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1 NEAD – Núcleo de Educação a Distância ROTAS DE APRENDIZAGEM Biologia Molecular Básica| Introdução ao DNA | Aula 01 Onde Chegar • Entender como a ciência se desenvolveu no caminho da descoberta do DNA • Conhecer a estrutura molecular do DNA • Compreender de que forma o DNA o se organiza dentro da célula O que Aprender • A origem do DNA: Dogma da biologia molecular (Crick) e a Dupla Hélice (Watson) • A estrutura química dos nucleotídeos que compõem o DNA • A forma como o DNA se compacta dentro da célula e a sua importância para transferência da informação genética AULA 01 Introdução ao DNA Biologia Molecular Básica 2 NEAD – Núcleo de Educação a Distância ROTAS DE APRENDIZAGEM Biologia Molecular Básica| Introdução ao DNA | Aula 01 Desenvolvimento O processo da evolução científica ao longo do tempo nos ajuda a compreender os conceitos e a nomenclatura dos elementos que atualmente conhecemos como genoma humano e seus desdobramentos. Em 1869, Friederich Miescher, um bioquímico suíço que trabalhava na Alemanha, isolou a partir de bandagens impregnadas de pus fornecidas por um hospital local uma substância que denominou “nucleína”. O pus é formado principalmente por glóbulos brancos, células nucleadas que proporcionaram uma fonte rica em DNA associado com proteínas. Mais tarde esta descoberta foi colocada em xeque uma vez que o que ele chamou de nucleína era encontrada somente nos cromossomos. Paralelamente, os cromossomos foram reconhecidos como estruturas dinâmicas nas células, capazes de se individualizar na divisão celular, associados a perpetuação da célula. Como as moléculas de DNA são enormes elas são empacotadas em cromossomos para que desta forma possam compor o núcleo das células eucarióticas. No slide 2 encontra-se a imagem do DNA corado com um corante fluorescente (DAPI), que se liga ao DNA, podendo ser visualizado ao microscópio. Nota-se que o DNA é visualizado somente quando forma uma estrutura cilíndrica compactada, na preparação para divisão celular. Na célula em repouso não é possível distinguir os cromossomos idênticos por estarem na conformação estendida. A compactação do DNA é dependente de moléculas auxiliares, denominadas histonas, que servem como alicerce para o DNA se enrolar. Avance até os slides 10 e 11 para visualização dos cromossomos e a participação deles na divisão celular. Em 1940, experimentos foram realizados para demonstrar que o DNA é transmitido para gerações futuras, ou seja, foi definido como um elemento responsável para transferência da informação genética. Nestes experimentos duas cepas bacterianas de diferentes patogenicidades foram injetadas separadamente em camundongos. A cepa mais agressiva causava pneumonia e foi capaz de matar os camundongos, enquanto a menos agressiva não levava os camundongos a óbito. Mesmo quando a cepa agressiva foi inativada pelo calor, ela foi capaz de transferir o material genético para as cepas menos 3 NEAD – Núcleo de Educação a Distância ROTAS DE APRENDIZAGEM Biologia Molecular Básica| Introdução ao DNA | Aula 01 agressivas, transformando-as e levando os camundongos à morte. Interessantemente o “princípio transformante” parecia ser uma substância resistente ao calor a ao efeito de proteases, o que descartava por completo a existência de proteínas na composição do DNA (Slide 2). Conceitos como os que foram definidos por Erwin Chagaff (1905-2002) contribuíram para a descoberta de Watson. Chagaff analisou o DNA de diferentes espécies, determinando sua composição de bases A T, C e G. Em qualquer DNA a porcentagem da base timina é sempre idêntica à da base adenina, enquanto a porcentagem da base citosina é sempre idêntica à da base guanina (Slide 3). A descoberta do século XX foi realizada por Francis Crick e James Watson. Os pesquisadores usaram os dados de Rosalind – sem o conhecimento e aprovação dela – e escreveram o artigo pioneiro em 1953, publicado na revista Nature. A descoberta de que o DNA era composto de duas fitas de um polímero enroladas como uma hélice tornou aparente o potencial para replicação e armazenamento para a