Para responder a essa pergunta, precisamos analisar as opções em relação ao contexto de uma autoridade julgadora e a comissão processante. a) Quando houver dúvidas sobre a inocência do servidor - Isso não é suficiente para afastar as conclusões, pois a dúvida não implica necessariamente em erro nas conclusões da comissão. b) Em qualquer caso e sem necessidade de motivação - Isso não é correto, pois a autoridade julgadora deve ter uma justificativa para afastar as conclusões. c) Quando as conclusões da comissão forem contrárias às provas dos autos - Esta opção é válida, pois se as conclusões não estão alinhadas com as provas apresentadas, a autoridade pode sim afastá-las. d) Apenas em casos de nulidades no processo disciplinar - Embora nulidades possam levar ao afastamento, não é a única situação em que isso pode ocorrer. Portanto, a opção correta é: c) Quando as conclusões da comissão forem contrárias às provas dos autos.