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20/08/2021 1 ENTENDENDO MAIS SOBRE VÍRUS Biomedicina Interdisciplinar Aula 02 Prof. Giovani REFERÊNCIASANTIGASA DOENÇASVIRAIS 1580-1350B.C.700B.C. ©Principles of Virology, ASM Press 36 37 20/08/2021 2 IMUNIZAÇÃO • Variolação ‐ China (século XI), Lady Montagu (1700s) • Sem conhecimento do agente • Sobreviventes da varíola protegidos contra a doença • 1790s ‐ Edward Jenner ‐ vacinação CONCEITODE MICRORGANISMOS • Leeuwenhoek (1632 ‐ 1723) • Pasteur (1822 ‐ 1895) • Koch (1843‐1910) ©Principles of Virology, ASM Press 38 39 20/08/2021 3 ©Principles of Virology, ASM Press A DESCOBERTADOS VÍRUS ‐AGENTESQUE ERAMFILTRADOS ©Principles of Virology, ASM Press • 1892 ‐ Ivanovsky • 1898 ‐ Beijerinck: contagium vivum fluidum • Vírus: veneno, líquido viscoso Tobacco mosaic virus (TMV) 40 41 20/08/2021 4 A DESCOBERTADOS VÍRUS • 1898 ‐ Loeffler & Frosch ‐ agente da febre aftosa (foot and mouth disease) é filtrado • Conceitos‐chave: agentes não são apenas pequenos, mas replicam‐se apenas no hospedeiro e não em meio de cultura isolado • Filtro de 0,2 micrometros (m, um milionésimo do metro) A DESCOBERTA DOS VÍRUS ©Principles of Virology, ASM Press • 1901 ‐ primeiro vírus humano, febre amarela • 1903 ‐ vírus da raiva • 1906 ‐ vírus da varíola • 1908 ‐ chicken leukemia virus, poliovirus • 1911 ‐ Rous sarcoma virus • 1915 ‐ bacteriófago • 1933 ‐ vírus influenza 42 43 20/08/2021 5 Qual dos conceitos a seguir foi fundamental para distinguir vírus de microrganismos? a) Vírus eram grandes demais para passar por poros de filtros de 0,2 micrômetros. b) Vírus eram capazes de se replicar em meios de cultura específicos. c) Vírus deixavam plantas de tabaco doentes. d) Vírus eram pequenos o suficiente para passar por poros de filtros de 0,2 micrômetros. e) Vírus foram registrados em microscopia de luz. INTERATIVIDADE 44 45 20/08/2021 6 CLASSIFICAÇÃODE VÍRUS • Natureza e sequência do material genético do vírion • Simetria do capsídeo proteico • Presença ou não de membrana lipídica (envelope) • Dimensões do vírion e capsídeo ©Principles of Virology, ASM Press Sistema hierárquico clássico: Reino Filo Classe Ordem (-virales) ‐Mononegavirales Família (-viridae) ‐ Filoviridae Gênero (‐virus) ‐ Ebolavirus Espécie ‐ Zaire ebolavirus CLASSIFICAÇÃODE VÍRUS 46 47 20/08/2021 7 SIMPLICIDADEE ORDEM • Uma vez que vírus são parasitas intracelulares obrigatórios, todos os genomas virais funcionam somente após sua replicação dentro de uma célula • Todos os vírus devem produzir um mRNA que possa ser traduzido pelos ribossomos do hospedeiro: eles são parasitas da maquinaria de síntese de proteínas do hospedeiro O CÓDIGO GENÉTICO VIRAL É COMPOSTO POR ÁCIDOS NUCLEICOS Virologybreakthroughinthe 1950’s: Hershey-Chase experiment with phage T4 Fraenkel-Conrat’s work withTMV 48 49 20/08/2021 8 Alfred Hershey & Martha Chase, 1952 3 A GRANDE SURPRESA: MILHARES DE VÍRIONS DIFERENTES Complexidade infinita de infecções Entretanto, um número finito de genomas virais 50 51 20/08/2021 9 Esquema geral de infecção Cytoplasm Attachment and entry Translation Release VP0 VP2 VP1 P1 P2 P3 3B(VPg) Endoplasmic reticulum Membrane vesicle Genome replication Assembly Nucleus Entering Cells Viral infection is initiated by a collision between the virus particle and the cell, a process that is governed by