Os ácidos graxos são convertidos em triacilglicerol novamente, e organizados em partículas poliprotéicas chamadas quilomicrons, que são liberadas nos vasos linfáticos, por onde serão transportados até os vasos maiores, alcançando outros tecidos. Os triacilgliceróis dos quilomícrons podem ser incorporados aos adipócitos ou serem degradados a ácidos graxos livres e glicerol. A maioria das células pode oxidar ácidos graxos para produzir energia.
Os ácidos graxos têm que sofrer ativação no citosol convertendo-se em acil CoA gordo para passar através da membrana mitocondrial com a ajuda de carnitina (presente como L-carnitina , o estereoisômero ativo) após o qual eles sofrem β-oxidação na mitocôndria. A acil-CoA gorda formada no citosol também pode ser utilizada para a síntese de fosfolípidos e triacilgliceróis.
O processo de ativação e transporte através do transporte de carnitina desses ácidos graxos é discutido em detalhes abaixo com a ajuda de uma animação.
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