A conformação espacial em alfa-hélice é uma configuração em que a cadeia polipeptídica adquire um formato helicoidal.
Como os aminoácidos que compõem uma cadeia polipeptídica possuem oxigênios com coordenação parcialmente livre (ou seja, podem ser reativos) e hidrogênios covalentemente ligados a um elemento muito eletronegativo (que é o oxigênio), então é comum a formação de pontes de hidrogênio ao longo de toda a cadeia.
Neste caso, o oxigênio livre de um aminoácido atrai o hidrogênio livre de um outro aminoácido presente na cadeia. E este processo se repete inúmeras vezes. Como as pontes de hidrogênio não ocorrem entre aminoácidos muito próximos, então existe um dobramento (especificamente helicoidal) que se origina em prol da formação dessas interações. Essa configuração final é a configuração de alfa-hélice e, como visto, ela é completamente sustentada por pontes de hidrogênio.
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