Porque, se vc voltar lá pra biologia, na parte de reprodução, vc verá que, ao haver fertilização, apesar de todo o material do espermatozoide ser arrastado para o citoplasma ovular, apenas o núcleo e os corpos basais do flagelo serão aproveitados. O restante (resto da cauda e mitocôndrias) degeneram. Quando ocorre a cariogamia (união dos pronúcleos masculino e feminino) para finalmente originar o zigoto, as mitocôndrias presentes (e as que serão originadas) serão aquelas provindas unicamente do oócito (antigo óvulo). Por isso a herança mitocondrial é dita herança materna... Simplesmente porque as mitocôndrias que estavam presentes no início do seu processo vital vieram do óvulo de sua mãe!!
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