Prévia do material em texto
Prof. Alexandre Dias UNIDADE II Bioengenharia e Biotecnologia Aplicadas à Biomedicina O que é biotecnologia? “Utilização dos seres vivos para o desenvolvimento de processos e produtos de interesse econômico e/ou social.” Contextualização João Lúcio de Azevedo et al. (2002). Imunização Soros e vacinas PASSIVA ATIVA Imunização passiva NATURAL • Anticorpos transplacentários (IgG) • Anticorpos no colostro (IgA) ARTIFICIAL Transferência de anticorpos Soros terapêuticos Imunização passiva X ativa PASSIVA: Proteção imediata Curto período de proteção Doença do soro Risco de Aids e hepatite ATIVA: Gerada pelo próprio sistema imune do indivíduo A imunidade e a memória são semelhantes à infecção, mas sem a doença Proteção duradoura Imunização ativa Artificial Organismos atenuados Organismos mortos Fragmentos subcelulares Toxinas DNA Natural Exposição a infecções subclínicas O que é? Imunização ativa que consiste em anteceder a ativação do sistema imunológico do organismo frente às futuras infecções. Expõem o organismo a substâncias relacionadas ao agente infeccioso. Vacinas Prática da imunização em que se estimula o sistema imunológico a formar anticorpos específicos sem que os sintomas da doença sejam induzidos. As células produtoras de anticorpos, os linfócitos, não precisam interagir com o organismo vivo e virulento para serem estimuladas. O simples contato com os antígenos do organismo invasor é suficiente para formar anticorpos. Vacinas Características de uma vacina ideal Vacinas contêm antígenos que são alvos do sistema imunológico. A vacinação deveria gerar uma imunidade efetiva (anticorpos e células T). Vacinas devem produzir imunidade protetora. Bom nível de proteção sem a necessidade de uma dose de reforço. Seguras: uma vacina não pode causar doença ou morte. Considerações práticas: baixo custo por dose. Fácil de administrar. Estável biologicamente. Poucos ou nenhum efeito colateral. Vacinas antes da tecnologia do DNA recombinante. Vacinas inativadas O agente infeccioso é morto antes de ser injetado no corpo. Vacinas atenuadas A virulência do organismo infeccioso é enfraquecida pela seleção de mutantes com a patogenicidade reduzida. Vacina de DNA Imunização pelo DNA Terceira geração de vacinas. O DNA que contém genes que codificam para as proteínas antigênicas é clonado em um plasmídeo sob o controle de um forte promotor. Os plasmídeos são introduzidos no organismo a ser imunizado por meio de injeção diretamente no músculo. O antígeno produzido, quando liberado na circulação, induz a formação de anticorpos e a resposta celular. Vacina de DNA Dispensa o cultivo de agentes patogênicos perigosos. Produção barata – dispensa a purificação da proteína antigênica. Não requer refrigeração, uma vez que a molécula de DNA é estável. Um plasmídeo pode codificar genes para vários antígenos. Vacina de DNA Relacione a segunda coluna com a primeira: 1. Vacina antitetânica 2. Soro antitetânico (__) Contém anticorpos. (__) Contém antígenos. (__) Produz imunidade passiva. (__) Produz imunidade ativa. A resposta correta é: a) 1, 1, 2, 1. b) 1, 2, 1, 1. c) 1, 2, 2, 2. d) 2, 1, 2, 2. e) 2, 1, 2, 1. Interatividade Relacione a segunda coluna com a primeira: 1. Vacina antitetânica 2. Soro antitetânico (__) Contém anticorpos. (__) Contém antígenos. (__) Produz imunidade passiva. (__) Produz imunidade ativa. A resposta correta é: a) 1, 1, 2, 1. b) 1, 2, 1, 1. c) 1, 2, 2, 2. d) 2, 1, 2, 2. e) 2, 1, 2, 1. Resposta Sequenciamento automatizado de ácidos nucleicos História Fonte: livro-texto 1855 1905 1909 1944 1953 1965 1977 1986 1990 1995 2001 2008 2012 Família de sequenciadores – capilar/nova geração Fontes: Thermo e Illumina Co. livro-texto Primer extension with ddNTPs Eletrophones and read O R D E R E D S E Q U E N C E A M P L IF IC A T IO N P R O D U C T S TACGATGTCAACGGTT... Primer Target sequence 5’ 5’ 3’ 3’ ATGCTACAG ATGCTACAGT ATGCTACAGTT ATGCTACAGTTG ATGCTACAGTTGC ATGCTACAGTTGCC ATGCTACAGTTGCCA ATGCTACAGTTGCCAA ATGCTACA Aplicações do sequenciamento genético Microbioma Farmacogenômica Nutrigenômica e nutrigenética Fingerprint Oncologia Definições. Dietas personalizadas. Painel NGS – qualidade de vida. Nutrigenética e nutrigenômica Fonte: livro-texto Nutrigenetic, nutrigenomic and nutripigenetic