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Profa. Dra. Enny Silva UNIDADE I Bioquímica Estrutural A água é de fundamental importância para a sobrevivência dos seres vivos e nos seres humanos constitui, aproximadamente, de 60 a 70% da massa corporal, como mostra a figura a seguir. Conceitos básicos sobre água Fonte: Adaptada do livro-texto. Ligações de hidrogênio H2O + H2O H3O3+ + OH- ou H2O H+ + OH- Ionização da molécula de água Sistema-tampão CO2 (aq) + H2O(l) ↔ H2CO3(aq) ↔ H+(aq) + HCO3-(aq) Bicarbonato/Gás carbônico Hemoglobina/Oxihemoglobina Proteínas ácidas/Proteínas básicas Fosfato monoácido/Fosfato diácido Fonte: Adaptada do livro-texto. C Sangue arterial Gasometria Fonte: Adaptada do livro-texto. Acidose metabólica – pH? – por quê? (causa) Alcalose metabólica – pH? – por quê? (causa) Acidose e alcalose respiratória e metabólica Acidose respiratória – pH? – por quê? (causa) Alcalose respiratória – pH? – por quê? (causa) Acidose e alcalose respiratória e metabólica O organismo utiliza mecanismos para controlar o equilíbrio ácido-básico do sangue. Em primeiro lugar, o excesso de ácido é excretado pelos rins e, em segundo lugar, o corpo usa soluções-tampão no sangue para amortecer as alterações bruscas do pH do sangue. O tampão mais importante do sangue utiliza ácido carbônico-bicarbonato. Caso não seja possível a atuação dos sistemas tampão sanguíneos, uma pessoa pode desenvolver acidose ou alcalose. Caso uma pessoa apresente doenças pulmonares como a asma ou enfisema e comece com os sintomas de dor de cabeça ou sonolência, podendo evoluir para estupor e coma, podemos sugerir que o diagnóstico pode ser: a) Acidose respiratória. b) Acidose metabólica. c) Alcalose respiratória. Interatividade Fonte: Adaptada do livro-texto. d) Alcalose metabólica. e) Apoptose. Desvios do pH 6,85 7,95 7,35 7,45 ACIDOSE ALCALOSE MORTE CELULAR O organismo utiliza mecanismos para controlar o equilíbrio ácido-básico do sangue. Em primeiro lugar, o excesso de ácido é excretado pelos rins e, em segundo lugar, o corpo usa soluções-tampão no sangue para amortecer as alterações bruscas do pH do sangue. O tampão mais importante do sangue utiliza ácido carbônico-bicarbonato. Caso não seja possível a atuação dos sistemas tampão sanguíneos, uma pessoa pode desenvolver acidose ou alcalose. Caso uma pessoa apresente doenças pulmonares como a asma ou enfisema e comece com os sintomas de dor de cabeça ou sonolência, podendo evoluir para estupor e coma, podemos sugerir que o diagnóstico pode ser: a) Acidose respiratória. b) Acidose metabólica. c) Alcalose respiratória. Resposta Fonte: Adaptada do livro-texto. d) Alcalose metabólica. e) Apoptose. Desvios do pH 6,85 7,95 7,35 7,45 ACIDOSE ALCALOSE MORTE CELULAR Funções das proteínas Enzimas Hormônios Estrutural Defesa Coagulação Transporte Armazenamento Toxina Movimento Citocina Moléculas sinalizadoras Receptores Aminoácidos e proteínas Aminoácidos Fonte: Adaptada do livro-texto. 1. Quanto ao R; 2. Quanto ao destino da cadeia carbônica; 3. Necessidade na dieta (essenciais, não essenciais e condicionalmente indispensáveis). Essenciais – arginina, fenilalanina, histidina, isoleucina, leucina, lisina, metionina, treonina, triptofano e valina. Não essenciais (produzidos pelos animais): alanina, asparagina, ácido aspártico (caso esteja ionizado, o aspartato), cisteína, ácido glutâmico (caso esteja ionizado, o glutamato), glutamina, glicina, prolina, serina e tirosina. Classificação dos aminoácidos pH Titulação dos aminoácidos Gotas de NaOH adicionadasGotas de HCl