Vamos analisar cada afirmativa sobre a Lei nº 12.651/2012: I. As APPs devem ser preservadas mesmo quando não há vegetação nativa presente, pois sua função ecológica independe da cobertura atual. Verdadeiro, as Áreas de Preservação Permanente (APPs) devem ser preservadas independentemente da presença de vegetação nativa, devido à sua função ecológica. II. A Reserva Legal deve ser registrada e pode ser manejada sustentavelmente, desde que respeite os limites definidos por bioma. Verdadeiro, a Reserva Legal deve ser registrada e seu manejo deve respeitar as normas estabelecidas para cada bioma. III. O CAR é um instrumento obrigatório para empreendimentos urbanos com mais de 5.000 m² de área construída. Falso, o Cadastro Ambiental Rural (CAR) é obrigatório para propriedades rurais, e não especificamente para empreendimentos urbanos. IV. O Novo Código Florestal prevê mecanismos de compensação ambiental, como a recomposição em outras áreas. Verdadeiro, o Novo Código Florestal realmente prevê mecanismos de compensação ambiental. V. A porcentagem da Reserva Legal varia conforme a região do país, sendo maior na Amazônia Legal. Verdadeiro, a porcentagem da Reserva Legal varia de acordo com a região, sendo maior na Amazônia Legal. Agora, vamos compilar as afirmativas corretas: I, II, IV e V são verdadeiras. Portanto, a alternativa correta que contém todos os itens verdadeiros é: não há uma alternativa específica listada, mas os itens corretos são I, II, IV e V. Se precisar de mais informações ou se houver alternativas específicas, por favor, forneça-as!