knowledge for actions SNPs and other structural variants DNA methylation, histone modifications, and miRNA expression. Gene expression profiles Age, gender, ethnicity physiopathological status Microbiome Nutrition (dietary intake, absorption, transport, metabolism, excretion) Physical activity Disease risk prediction Genotype – and phenotype – based personalized treatment Therapy responsiveness Precision nutrition Obesity Dyslipidemia NAFLD CVD T2DM Cancer Others Indicações. Sequenciamento genético da microbiota intestinal. Painel NGS – tratamento personalizado. Microbioma Fonte: livro-texto Firmicutes 91.14% Bacteroidetes 5.58% Other 3.28% Definições. Painéis personalizados. Terapia gênico-específica. Oncologia Fonte: Illumina CO. b) a) Definições. DMD – perspectivas. Terapia gênico-específica. Farmacogenômica Fonte: https://www.humgen.nl/lab-aartsma-rus/frameset.php?frame=applicability.html Deletion exon 45 Reading frame disrupted Pre-mRNA mRNA Premature stopcodon Non functional dystrophin Reading frame restoration for deletions Exon 46 hidden from splicing machinery Reading frame restored Partially functional dystrophin 43 44 43 44 43 44 46 47 4746 47 474443 Marcadores microssatélites Fonte: livro-texto Identificação de pessoas! A nutrigenômica e a nutrigenética são ciências distintas que se relacionam no estudo de obesidade, prevenção de doenças com a utilização de compostos bioativos e demais substâncias correlatas. Nesse cenário, assinale a alternativa incorreta sobre esse assunto: a) Nutrigenética estuda de que maneira a variabilidade genética interfere na resposta individual à dieta. b) Nutrigenômica estuda a influência de nutrientes na expressão de genes. c) Visa a elucidar as funções dos genes e da interação com o meio ambiente. d) Tem a finalidade de promover a saúde e a redução do risco para o desenvolvimento de doenças crônicas (cardiovasculares, câncer, diabetes etc.). e) Não tem finalidade de melhorar a qualidade de vida dos pacientes. Interatividade A nutrigenômica e a nutrigenética são ciências distintas que se relacionam no estudo de obesidade, prevenção de doenças com a utilização de compostos bioativos e demais substâncias correlatas. Nesse cenário, assinale a alternativa incorreta sobre esse assunto: a) Nutrigenética estuda de que maneira a variabilidade genética interfere na resposta individual à dieta. b) Nutrigenômica estuda a influência de nutrientes na expressão de genes. c) Visa a elucidar as funções dos genes e da interação com o meio ambiente. d) Tem a finalidade de promover a saúde e a redução do risco para o desenvolvimento de doenças crônicas (cardiovasculares, câncer, diabetes etc.). e) Não tem finalidade de melhorar a qualidade de vida dos pacientes. Resposta A bioinformática e o estudo das variantes genômicas Fonte: DNA banking and analysis: points to consider. Am J Hum Genet 42:781-783, 1988 (adaptado) This publication is the only final, officially approved "DNA Banking and Analysis" statement of the American Society of Human Genetics (ASHG). Previous versions were drafts and were not intended for circulation, attribution, or citation. These "Points to Consider" are designed to provide accurate and authoritative information in regard to the subject matter covered as of October 9, 1987. They are published with the understandingthat the ASHG is not rendering medical or other professional services. The contents are intended as suggestions only. Users should rely on their own professional judgment or on consultation with other authorities and should ascertain whether more recent information has been disseminated by the ASHG or other authorities. 1. Gerenciar o volume de dados gerados 2. Organizar os dados 3. Analisar as informações obtidas Desafios para a bioinformática Bancos de dados Bancos de Dados Proteinas UNIPROT Ontologia Gene Ontology Expressão gênica ArrayExpress Vias Metabólicas BioCyc Dados Primários GENBANK/ NCBI Dados Genômicos USCS/ ENSEMBL Meta-Data ENTREZ Fonte: livro-texto Bancos mais utilizados em genômica Fonte: livro-texto National Center for Biotecnology Information: Centro Nacional para Informação Biotecnológica dos EUA. Banco de dados central sobre informações genômicas. O GenBank é o principal banco de dados do NCBI e armazena todas sequências disponíveis publicamente de DNA (de sequências pequenas a genomas inteiros), RNA e proteínas. NCBI Fonte: acervo pessoal Medicina personalizada! Prática na genética médica. O diagnóstico é a base para a relação genótipo-fenótipo. Medicamentos inteligentes baseados nas alterações genômicas. O uso dos bancos de dados! “Imagine o seguinte cenário: uma mulher de 25 anos preocupada com sua saúde e com histórico familiar de obesidade procura orientação. Uma equipe multidisciplinar solicita o sequenciamento de seu genoma e analisa os dados com auxílio de um software específico. A análise dos dados revela uma alta probabilidade da paciente desenvolver diabetes quando chegar aos 45 anos. A equipe orienta algumas modificações no estilo de vida, inclusive, de hábitos alimentares” (Dra. Aline de Conti, farmacêutica industrial pela Universidade de São Paulo, 2010). Após a leitura, indique a alternativa que possui a ciência relacionada ao texto. a) Farmacogenômica. b) Tecnologia do DNA recombinante. c) Bioinformática. d) Clonagem terapêutica. e) Nanotecnologia. Interatividade “Imagine o seguinte cenário: uma mulher de 25 anos preocupada com sua saúde e com histórico familiar de obesidade procura orientação. Uma equipe multidisciplinar solicita o sequenciamento de seu genoma e analisa os dados com auxílio de um software específico. A análise dos dados revela uma alta probabilidade da paciente desenvolver diabetes quando chegar aos 45 anos. A equipe orienta algumas modificações no estilo de vida, inclusive, de hábitos alimentares” (Dra. Aline de Conti, farmacêutica industrial pela Universidade de São Paulo, 2010). Após a leitura, indique a alternativa que possui a ciência relacionada ao texto. a) Farmacogenômica. b) Tecnologia do DNA recombinante. c) Bioinformática. d) Clonagem terapêutica. e) Nanotecnologia. Resposta História: próteses dentárias pelas civilizações maia e grega. Entretanto, a fabricação de biomateriais se tornou mais consistente após a Segunda Guerra Mundial, com a migração da utilização de materiais bélicos para a assistência à saúde humana. Assim, de maneira assertiva, a engenharia biomédica atua no constante desenvolvimento de próteses e protótipos para o tratamento de doenças humanas e para o aperfeiçoamento do diagnóstico laboratorial biomédico. O aperfeiçoamento dos biomateriais nos últimos 50 anos colaborou para a recuperação da saúde e qualidade de vida de muitos pacientes. Aplicável a inúmeras doenças, os biomateriais contribuem muito para a construção de estruturas biológicas na substituição ou regeneração de um determinado órgão ou tecido prejudicado. A biotecnologia no processamento de biomateriais e equipamentos biomédicos Biocompatibilidade: Resposta que a utilização de um produto gera no organismo. Assim, quanto menor a resposta alérgica, inflamatória e tóxica de um produto, melhor sua biocompatibilidade. Os biomateriais podem ser classificados em 4 grandes tipos: metálicos, cerâmicos, compósitos e poliméricos. Os biomateriais metálicos são muito utilizados na ortopedia, como as próteses de fêmur e úmero e as placas de sustentação óssea em traumas e fraturas – titânio e aço inoxidável. Os biomateriais cerâmicos são aplicáveis a locais de baixa mobilidade e tensão mecânica. As peças cerâmicas são produzidas com alumina, zircônia, hidroxiapatita e bioglass. Esse tipo de material também é aplicável à prótese, na odontologia e na fabricação de cimento para cirurgias ortopédicas. Biomateriais Os biomateriais poliméricos têm propriedade flexível, podendo adquirir várias formas e é de fácil fabricação. Como matéria-prima, são utilizados o polietileno, o polipropileno, a quitosana e o poli 2 hidroxietilmetacrilato. Esses biomateriais são muito utilizados na oftalmologia, na construção de próteses e de pele. O hidrogel é composto por uma rede polimérica tridimensional reticulada. Esse produto é utilizado na atenção médica e farmacêutica, já que atua na liberação de fármacos, em lentes de contato, no processo cicatricial em curativos e dá sustentação celular para processos regenerativos. Interessantemente, as estratégias atuais de medicina de precisão incluem a coleta de materiais biológicos para estudo genético e seleção do melhor biomaterial a ser utilizado no seu tratamento. Com