chance. Consequently, a higher concentration of virus particles increases the probability of infection. However, a virion may Figure 2.1 The viral infec- tious cycle. The infectious cycle of poliovirus is shown as an exam- ple, illustrating the steps common to all viral life cycles: attachment and entry, translation, genome replication, assembly, and release. See Appendix, Figures 21 and 22 for explanation of abbreviations. <shorturl.at/sBMQY> Dogma Central da Biologia 52 53 20/08/2021 10 FATO RÁPIDO ➤Os genomas virais devem fazer mRNA que consiga ser lido pelos ribossomos do hospedeiro ➤Todos os vírus do planeta seguem esta regra DavidBaltimore(Nobellaureate) ClassificaçãodeBaltimore VII 54 55 20/08/2021 11 DEFINIÇÕES Para tradução, o mRNA é sempre positivo (+) DNA que é equivalente ao mRNA também é positivo (+) As fitas de RNA e DNA complementares a fitas positivas (+) são negativas (‐) Nem todo RNA (+) é mRNA! Sabendo a natureza do genoma viral, é possível deduzir as etapas essenciais que devem ocorrer dentro da célula para a produção do mRNA AelegânciadoSistemadeBaltimore VII 56 57 20/08/2021 12 AS SETE CLASSES DE GENOMAS VIRAIS • dsDNA • dsDNA parcial • ssDNA • dsRNA • ss (+) RNA • ss (-) RNA • ss (+) RNA com intermediário de DNA VII INTERATIVIDADE ➤ Por que o mRNA é colocado no centro da Classificação de Baltimore? a)Porque todas as partículas virais possuem mRNA. b)Não há razão específica. c)Porque todos os genomas virais são de RNA. d)Porque um mRNA deve ser produzido a partir de todos os genomas virais. e)Porque os vírus com genoma ssRNA sempre são positivos (+). 58 59 20/08/2021 13 • • • • • • • • • • • Linear Circular Segmentado Parcial Single-stranded (+) Single-stranded (-) Single stranded, ambisense Double-stranded Com proteínas ligadas covalentemente dsDNA com extremidades com ligação cruzada DNA com RNA covalentemente ligado OsgenomasdeDNAouRNAviraissão estruturalmentediversos AnAOH3’ UTR 5' VPg UTR 4252 3’ 5’ A Linear (+) strand RNA genome of a picornavirus B Genomalinearnãoquer dizer linhareta 60 61 20/08/2021 14 PARA QUE TANTA DIVERSIDADE? • DNA e RNA - Genomas de RNA apareceram primeiro na escala evolutiva (Mundo de RNA) - após resfriamento da Terra Surgimento dos genomas de DNA Os únicos genomas de RNA atualmente no planeta são virais Viróides: Relíquias do mundo de RNA? - - - Influenza virus Reovirus Hepatitis B virus Parvovirus Retrovirus Poliovirus Genomasviraiseexemplos VII Adenovirus Herpes simplex virus 62 63 20/08/2021 15 PARA QUEM TIVER CURIOSIDADE <shorturl.at/hnXZ3> QUE INFORMAÇÃO É CODIFICADA PELO GENOMA VIRAL? Produtos e sinais para: - Replicação do genoma viral ‐ Processamento e empacotamento do genoma ‐ Controle e regulação do ciclo celular ‐ Modulação da defesa do hospedeiro ‐ Possibilidade de se espalhar para outras células e hospedeiros 64 65 20/08/2021 16 Informações que NÃO estão contidas em genomas virais • Não há genes que codificam para todos os elementos da maquinaria síntese proteica (AARS, eIFs, tRNAs) • Não há genes que codificam para o metabolismo energético ou biossíntese de membrana • • Não há centrômeros ou telômeros Será? Talvez ainda não tenhamos encontrado. 