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Diferentemente do genoma, que é idêntico em todas as células somáticas de um mesmo organismo, uma importante característica do transcriptoma é ser específico em cada tipo celular e se apresenta de maneira bastante variável a diferentes condições.
Sobre as técnicas utilizadas para análise do transcriptoma, assinale a alternativa CORRETA:
A A ORESTES sequencia somente as extremidades do cDNA, identificando o RNA por meio de comparações com bancos de dados, como o BLAST.
B A técnica do microarray, ou microarranjos de DNA limita a busca de genes a um pequeno número de cDNA, pois necessita de sondas específicas marcadas com fluoróforo.
C Tanto a metodologia utilizada pela EST quanto a ORESTES, comparam os dados obtidos com bancos de dados disponíveis, como o BLAST, a fim de identificar os genes correspondentes.
D O método EST tem todo o cDNA clonado sequenciado, fornecendo informações sobre a região codificadora do RNA mensageiro.
E Nenhuma das alternativas é correta.
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Avaliação Final (Objetiva) - Individual
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UNOPAR

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há 2 meses

Vamos analisar cada uma das alternativas para identificar a correta sobre as técnicas utilizadas para análise do transcriptoma: A) A ORESTES sequencia somente as extremidades do cDNA, identificando o RNA por meio de comparações com bancos de dados, como o BLAST. - Esta afirmação é verdadeira, pois ORESTES (Open Reading Frame Expressed Sequence Tags) realmente se concentra nas extremidades do cDNA. B) A técnica do microarray, ou microarranjos de DNA limita a busca de genes a um pequeno número de cDNA, pois necessita de sondas específicas marcadas com fluoróforo. - Essa afirmação é um pouco enganosa, pois os microarrays podem analisar muitos genes simultaneamente, não se limitando a um pequeno número. C) Tanto a metodologia utilizada pela EST quanto a ORESTES, comparam os dados obtidos com bancos de dados disponíveis, como o BLAST, a fim de identificar os genes correspondentes. - Esta afirmação é verdadeira, pois tanto EST (Expressed Sequence Tags) quanto ORESTES utilizam comparações com bancos de dados. D) O método EST tem todo o cDNA clonado sequenciado, fornecendo informações sobre a região codificadora do RNA mensageiro. - Esta afirmação é incorreta, pois o método EST não sequencia todo o cDNA, mas sim fragmentos. E) Nenhuma das alternativas é correta. - Como já identificamos que algumas alternativas estão corretas, esta opção não pode ser a resposta. Após a análise, a alternativa correta é a C) Tanto a metodologia utilizada pela EST quanto a ORESTES, comparam os dados obtidos com bancos de dados disponíveis, como o BLAST, a fim de identificar os genes correspondentes.

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A técnica da reação em cadeia da polimerase (PCR) se refere à replicação in vitro de um fragmento de DNA.
Sobre o PCR, assinale a alternativa CORRETA:
A O processo do PCR não necessita da utilização de nucleotídeos.
B A ligação dos primers à fita de DNA é denominado como desnaturação.
C O processo de replicação in vitro, depende do uso de primers (oligonucleotídeos sintéticos), com sequências de 18 a 22 nucleotídeos, que seja complementar ao gene de interesse.
D Nenhuma das alternativas é correta.
E A enzima DNA polimerase humana é uma das principais responsáveis pelo sucesso da técnica in vitro.

[Laboratório Virtual - Hibridização] A técnica de FISH baseia-se no uso de uma sequência de bases nitrogenadas (a qual chamamos de sonda ou, em inglês, probe), que é complementar ao DNA-alvo que se pretende analisar.
Considerando essa técnica, analise as sentenças a seguir:
I- A hibridização ocorre com o uso de sondas com sequências conhecidas de nucleotídeos, que são complementares ao DNA analisado.
II- A técnica de hibridização só é possível através da técnica de FISH, já que métodos como CGH utilizam como base a PCR.
III- A hibridização por FISH utiliza sondas com corantes fluorescentes, que indicam a presença ou a ausência de determinada mutação.
A As sentenças II e III estão corretas.
B As sentenças I e II estão corretas.
C Somente a sentença II está correta.
D Somente a sentença III está correta.
E As sentenças I e III estão corretas.

Embora popularmente conhecido como teste de paternidade em virtude da sua maior aplicação para a confirmação de paternidade, este teste pode também ser aplicado para a determinação de maternidade.
De acordo com o teste de paternidade, ou teste de DNA, analise as sentenças:
I - A técnica aplicada é o sequenciamento NGS, pois diversos fragmentos são amplificados simultaneamente. Após a amplificação, o material é submetido à eletroforese e o padrão de bandas apresentado para cada STR na amostra do filho é comparado com o padrão de bandas do pai.
II - São avaliadas dezenas de variações, sendo comumente utilizados os polimorfismos do tipo STR, conhecidos como microssatélites, que quando comparada com as regiões do DNA que contenham esses marcadores, espera-se que o padrão de repetição em cada um dos cromossomos homólogos seja herdado dos pais.
III - Além do DNA do suposto pai, utiliza-se o DNA proveniente da mãe, pois, assim, pode-se identificar a parte do conteúdo genético do filho herdado da mãe, simplificando a comparação com o suposto pai e tornando o resultado ainda mais confiável.
A Somente a sentença I está correta.
B As sentenças I e III estão corretas.
C As sentenças II e III estão corretas.
D As sentenças I, II e III estão corretas.
E As sentenças I e II estão corretas.

