As unidades estruturais dos rins que realmente produzem urina são as néfrons , dos quais existem aproximadamente 1.000.000 em cada rim. Cada néfron é um longotúbulo (ou tubo extremamente fino) que é fechado, expandido e dobrado em uma estrutura de parede dupla em uma extremidade. Essa estrutura, chamada decápsula corpuscular renal , ou cápsula de Bowman, inclui um grupo de capilares (vasos sanguíneos microscópicos) chamado deglomérulo .
A cápsula e o glomérulo juntos constituem um corpúsculo renal , também chamado de corpo malpighiano. O sangue flui para dentro e para longe do glomérulo através de pequenas artérias (arteríolas) que entram e saem do glomérulo através da extremidade aberta da cápsula. Essa abertura é chamada depólo vascular do corpúsculo.
Os túbulos dos néfrons são de 30 a 55 milímetros (1,2 a 2,2 polegadas) de comprimento. O corpúsculo e a porção inicial de cada túbulo, chamados detúbulo contorcido proximal , encontram-se no córtex renal. O túbulo desce em uma pirâmide renal , faz uma curva em forma de U e retorna ao córtex em um ponto próximo ao ponto de entrada na medula.
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