90% dos vírus gigantes são recém-descobertos Maioresgenomasconhecidos Virus Length Protein Pandoravirus salinus 2,473,870 2,541 Pandoravirus dulcis 1,908,524 1,487 Megavirus chilensis 1,259,197 1,120 Mamavirus 1,191,693 1,023 Mimivirus 1,181,549 979 Moumouvirus 1,021,348 894 Mimivirus M4 981,813 620 C. roenbergensis virus 617,453 544 Mollivirus sibericum 651,000 523 Pithovirus sibericum 610,033 467 66 67 20/08/2021 17 Menoresgenomasconhecidos Virus Length Protein Viroid 120 none Satellite 220 none Hepatitis delta satellite 1,700 1 Circovirus 1,759 2 Anellovirus 2,170 4 Geminivirus 2,500 4 Hepatitis B virus 3,200 7 Levivirus 3,400 4 Partitivirus 3,700 2 Barnavirus 4,000 7 INTERATIVIDADE ➤ Qual informação pode ser codificada por um genoma viral? a)Produtos que catalisam biossíntese de membrana. b)Produtos que catalisam produção de energia. c)Sistemas completos de síntese proteica. d)Centrômeros e telômeros. e)Enzimas para replicar o genoma viral. 68 69 20/08/2021 18 GENOMAS DE DNA VIRAL • O genoma de todas as células hospedeiras é de DNA Entretanto o DNA viral não é como o de nossos cromossomos • dsDNA • Adenoviridae • Herpesviridae • Papillomaviridae • Polyomaviridae • Poxviridae 70 71 20/08/202119 dsDNA Papillomaviridae (8 kbp) Genomes copied byhostDNApolymerase Genomes encodeDNApolymerase dsDNAparcial reverse transcriptaseRNAprotein This genome cannot be copied tomRNA Hepadnaviridae Hepatitis B virus 72 73 20/08/2021 20 ssDNA TT virus (ubiquitous human virus) B19 parvovirus (fifth disease) INTERATIVIDADE ➤ Qual dos genomas de DNA viral, ao entrar em umacélula, podem ser imediatamente transcritos? a)dsDNA. b)dsDNA parcial. c)ssDNA circular. d)ssDNA linear. e)Todos acima. 74 75 20/08/2021 21 GENOMAS DE RNA • Células não possuem RNA polimerases dependentes de RNA (RdRp) • • Vírus de RNA codificam RdRp RdRp produz genomas de RNA e mRNA a partir de moldes de RNA ClassificaçãodeBaltimore VII 76 77 20/08/2021 22 dsRNA Rotavirus (human gastroenteritis) tozoa, and vertebrates). While dsRNA contains a (+) strand, it cannot be translated as part of a duplex to synthesize viral proteins. The (-) strand of the genomic dsRNA is first cop- ied into mRNAs by a viral RNA-dependent RNA polymerase. Newly synthesized mRNAs are encapsidated and then copied to produce dsRNAs. • Picornaviridae (Poliovirus, Rhinovirus) • Caliciviridae (gastroenteritis) • Coronaviridae (SARS) • Flaviviridae (Yellowfever virus, West Nile virus, Hepatitis C virus) • Togaviridae (Rubella virus, Equine encephalitis virus) ssRNA(+) 78 79 20/08/2021 23 ssRNA(+) Togaviridae include viruses that infect vertebrates. (+) strand RNA genomes usually can be translated directly into protein by host ribosomes. The genome is replicated in two steps. The (+) strand genome is first copied into a full-length (-) strand, and the (-) strand is then copied into full-length (+) strand genomes. In some cases, a subgenomic mRNA is produced. ssRNA(+)com intermediário de DNA Retroviridae Human immunodeficiency virus (HIV) Human T-lymphotropic virus (HTLV) 80 81 20/08/2021 24 Estratégiadosretrovírus provirus – DNA + RNA + RNA DNA In contrast to other (+) strand RNA viruses, the (+) strand RNA genome of retroviruses is converted to a dsDNA inter- mediate by viral RNA-dependent DNA polymerase (reverse transcriptase). This DNA then serves as the template for viral mRNA and genome RNA synthesis by cellular enzymes. There ssRNA(-) •Paramyxoviridae (vírus da rubéola, vírus da caxumba) •Rhabdoviridae (vírus da raiva) •Filoviridae (vírus