adicionadas Fonte: Adaptada do livro-texto. Outras funções dos aminoácidos Fonte: Adaptada do livro-texto. TIROSINA L-DOPA DOPAMINA NORADRENALINA A: TIROSINA HIDROXILASE; B: DOPA DESCARBOXILASE; C: DOPAMINA BETA-HIDROXILASE Fenilalanina Tirosina Fenilalanina hidroxilase Outras funções dos aminoácidos Fenilalanina Fenilalanina hidroxilase Tirosina L-Dopa Dopamina Noradrenalina Adrenalina Fonte: Adaptada do livro-texto. Histidina Histamina N NH2 CO2 CO2H N NH2 N H H N Triptofano Serotonina A curva da imagem ao lado representa a titulação de um aminoácido. Baseado na figura, a única alternativa que mais se aproxima da resposta correta seria: a) É um aminoácido essencial do tipo apolar. b) Pode ser o aminoácido lisina (polar positivo). c) Pode ser o aminoácido ácido glutâmico (polar negativo). d) Ocorre desnaturação do aminoácido em pH ácido e básico. e) Pode ser um aminoácido com 2 radicais carboxila em sua fórmula estrutural. Interatividade Fonte: Adaptada do livro-texto. pH 13 7 0 0 0,5 1 1.5 2 OH- (equivalentes) A curva da imagem ao lado representa a titulação de um aminoácido. Baseado na figura, a única alternativa que mais se aproxima da resposta correta seria: a) É um aminoácido essencial do tipo apolar. b) Pode ser o aminoácido lisina (polar positivo). c) Pode ser o aminoácido ácido glutâmico (polar negativo). d) Ocorre desnaturação do aminoácido em pH ácido e básico. e) Pode ser um aminoácido com 2 radicais carboxila em sua fórmula estrutural. Resposta Fonte: Adaptada do livro-texto. pH 13 7 0 0 0,5 1 1.5 2 OH- (equivalentes) Níveis estruturais das proteínas: Primária Proteínas Fonte: Adaptada do livro-texto. Ligação peptídica (ligação amídica) Dipeptídeo ou dipéptido PROTEÍNADNA Replicação TraduçãoTranscrição Transcrição reversa Níveis estruturais das proteínas: Secundária Proteínas Colágeno – hélice tripla: OH-prolina e OH lisina + vit. C Príon (proteinaceous infection particle) – proteína príon celular normal (PrPc), rica em estrutura α-helicoidal e a proteína patológica defeituosa (PrPSc), na qual prevalecem folhas-β. Fonte: Adaptada do livro-texto. Níveis estruturais das proteínas: Terciária Proteínas Fonte: Adaptada do livro-texto. Ligação iônica Ponte dissulfeto Força de London d a b c Ponte de hidrogênio Níveis estruturais das proteínas: Quaternária Proteínas Fonte: Adaptada do livro-texto. Estrutura primária Estrutura secundária Estrutura terciária 1. Quanto ao número de aminoácidos: oligopeptídeos e polipeptídeos. 2. Quanto à composição: simples e compostas ou conjugadas. 3. Quanto à forma: fibrosas e globulares. Classificação das proteínas Tamanho molecular (diálise e filtração molecular) Solubilidade (“salting out”) Carga (cromatografia de troca iônica e eletroforese) Separação das proteínas A figura abaixo mostra um exemplo de processo de separação de proteínas chamado de eletroforese. A utilização de eletroforese na rotina laboratorial tem sido importante para determinar hemoglobinopatias e talassemias (como na figura), e auxilia no diagnóstico de outras doenças específicas, por exemplo: mieloma múltiplo, Aids, hepatite, além de biologia molecular e enzimopatias. Não se leva em consideração neste tipo de separação: a) Tamanho. b) Carga. c) Solubilidade. Interatividade Fonte: Adaptada do livro-texto d) Carga e tamanho. e) Mais de uma alternativa é correta. 1 2 3 4 5 A F S A2 A figura abaixo mostra um exemplo de processo de separação de proteínas chamado de eletroforese. A utilização de eletroforese na rotina laboratorial tem sido importante para determinar hemoglobinopatias e talassemias (como na figura), e auxilia no diagnóstico de outras doenças específicas, por exemplo:mieloma múltiplo, Aids, hepatite, além de biologia molecular e enzimopatias. Não se leva em consideração neste tipo de separação: a) Tamanho. b) Carga. c) Solubilidade. Resposta Fonte: Adaptada do livro-texto d) Carga e tamanho. e) Mais de uma alternativa é correta. 1 2 3 4 5 A F S A2 Enzimas Fonte: Adaptada do livro-texto. Molécula de substrato liga-se ao sítio ativo Reação ocorre e moléculas produzidas são liberadas E n e rg ia l iv re Reação Não Catalisada Reação Catalisada Caminho da reaçãoCaminho da reação Barreira de energia Barreira de energia Energia Sem enzima Coordenada de reação Fatores que influenciam na atividade das enzimas: T, pH, [E], [S] Temperatura pH Concentração de Enzima Concentração de substrato Fonte: Adaptada do Livro-texto Isoenzimas Fonte: Adaptada do Livro-texto Creatina fosfato Creatina Creatinina Gráfico de Michaelis Menten e Lineweaver Burke Fonte: Adaptada do Livro-texto 1 v 1 V máx. V máx. V máx. 2 1 Km 1 [S] V KM [S] Fonte: Adaptada do Livro-texto Inibidor competitivo Inibidor não competitivo Velocidade Substrato Enzima normal Sem inibidor Sem inibidor As enzimas são substâncias orgânicas de natureza proteica, cuja presença é fundamental para o acontecimento das reações químicas, possibilitando o metabolismo dos seres vivos. A capacidade catalítica das enzimas torna-as adequadas para aplicações industriais, como na indústria farmacêutica ou na alimentar. Em sistemas vivos, a maioria das reações bioquímicas dá-se em vias metabólicas, que são sequências de reações em que o produto de uma reação é utilizado como reagente na reação seguinte. Diferentes enzimas catalisam diferentes passos de vias metabólicas, de forma a não interromper o fluxo nessas vias. Cada enzima pode sofrer regulação de sua atividade, aumentando-a, diminuindo-a ou mesmo interrompendo-a, de modo a modular o fluxo da via metabólica em que se insere. Assinale a alternativa correta que corresponde às enzimas: a) Podem ser dosadas em laboratório e diagnosticar patologias pela sua concentração. b) Elevam a energia de ativação das reações bioquímicas, aumentando sua velocidade. c) Se congeladas serão desnaturadas. d) Sempre estão em estrutura quaternária. e) Modificam a entalpia das reações, tornando-as mais rápidas. Interatividade As enzimas são substâncias orgânicas de natureza proteica, cuja presença é fundamental para o acontecimento das reações químicas, possibilitando o metabolismo dos seres vivos. A capacidade catalítica das enzimas torna-as adequadas para aplicações industriais, como na indústria farmacêutica ou na alimentar. Em sistemas vivos, a maioria das reações bioquímicas dá-se em vias metabólicas, que são sequências de reações em que o produto de uma reação é utilizado como reagente na reação seguinte. Diferentes enzimas catalisam diferentes passos de vias metabólicas, de forma a não interromper o fluxo nessas vias. Cada enzima pode sofrer regulação de sua atividade, aumentando-a, diminuindo-a ou mesmo interrompendo-a, de modo a modular o fluxo da via metabólica em que se insere. Assinale a alternativa correta que corresponde às enzimas: a) Podem ser dosadas em laboratório e diagnosticar patologias pela sua concentração. b) Elevam a energia de ativação das reações bioquímicas, aumentando sua velocidade. c) Se congeladas serão desnaturadas. d) Sempre estão em estrutura quaternária. e) Modificam a entalpia das reações, tornando-as mais rápidas. Resposta ATÉ A PRÓXIMA!