a definição do perfil genético dos pacientes, o risco de rejeição e efeitos adversos é consideravelmente menor. Biomateriais Os nanomateriais fabricados hoje podem melhorar significativamente as características de materiais em escala maior, em termos de resistência, condutividade, durabilidade e leveza, e podem fornecer propriedades úteis (por exemplo, autolimpante, anticongelante e antibacteriana) e podem funcionar como materiais de reforço para construção ou componentes de detecção para segurança. Os nanomateriais e seu uso na área da saúde Fonte: adaptado de: livro-texto. Atualmente, a maioria dos nanossistemas disponíveis está relacionada ao tratamento de câncer, mas outras aplicações incluem anemia, artrite reumatoide, asma, esclerose múltipla e diabetes. Nanopartículas Metálicas Lipossoma 1943 1978 1993 1994 1857 1965 1990 1993 1996 1999 2002 Micclas NLS CLN Microemulsão Dendrímero Nanoemulsão Nanoesfera Polimerossoma Nanocápsulas A rotina do profissional biomédico que atua em análises clínicas é baseada na realização de exames de hematologia, bioquímica, gasometria, sorologia, imunologia, hormônios, microbiologia e outras especialidades e particularidades de cada serviço de laboratório clínico. As metodologias colorimétricas, nefelométricas e turbidimétricas geralmente são empregadas na bioquímica, com seus grandes equipamentos que realizam diferentes testes em curtíssimo espaço de tempo. Já na hematologia, a impedanciometria, a citometria de fluxo e a citoquímica ganham destaque na contagem de células sanguíneas e sua análise diferencial. Na imunologia, os testes de ELISA, imunofluorescência e quimioluminescência norteiam as rotinas diagnósticas. E assim por diante, todos esses setores, equipamentos e metodologias diagnósticas são a base para o funcionamento de um laboratório baseado na automação. Todo esse parque tecnológico e metodológico está contido na fase analítica dos exames laboratoriais. Equipamentos biomédicos, a interface laboratorial e a gestão da informação laboratorial Ainda, toda essa tecnologia vem acompanhada dos sistemas de interfaceamento laboratorial. Com a tecnologia da informação, atualmente, os resultados laboratoriais que um equipamento automatizado libera por sistemas de comunicação e gerenciamento são automaticamente transferidos para um software, que promove a preparação do laudo em um sistema de gestão da informação. Assim, o biomédico acessa o sistema de liberação de laudos, localiza o teste do paciente e assina/liberao exame. Esse processo está contido na fase pós-analítica do laboratório clínico. Com o desenvolvimento tecnológico, os equipamentos de análises clínicas têm se aperfeiçoado a cada dia: seja pela rapidez e praticidade na realização do teste ou seja com a inovação tecnológica. A seguir, apresentamos duas linhas de equipamentos que atualmente estão modificando a maneira do laboratório clínico se comportar: a linha Point of Care (PoC) e a Química Seca na bioquímica clínica. Equipamentos e tecnologias Linha Point of Care (PoC): A linha de equipamentos Point of Care ganhou destaque na atuação biomédica devido à rapidez na liberação dos resultados dos testes laboratoriais. Na sua linha dispomos de equipamentos de gasometria, bioquímica, uroanálise e hematologia. Esses testes também são conhecidos como testes laboratoriais remotos (TLR), pois esses equipamentos ficam à beira do leito dos pacientes. Como grande vantagem, os testes PoC são realizados em equipamentos portáteis, o que muitas vezes facilita a logística de atendimento. Além disso, a quantidade de amostra biológica necessária para a realização desses testes é muito pequena e dispensa seu transporte até um laboratório. Como desvantagem, destaca-se a falta de controle de qualidade laboratorial, com perda de exatidão e precisão para determinados testes. Sob esse aspecto, Xavier e colaboradores (2016) realizaram uma análise comparativa entre a metodologia PoC e o diagnóstico laboratorial tradicional na dosagem do perfil lipídico de pacientes atendidos em consultórios médicos, encontrando confiabilidade entre os resultados. Equipamentos e tecnologias Com relação às metodologias utilizadas para a realização dos exames no PoC, elas variam conforme o teste laboratorial. Atualmente dispomos de