Ebola, vírus de Marburg) •Orthomyxoviridae (vírus Influenza) 82 83 20/08/2021 25 ssRNA(-) – RNA – RNA+ RNA Unlike (+) strand RNA, (- ) strand RNA genomes cannot be translated directly into protein, but must be first copied to make (+) strand mRNA. There are no enzymes in the cell that can make mRNAs from the RNA genomes of (-) strand RNA viruses. These virus particles therefore contain virus-encoded RNA-dependent RNA polymerases. The genome is also the L R3M Aconsequênciadogenomasegmentado 84 85 20/08/2021 26 GenomasRNAambisense Arenaviridae RNA pol in virion INTERATIVIDADE ➤ Qual afirmação é correta acerca dos genomas virais de RNA? a)Genomas ss(+)RNA podem ser traduzidos para formação de proteínas virais. b) Genomas de dsRNA podem ser imediatamente traduzidos ao infectar uma célula. c)Vírus ss(+)RNA não requerem a formação de um intermediário RNA (-). d) Genomas virais de RNA podemser copiados por RNA polimerases do hospedeiro. e)Todas acima. 86 87 20/08/2021 27 IMPORTANTES DEFINIÇÕES ❖uma célula suscetível tem um receptor para determinado vírus – a célula pode ou não dar suporte à replicaçãoviral ❖uma célula resistente nãotem receptor – pode ou não ser competente à replicação viral ❖uma célula permissível tem a capacidade dereplicar o vírus – a célula pode ou não ser suscetível ❖uma célula suscetível e permissível é a única célula capaz de ser infectada e dar condições para sua replicação Funções celulares 88 89 20/08/2021 28 Estudodo cicloinfecciosodosvírusnas células ✓ Só foi possívelapós 1949 ✓ Enders, Weller e Robbins propagaram Poliovirus em cultura de células humanas ✓ Prêmio Nobel -1954 Cultivo devírus Fibroblastos humanos Fibroblastos de rato Célula epitelial humana (HeLa) Linhagens imortalizadas <shorturl.at/mFYZ6> Figure 2.7 Different types of cell culture used in virology. Confluent cell monolayers photographed by low- power light microscopy. (A) Primary human foreskin fibroblasts; (B) established line of mouse fibroblasts (3T3); (C) continuous line of human epithelial cells (HeLa [Box 2.3]). The ability of transformed HeLa cells to overgrow one another is the result of a loss of contact inhibition. Courtesy of R. Gonzalez, Princeton University. 90 91 20/08/2021 29 Os vírus superaramo dogmade um gene para umaproteína • Vírus podem ter uma expressão gênica muito resumida • Vírus podem fazer múltiplas proteínas a partir de umgene: • Fazendograndes poliproteínas e clivando-as em várias proteínasmenores • Possuindo“overlapping reading frames” (diferentes fases deleitura) • Utilizando múltiplos sítios para começar a tradução <shorturl.at/sBMQY> • • Influenza virus - 1933 Em 2005, o RNA do vírus Influenza (H1N1 - gripe espanhola de 1918) foi isolado de tecidos emblocados em parafina, provenientes de uma autópsia realizada em 1918 • O RNA viral também foi isolado a partir de biópsias de cadáveres enterrados no permafrost desde 1918 O sequenciamento completo indicou a presença de 8 segmentos diferentes de RNA O vírus pôde ser reconstruído ao se transfectar células com 8 plasmídeos recombinantes distintos, cada um contendo uma das sequências do genoma viral • • 92 93 20/08/2021 30 ©Principles of Virology, ASM Press Virologiasintéticaebiossegurança <shorturl.at/fnyP0> <shorturl.at/jrsJR> LEGAL, NÃO? Obrigado pela atenção! 94 95
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