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PLANO DE ENSINO DA DISCIPLINA
Bioinformática Aplicada à Biologia Sistêmica
Câmpus de Botucatu
UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA
Mestrado e Doutorado
Ney Lemke
Aprovada em 16/06/2016
Disciplina:
Docente:
Nível:
Parecer:
4Nº Créditos :
Data Data Desativação:
Carga Horária Total: Carga Horária Teórica: Carga Horária Prática:
Carga Horária Carga Horária Carga Horária Laboratório:
60 0 0
60 0 0
16/06/2016
Programa: Ciências Biológicas (Genética)
0 0Carga Horária ExtraCarga Horária
Conteúdo: Sistemas Biológicos.
Redes Biológicas.
Modelagem de Sistemas Biológicos.
Estimativa de Parâmetros.
Sistemas Gênicos.
Sistemas de Proteínas.
Sistemas Metabólicos.
Sistemas de Sinalização.
Redes Neurais.
Biologia de Sistemas e sua modelagem matemática. Estimativa de Parâmetros. Biologia de
Sistemas Molecular. Redes Neurais
Ementa:
BIBLIOGRAFIA:
BIBLIOGRAFIA BÁSICA
BERTALANFFY, L, TEORIA GERAL DOS SISTEMAS, Vozes, São Paulo, 2008, 360p.
BOWER, J. BOLOURI, H. Computational modeling of genetic and biochemical networks.
Westwood: MIT Press, 2001. 336p.
KÉPES, F. Biological networks, World Scientific: Singapura, 2007. 516p.
PALSSON, B.O. Systems biology: properties of reconstructed networks. 1ed.
Cambridge: Cambridge University Press, 2006. 322 p.
PEVZNER, P. SHAMIR, R. Bioinformatics for biologists. 1.ed. Cambridge University
Press: Reino Unido, 2012. 392p.
VOIT, E.B. A first course in systems biology, Garland: Nova Iorque, 2013. 445p.
BIBLIOGRAFIA COMPLEMENTAR
BAXEVANIS, A.D. OUELLETTE, B.F.F. Bioinformatics: a practical guide to the
analysis of genes and proteins. 3 ed. John Wiley & Sons, Inc.: Nova Iorque, USA.,
2005. 596p.
BROWN, S.M. Nextgeneration
DNA sequencing informatics. 1.ed. Cold Spring
Harbor Laboratory Press: USA, 2013. 256p.
Bibliografia:
PLANO DE ENSINO DA DISCIPLINA
Bioinformática Aplicada à Biologia Sistêmica
Câmpus de Botucatu
UNIVERSIDADE ESTADUAL PAULISTA
Mestrado e Doutorado
Ney Lemke
Aprovada em 16/06/2016
Disciplina:
Docente:
Nível:
Parecer:
CHEN, J.Y. LONARDI, S. Biological data mining 1.ed. Nova Iorque: Chapman &
Hall, 2009. 733 p.
LESK, A.M. Introduction to genomics. 2.ed. Oxford University Press: USA, 2012.
424p.
PEVSNER, J. Bioinformatics and functional genomics, 2.ed. WileyLiss,
2009. 992 p.
Modelar sistemas biológicos usando uma abordagem sistêmica. Construir com base em dados
experimentais redes de interação biológicas, envolvendo genes, proteínas e outras moleculas
de
interesse biológico. Simular computacionalmeente modelos de sistemas biológicos.
Objetivos:
MF=0.3 T +0,3 S+0,4 R
MF =Média Final
T = Trabalho Prático
S = Apresentação de Seminário
R = Relatórios de Experimentos Computacionais
O aluno que obtiver Média Final igual ou superior a 5,0 (cinco inteiros) será considerado
aprovado.
Critérios: