes: aumento da pressão osmótica do conteúdo intraluminal (diarreia osmótica), aumento da secreção de água e eletrólitos pela mucosa intestinal (diarreia secretora), aumento da permeabilidade da mucosa intestinal (diarreia exsudativa) e alteração da motilidade do intestino delgado (diarreia motora).
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