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PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM MICROBILOGIA Disciplina: Utilização de Ressonância Magnética Nuclear para Análise metabolômica de doenças metabólicas e virais. Número de Créditos: 8 Vagas: 15 Disciplina condensada: 3 semanas de segunda a quinta as 9:00 as 17:00hs Docentes responsáveis: Fatima Pereira de Souza EMENTA A proposta da disciplina é discutir a metodologia utilizada na busca de biomarcadores para doenças metabólicas e virais utilizando técnica de ressonância magnética nuclear, para mapear e identificar os diferentes metabolitos gerados. Discutindo a aplicação da metabolômica no diagnóstico de metabólicas principalmente as doenças hepáticas, virais e alteração da microbiota intestinal; Importância do preparo e processamento das amostras para a qualidade das análises metabolômicas por RMN e os resultados obtidos; forma de identificação dos metabolitos e obtenção dos espectros por RMN; Forma de processamento e analise dos espectros, caracterização do perfil metabólico, analise dos componentes principais (PCA), analise dos clostering e montagem da via metabôlomica. OBJETIVOS O objetivo principal da disciplina é auxiliar a compreensão da importância de biomarcadores metabólicos para essas patologias humanas e a importância da qualidade das amostras obtidas, assim como fornecer um panorama geral que vai desde a obtenção, processamento da amostra, obtenção dos espectros, tratamento, interpretação dos resultados e identificação da via metabólica. AVALIAÇAO Serão avaliadas as seguintes atividades: participação do aluno nas discussões em sala de aula, nas aulas práticas e discussão de artigos científicos que serão apresentados pelos alunos. CONTEUDO PROGRAMATICO 1-Metabolismo e doenças hepáticas virais e metabólicas; 2.Metabolismo e doenças virais; 3.Importancia da microbiota para o metabolismo e doenças hepáticas; 4. Obtenção de amostras e processamento das amostras; 5. Obtenção dos espectros de Ressonância; 6. Analise dos espectros de ressonância e analise estatística; 7. interpretação dos resultados obtidos e caracterização dos metabolitos nas vias; 8. Apontar os biomarcadores para cada doenças analisadas; BIBLIOGRAFIA [1] Alves, Rodrigo DAM, et al. "Global profiling of the muscle metabolome: method optimization, validation and application to determine exercise-induced metabolic effects." Metabolomics 11.2 (2015): 271-285. [2] Beckonert, Olaf, et al. "Metabolic profiling, metabolomic and metabonomic procedures for NMR spectroscopy of urine, plasma, serum and tissue extracts." Nature protocols 2.11 (2007): 2692. [3] Issaq, Haleem J., et al. "Analytical and statistical approaches to metabolomics research." Journal of separation science 32.13 (2009): 2183-2199. (análise estatística de metabolomica). [4] Metabolomics, Metabonomics and Metabolite Profiling,editado por William J. Griffiths. [5] Ressonância Magnética Nuclear, Claudia Nascimento, 1ª edição, Blucher, 2016. [6] Sandi Yen, Julie A. K. McDonald, Kathleen Schroeter, Kaitlyn Oliphant, Stanislav Sokolenko, Eric J. M. Blondeel, Emma Allen-Vercoe, and Marc G. Aucoin. Metabolomic Analysis of Human Fecal Microbiota: A Comparison of Feces-Derived Communities and Defined Mixed Communities. Jurnal of Proteome research. 14, 1472-1482. 2014. [7] Shijuan Yan, Jianfeng Huang, Zhongjian Chen, Zongyong Jiang, Xue Li, Zhuang Chen. Metabolomics in gut microbiota: applications and challenges. Sci Bull. 61, 1151-1153. 2016 [8] Owen Cronin, Wiley Barton, Peter Skuse, Nicholas C. Penney, Isabel Garcia-Perez, Eileen F. Murphy, Trevor Woods, Helena Nugent, Aine Fanning, Silvia Melgar, Eanna C. Falvey, Elaine Holmes, Paul D. Cotter, Orla O’Sullivan, Michael G. Molloy, Fergus Shanahan. A Prospective Metagenomic and Metabolomic Analysis of the Impact of Exercise and/or Whey Protein Supplementation on the Gut Microbiome of Sedentary Adults. Msystems, 3, 2018. [9] Kedir N. Turi, Lindsey Romick‐Rosendale, Tebeb Gebretsadik, Miki Watanabe Steven Brunwasser, Larry J. Anderson · Martin L. Moore · Emma K. Larkin· Ray Stokes Peebles Jr. Tina V. Hartert. Using urine metabolomics to understand the pathogenesis of infant respiratory syncytial virus (RSV) infection and its role in childhood wheezing. metabolomic. 2018. [10] Wei Guo, Hor Yue Tan, Ning Wang, Xuanbin Wang, Yibin Feng Deciphering hepatocellular carcinoma through metabolomics: from biomarker discovery to therapy evaluation. Cancer Management and research. 10, 715-734, 2018. [11] Angeles Lopez-Lopez; Angeles Lopez-Gonzalvez; Tomas Clive-Baker; Coral Barbas. A review of validated biomarkers obtained through metabolomics. Expert Review of Molecular Diagnostics Volume 18, 2018. https://www.tandfonline.com/toc/iero20/current https://www.tandfonline.com/toc/iero20/current A review of validated biomarkers obtained through metabolomics. Expert Review of Molecular Diagnostics Volume 18, 2018.
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