À medida que os prótons se acumulam, eles criam uma força motriz de prótons , um tipo de pressão eletroquímica. Essa pressão é revivida através de complexos proteicos especializados, que capturam a energia dos prótons à medida que fluem para o outro lado da membrana. A energia é então usada para ligar um grupo fosfato à molécula adenosina difosfato (ADP), criando adenosina trifosfato (ATP).
Para que a cadeia de transporte de elétrons possa bombear prótons para um lado da membrana interna mitocondrial, ela deve primeiro ter uma fonte desses elétrons e prótons. Existem vários processos celulares que levam à oxidação ("queima") de várias fontes de alimentos celulares. Esses processos incluem glicólise , ciclo do ácido cítrico , metabolismo da beta- oxidação de ácidos graxos e oxidação de aminoácidos.
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