informação hereditária (Slide 4). Segundo o modelo proposto por Watson e Crick, a molécula de DNA é constituída por duas cadeias polinucleotídicas dispostas em hélice ao redor de um eixo imaginário, girando para a direita (uma hélice dupla) (Slide 5). O DNA é composto de quatro tipos de nucleotídeos, ligados covalentemente, formando uma cadeia polinucleotídica (uma fita de DNA), com um esqueleto de açúcar-fosfato a partir do qual as bases (A, C, G e T) se estendem. Uma molécula de DNA é composta de duas fitas de DNA unidas por ligações de hidrogênio entre as bases pareada. Na figura apresentada no slide 5 e 6, as setas nas extremidades das fitas de DNA indicam as polaridades das fitas, que são antiparalelas entre si na molécula de DNA. A forma e a estrutura química das bases permitem que sejam formadas duplas ligações entre A e T, e três ligações entre C e G, definidas por pontes de hidrogênio. Os nucleotídeos são ligados covalentemente por ligações fosfodiéster pelo grupo 3'- hidroxila (-OH) de um açúcar e o grupo 5'-hidroxila (P) do próximo açúcar. Assim, cada fita polinucleotídica tem uma polaridade química. A extremidade 5' do DNA é, por 4 NEAD – Núcleo de Educação a Distância ROTAS DE APRENDIZAGEM Biologia Molecular Básica| Introdução ao DNA | Aula 01 convenção, ilustrada, carregando o grupo fosfato, enquanto a extremidade 3'é ilustrada com um grupo hidroxila (Slide 6). Ainda estas estruturas podem parear entre sim (pareamento de bases intra-cadeiras), formando estruturas alternativas (Slide 7). Por convenção a sequência de nucleotídeos é sempre escrita da extremidade 5’ para a 3’ e deve ser lida da esquerda para a direita e nas linhas sucessivas em direção ao final da página como é lido um texto normal. Na figura apresentada no slide 8, as sequências de DNA destacadas em amarelo mostram as três regiões do gene que codificam a sequência de aminoácidos da proteína beta-globina. O genoma humano 3,2 x 109 pares de bases, alinhado em 46 cromossomos que esticados correspondem a quase 2 metros. A compactação do DNA na forma de cromatina permite que célula humana contenha aproximadamente 2 metros de DNA dentro do diâmetro do núcleo de uma célula humana que é em torno de 6 m (Slide 9). As histonas são responsáveis pelo primeiro nível de compactação, chamado nucleossomo. Neste complexo existem 8 proteínas histonas no qual estão enrolados 147 pares de nucleotídeos (Slide 10). As histonas são ricas em aminoácidos positivos, o que explica sua ligação firma ao DNA, que é rico em cargas negativas dos açúcares e dos fosfatos. A quantidade de informação que está contida nos genomas é surpreendente! Lembramos o conceito de GENE: são segmentos de DNA que exercem função clara de codificação de proteína ou RNA. Além disso, o genoma humano contém informações para mais de 30.000 proteínas distintas. O conjunto total de cromossomos é chamado cariótipo (Slide 10). Para formar um cromossomo funcional, uma molécula de DNA deve fazer mais do que simplesmente transportar os genes. Ela deve ser capaz de replicar, e as cópias replicadas devem ser separadas e fielmente divididas entre as duas células-filhas a cada divisão celular. Esse processo ocorre por meio de uma série de estágios ordenados conhecidos coletivamente como ciclo celular, que fornece uma separação temporal entre a duplicação dos cromossomos e sua separação entre as duas células-filhas (Slide 11). A condensação dos cromossomos na divisão celular tem um papel muito importante e está relacionada a progressão do ciclo celular. Os cromossomos interfásicos estão 5 NEAD – Núcleo de Educação a Distância ROTAS DE APRENDIZAGEM Biologia Molecular Básica| Introduçãoao DNA | Aula 01 dispostos como finas fitas emaranhadas, menos compactados e nesta fase irão se duplicar. Durante a fase M, a expressão genica é suspensa, e ocorrem modificações específicas nas histonas que auxiliam na reorganização da cromatina, à medida que esta é compactada. Quando a condensação é completada (na metáfase), as cromátides-irmãs estão desemaranhadas umas das outras e dispostas lados a lado. Assim, as cromátides- irmãs podem ser facilmente