O ácido carboxílico se desprotona primeiro dos aminoácidos devido a seu alto valor de pKa e sua característica de perder prótons, devido à ressonância. A desprotonação ocorrre quando há remoção de um proton (ion hidrogênio H+) de uma molécula, formando a base conjugada.
É sempre uma ordem que se segue:
1. Grupo carboxila do Carbono alfa 2. Gp. carboxila do radical(se tiver) 3. Grupo amina do carbono alfa 4. Grupo amina do grupo radical (Se houver)
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