Os lipídios são quebrados antes de entrar na mitocôndria, apenas os ácidos graxos irão entrar na mitocôndria, e para isso eles precisam ser carreados pela carnitina.

Após chegarem na membrana interna das mitocôndrias, os ácidos graxos irão sofrer beta-oxidação, que é a oxidação da cadeia carbônica em pares.

Esses pares de carbono irão se ligar a uma coenzima A, formando Acetil-CoA, e irão para o ciclo de Krebs, onde essa molécula será oxidada, formando poucos ATP's, coenzimas carreadores de elétrons e dióxido de carbono.

Espero ter ajudado!