separadas quando a maquinaria mitótica puxa uma para cada lado. Ainda, a compactação dos cromossomos protege as moléculas de DNA, relativamente frágeis, de quebras no momento da separação entre as células-filhas (Slide 11). Ao longo desta aula, descobrimos a estrutura molecular do DNA, de que forma ele se organiza dentro da célula e ainda que a função do material genético é armazenamento e transmissão da informação genética para os descendentes. Para tanto, o dogma de Crick mostra que o fluxo da informação genética segue a seguinte direção: DNA → RNA→ PROTEÍNAS. Ainda, uma sequência de um ácido nucléico pode formar uma proteína, entretanto o contrário não é possível (Slide 12). O material genético deve controlar o desenvolvimento do fenótipo do organismo, seja esse um vírus, uma bactéria, uma planta ou um animal, ou seja, o material genético deve dirigir o crescimento e a diferenciação do organismo a partir do zigoto unicelular até o adulto maduro. Para controlar esse processo, o material genético deve não apenas se expressar acuradamente, mas cada gene deve agir no momento e no local precisos, garantindo que o fígado seja formado por células hepáticas, o sistema nervoso, por células nervosas e assim por diante. Vá mais Longe Capítulo Norteador: Capítulo 4 – DNA, Cromossomos e Genomas. ALBERTS, B; JOHNSON, A; LEWIS, J; RAFF, M; ROBERTS, K; WALTER, P. Biologia Molecular da Célula. 6. ed., Artmed, 2017. https://revistapesquisa.fapesp.br/materia-desvendada/ https://revistapesquisa.fapesp.br/materia-desvendada/ 6 NEAD – Núcleo de Educação a Distância ROTAS DE APRENDIZAGEM Biologia Molecular Básica| Introdução ao DNA | Aula 01 https://pt.khanacademy.org/science/biology/classical-genetics/molecular-basis-of- genetics-tutorial/v/dna-deoxyribonucleic-acid Agora é sua Vez! Interação Agora que você possui a visão geral do DNA. Organize um quadro com as principais características químicas e a sequência de organização do DNA para que este seja acondicionado dentro das células eucarióticas. Questão para simulado Em relação ao DNA de dupla hélice, é INCORRETO afirmar que: a) A estabilidade da estrutura terciária do DNA depende das ligações de hidrogênio formadas entre os pares de bases e interações hidrofóbicas. b) Duas ligações de hidrogênio são formadas entre A e T, enquanto três são formadas entre G e C. c) A temperatura de desnaturação de uma molécula de DNA aumenta com a percentagem de pares de base A–T. d) Na célula viva, a cromatina usualmente adota a forma de colar de pérolas (“beads- on-a-string”). e) O DNA de dupla-hélice pode associar-se a histonas e formar nucleossomas. RESPOSTA CORRETA: (c) Comentário: As ligações não covalentes do tipo pontes de hidrogênio, que mantêm a estrutura da dupla-hélice, podem ser desfeitas pelo calor, por pH muito ácido ou muito básico, ou por exposição a baixas concentrações de sais. Quando as pontes de hidrogênio são rompidas, as duas cadeias polinucleotídicas se separam em um processo denominado desnaturação. Os pares G-C são unidos por três pontes de hidrogênio e são, portanto, mais difíceis de serem separados no processo de desnaturação. Assim, quanto maior for o conteúdo de pares G-C em uma molécula de DNA maior será́ a energia necessária para separar as cadeias. Organize-se: 6 horas semanais – mínimo sugerido para autoestudo https://pt.khanacademy.org/science/biology/classical-genetics/molecular-basis-of-genetics-tutorial/v/dna-deoxyribonucleic-acid https://pt.khanacademy.org/science/biology/classical-genetics/molecular-basis-of-genetics-tutorial/v/dna-deoxyribonucleic-acid 7 NEAD – Núcleo de Educação a Distância ROTAS DE APRENDIZAGEM Biologia Molecular Básica| Introdução ao DNA | Aula 01 REFERÊNCIAS CORDEIRO, CLARICE FOSTER – Fundamentos de Biologia Molecular e Celular, 1. ed. Intersaberes, 2020. LODISH, H; BERK, A; KAISER, C.A; KRIEGER, M; BRETSCHER, A; PLOEGH, H; AMON, A. Biologia Celular e Molecular. 7. ed. Artmed, 2014. MARK SANDERS, JOHN BOWMAN - Análise genética: uma abordagem integrada, 1. ed. Pearson, 2014. MICKLOS, D. A.; FREYER, G. A. & CROTTY, D. A. A Ciência do DNA. 2. ed. Porto Alegre, Artmed, 2005.