No caso de ácidos graxos insaturados dois passos adicionais ocorrem antes da oxidação normal: Conversão do isômero cis em trans e a saturação pela adição de água. **No caso da insaturação se localizar num carbono par, é necessária a intervenção da 2,4-dienoil-CoA reductase e no caso de se localizar num carbono ímpar, *Delta*(2)-enoil-CoA isomerase.
**Portanto, as enzimas que desfazem as duplas ligações dos ácidos graxos insaturados que serão oxidados são a 2,4-dienoil-CoA reductase e Delta*(2)*
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