equipamentos com metodologia de reflectometria e ensaios cinéticos para testes bioquímicos. Química seca: A tecnologia de testes bioquímicos “a seco” revolucionou a maneira de se realizar exames laboratoriais e, principalmente, a gestão dos resíduos líquidos tão conhecidos do laboratório clínico. Nessa tecnologia, quando o material biológico é adicionado ao cartucho chip do reagente, ocorre uma reação espectral que o equipamento detecta e mensura. Como falado anteriormente, esse processo não gera resíduos líquidos, pois não utiliza água para a realização do teste. Os consumíveis na parte interna do equipamento e, conforme as amostras são injetadas, as reações químicas são processadas. Com alta taxa de precisão, confiabilidade e rapidez, a análise das amostras acontece por reflectância. O avanço da biotecnologia nesses últimos 50 anos viabilizou um grande boom no desenvolvimento clínico e terapêutico das doenças humanas, com a utilização de soros, vacinas de DNA, fármacos inteligentes, nanopartículas e biomateriais. Nesta unidade, aprendemos sobre a tecnologia da produção de soros e vacinas, e como eles funcionam no nosso organismo. Vimos que existem tipos diferentes de vacinas e que o seu processo de fabricação tem evoluído bastante. Também foram abordados conceitos essenciais em nanotecnologia, como quais são as características dos nanomateriais. Vimos ainda em destaque os lipossomos e as nanopartículas e seu potencial para uso como carreadores de fármacos. Em resumo... A metade final da unidade foi dedicada às novas ferramentas genômicas que têm levado a uma medicina cada vez mais personalizada. Foi abordado sobre como o sequenciamento de nova geração, juntamente com as ferramentas de bioinformática, têm permitido a caracterização inequívoca de variantes genômicas, contribuindo para o tratamento de doenças comuns, como obesidade, diabetes e hipertensão, de maneira individualizada. O chamado “diagnóstico molecular” tem ganhado cada vez mais espaço e pode contribuir para o processo de prevenção e tratamento de doenças com maior eficácia e efetividade. Em resumo... Por definição, biomaterial é qualquer substância ou combinação de substâncias, naturais ou não, que não sejam drogas ou fármacos, utilizadas em aplicações biomédicas e que interagem com sistemas biológicos, que tratam, aumentam ou substituem quaisquer tecidos, órgãos ou funções do corpo. As propriedades individuais conferem ao biomaterial uma interação benéfica com o organismo onde é implantado, exceto: a) O material não desencadeia resposta inflamatória sustentada ou tóxica na sua implantação in vivo. b) O tempo de degradação do material permite a ocorrência do processo de regeneração ou cura do sítio comprometido. c) O material apresenta propriedades mecânicas adequadas à aplicação para que foi indicado e que qualquer variação das propriedades mecânicas decorrente da sua degradação in vivo seja compatível com o processo de regeneração ou restabelecimento do sítio de implantação. d) Eles não devem ser biocompatíveis, biodegradáveis e osteocondutivos. e) Sua degradação não gera produtos tóxicos e que sejam facilmente metabolizados e liberados do corpo. Interatividade Por definição, biomaterial é qualquer substância ou combinação de substâncias, naturais ou não, que não sejam drogas ou fármacos, utilizadas em aplicações biomédicas e que interagem com sistemas biológicos, que tratam, aumentam ou substituem quaisquer tecidos, órgãos ou funções do corpo. As propriedades individuais conferem ao biomaterial uma interação benéfica com o organismo onde é implantado, exceto: a) O material não desencadeia resposta inflamatória sustentada ou tóxica na sua implantação in vivo. b) O tempo de degradação do material permite a ocorrência do processo de regeneração ou cura do sítio comprometido. c) O material apresenta propriedades mecânicas adequadas à aplicação para que foi indicado e que qualquer variação das propriedades mecânicas decorrente da sua degradação in vivo seja compatível com o processo de regeneração ou restabelecimento do sítio de implantação. d) Eles não devem ser biocompatíveis, biodegradáveis e osteocondutivos. e) Sua degradação não gera produtos tóxicos e que sejam facilmente metabolizados e liberados do corpo. Resposta ATÉ A PRÓXIMA!