As fases de leitura aberta (ORF) compreendem os códons de início (ATG) e de parada (TAA, TAG ou TGA), que para o RNA são substituídos pela uracila.
Sobre o exposto, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas:
I- ORFs que contenham 100 ou mais códons podem ser indicadas como possíveis genes presentes no genoma que está sendo avaliado.
II- A presença do códon de início no genoma é um indicativo de um gene funcional, pois essa mesma sequência, quando encontrada no RNA (ou seja, na forma AUG), indica o local de início do processo de tradução da proteína codificada pelo RNA.
A A asserção I é uma proposição verdadeira e a II é uma proposição falsa.
B A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira.
C As asserções I e II são verdadeiras, e a II é uma justificativa correta da I.
D As asserções I e II são falsas.
E As asserções I e II são verdadeiras, mas a II não é uma justificativa correta da I.

Assim como os demais "omas", o exoma compreende todo o conjunto de éxons presentes no DNA de um indivíduo, ou seja, as frações do DNA que codificam para os aminoácidos que irão formar as proteínas.
De acordo com o sequenciamento do exoma, analise as sentenças:
I - É importante avaliar com cuidado os resultados obtidos no sequenciamento do exoma, uma vez que fornece informações relativas a diversas mutações, que não necessariamente são ligadas ao quadro clínico do paciente.
II - Muitas das alterações encontradas no sequenciamento do exoma podem não apresentar relação com patologias, não sendo indicativos de risco até o momento.
III - Este exame pode ser indicado para casais que apresentem consanguinidade, ou para doenças cujo diagnóstico seja inconclusivo em outros exames moleculares e que sejam suspeitos de doenças causadas por múltiplas alterações gênicas.
A Somente a sentença I está correta.
B As sentenças I, II e III estão corretas.
C As sentenças I e III estão corretas.
D As sentenças II e III estão corretas.
E As sentenças I e II estão corretas.

O PCR produz uma série de cópias de um determinado fragmento de DNA ou cDNA de uma maneira bastante rápida e eficiente.
De acordo com essas duas técnicas, analise as sentenças:
I - A PCR qualitativa indica a presença de um fragmento específico de DNA ou cDNA em uma amostra, mas não indica quanto do gene está expresso na amostra.
II - A qPCR é conhecida como PCR em tempo real (quantitativa) e fornece informações precisas relativas à quantidade de expressão de um gene.
III - A PCR qualitativa necessita de um termociclador específico capaz de quantificar a amplificação dos fragmentos de DNA ao final de cada ciclo em tempo real.
A Somente a sentença I está correta.
B As sentenças I e III estão corretas.
C As sentenças II e III estão corretas.
D As sentenças I e II estão corretas.
E As sentenças I, II e III estão corretas.

O universo da atuação das diferentes técnicas de biologia molecular continua avançando e correspondem à grande importância para diversas patologias.
Sobre as técnicas mais específicas em biologia molecular, associe os itens, utilizando o código a seguir:
I- Análise cromossômica por microarranjo.
II- Análise metagenômica do microbioma endometrial.
III- Sequenciamento do exoma.
( ) Teste que avalia a composição bacteriana intrauterina, através do sequenciamento NGS.
( ) Avaliação realizada em regiões codificadoras no genoma humano, otimizando o diagnóstico de doenças genéticas. Para sua aplicação, é necessário uma série de ferramentas avançadas de bioinformática e de bancos de dados atualizados.
( ) Técnica que identifica alterações cromossômicas muito pequenas, referentes ao número de cópias de diferentes regiões dos cromossomos, detectando deleções ou duplicações no DNA.

[Laboratório Virtual - RT-PCR] As variações da técnica de PCR incluem a RT-PCR como método valioso para inúmeros fins científicos.
Sobre essa técnica, analise as sentenças a seguir:
I- A RT-PCR utiliza um pequeno oligonucleotídeo de fita simples com 18 a 20 nucleotídeos.
II- Podem-se utilizar iniciadores ou random primers (iniciadores aleatórios) para servirem de iniciação para a ação da RT para todos os tipos de RNA.
III- Para a realização da técnica de RT-PCR, inicialmente há a necessidade de extrair os RNAs das células e/ou tecidos na amostra biológica.
A Somente a sentença II está correta.
B Somente a sentença III está correta.
C As sentenças I, II e III estão corretas.
D Somente a sentença I está correta.
E As sentenças II e III estão corretas.

Com o exame de biópsia líquida, é possível investigar diferentes tipos de alterações, incluindo polimorfismos, deleções e inserções em até 120 genes relacionados a tumores.
Sobre a biópsia líquida, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas:
I- Os resultados obtidos pela biópsia líquida permitem antever um quadro de evolução do câncer e, assim, determinar a intervenção adequada, melhorando o prognóstico do paciente.
II- A principal desvantagem da biópsia líquida é que a análise do DNA livre circulante de origem tumoral permite uma análise inicial de pacientes em tratamento. Ou seja, não é possível monitorar novas mutações, que normalmente, podem resultar em ineficácia terapêutica.
A As asserções I e II são verdadeiras, mas a II não é uma justificativa correta da I.
B A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira.
C A asserção I é uma proposição verdadeira e a II é uma proposição falsa.
D As asserções I e II são falsas.
E As asserções I e II são verdadeiras, e a II é uma justificativa correta da I.

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