SIMULADO 01 BIOINFORMATICA

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Disc.: BIOINFORMÁTICA   
Aluno(a): FABIO JOAO TURNES 202108265314
Acertos: 10,0 de 10,0 26/04/2023
Acerto: 1,0  / 1,0
Sobre a técnica de modelagem molecular analise a relação entre as a�rmativas a seguir:
I. O método de modelagem a ser escolhido depende da igualdade.
PORQUE
II. Uma igualdade superior a 25% podemos optar pela modelagem por homologia. Se for abaixo desse valor e tivermos o
enovelamento do molde conhecido usamos modelagem por ab initio, caso não, optamos pela modelagem threading.
A respeito dessas asserções, assinale a opção correta:
As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justi�cativa da I.
A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira.
As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justi�cativa da I.
A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa.
 As asserções I e II são proposições falsas.
Respondido em 26/04/2023 17:02:44
Explicação:
O método de modelagem a ser escolhido depende da identidade, caso seja acima de 25% podemos optar pela modelagem por
homologia, se for abaixo desse valor e tivermos o enovelamento do molde conhecido usamos modelagem por treading, caso não
realizamos a modelagem por ab initio.
Acerto: 1,0  / 1,0
O alinhamento molecular é a técnica importante dentro da bioinformática e para o desenvolvimento de um novo alvo
terapêutico representa a primeira etapa a ser realizada. Com relação ao alinhamento molecular marque a alternativa correta:
É a técnica responsável por alinhar proteínas que serão utilizadas em uma simulação, dentro de um ambiente virtual,
o mais próximo possível da realidade.
 É capaz de identi�car se diferentes espécies possuem alguma relação evolutiva ou gene com função em comum.
 O alinhamento é capaz de modelar proteínas tridimensionais, que irão auxiliar em diversas outras técnicas de
bioinformática.
O alinhamento é capaz de armazenar informações que serão usadas para transcrever o DNA em RNAm.
 Questão1
a
 Questão2
a
https://simulado.estacio.br/alunos/inicio.asp
javascript:voltar();
É a técnica responsável por combinar duas sequencias de DNA ou proteínas para que possamos identi�car qual é a
correta.
Respondido em 26/04/2023 17:03:59
Explicação:
O alinhamento molecular é feito pela correlação de duas ou mais sequencias de DNA ou proteínas, a partir de um algoritmo de
pontuação. Assim podemos identi�car genes que compartilham funções ou determinada ancestralidade, podemos também usar o
alinhamento para encontrar proteínas moldes, durante a etapa de modelagem molecular. O alinhamento não armazenar informações
que serão usadas para transcrever o DNA em RNAm, não compara sequencias para dizer qual é a correta, não realiza o modelamento
de proteínas e não realiza a modelagem molecular, etapa posterior ao alinhamento e não tem a �nalidade de alinhar proteínas o mais
próximo da realidade, e sim encontrar os melhores alinhamentos entre as proteínas já cadastradas no banco de dados.
Acerto: 1,0  / 1,0
A bioinformática é uma disciplina interdisciplinar que apresenta diferentes aplicabilidades e tem sido bastante empregada
para o desenvolvimento de novas metodologias de análise e garantindo diferentes avanços cientí�cos. A seguir são listadas
algumas técnicas da bioinformática. Assinale a alternativa que indica a técnica que tenta prever a atividade biológica de um
composto baseado em equações estatísticas.
Ancoramento molecular
Alinhamento molecular
Dinâmica molecular
 QSAR
Modelagem molecular
Respondido em 26/04/2023 17:05:53
Explicação:
O QSAR é uma técnica estatística de tratamento de dados a partir de descritores, visa buscar uma equação que quando resolvida tenta
prever a atividade de uma molécula nova contra determinado receptor. O alinhamento molecular visa identi�car genes que
compartilham funções ou determinada ancestralidade, podemos também usar o alinhamento para encontrar proteínas moldes,
durante a etapa de modelagem molecular. O ancoramento molecular infere a modelagem molecular, para construir um modelo
tridimensional e é utilizado para obter uma pose do ligante com o alvo e a dinâmica molecular para analisar como as interações
acontecem, mimetizando o organismo.
Acerto: 1,0  / 1,0
Escolha a opção que justi�que por que é importante que o comprimento do produto ampli�cado pela reação de PCR seja maior
que 150 pares de bases (pb).
 Produtos ampli�cados menores que 150pb podem se confundir com restos de primers que não se ligaram ao DNA e
�cam no �nal da eletroforese.
Primers que se ligam ao redor de regiões menores que 150pb formam estruturas secundárias com maior facilidade.
Estabelecer um comprimento mínimo do produto aumenta a especi�cidade da reação.Primers que se ligam ao redor
de regiões menores que 150pb formam estruturas secundárias com maior facilidade.
A temperatura de anelamento para ampli�car uma região menor que 150pb é maior que 72°C.
A enzima Taq DNA polimerase não consegue ampli�car seguimentos de DNA menores que 150pb.
Respondido em 26/04/2023 17:10:49
Explicação:
 Questão3
a
 Questão4
a
O tamanho do produto ampli�cado não interfere na especi�cidade, na formação de estruturas secundárias ou na temperatura de
anelamento. O tamanho ideal do produto da PCR está entre 150 e 1.000 pares de bases (pb). Fragmentos muito pequenos podem ser
confundidos com restos de primers que não se ligaram ao alvo e aparecem no �nal do gel da eletroforese. Por outro lado, se a região
ampli�cada for muito grande, a DNA polimerase pode não conseguir adicionar todos os nucleotídeos necessários, e nesses casos a PCR
não vai funcionar. A Taq tem di�culdade para ampli�car produtos maiores que 1000pb.
Acerto: 1,0  / 1,0
Considere o alinhamento de uma sequência nucleotídica desconhecida em relação a um banco de dados de genes
associados ao desenvolvimento de câncer usando a ferramenta BLAST. A partir dessa situação, são descritas algumas
características desse programa. Assinale a alternativa que retrata a utilização correta dessa ferramenta.
 Quanto menor o valor de e-value, menor a probabilidade de o alinhamento ter sido obtido ao acaso com uma
sequência do banco de dados.
A variação da ferramenta indicada nesse caso é o BLASTp, que compara sequência de nucleotídeos contra um banco
de dados de proteínas.
Caso encontre o e-value igual a 100%, a sequência desconhecida será idêntica à sequência no banco de dados.
Se o valor de e-value for igual a 0.0, o alinhamento deve ser desconsiderado, pois ocorreu ao acaso.
A opção de BLASTn deve ser escolhida, uma vez que compara sequência de aminoácidos contra um banco de dados de
proteínas.
Respondido em 26/04/2023 17:13:42
Explicação:
O valor de e-value diz respeito à signi�cância estatística do alinhamento realizado com a ferramenta BLAST. Valores iguais ou muito
próximos de zero são desejados, pois indicam que a chance daquele alinhamento ter ocorrido ao acaso é muito pequena. A variante
BLASTn usa sequências de nucleotídeos para buscar em banco de nucleotídeos, enquanto a variante BLASTp usa sequências de
aminoácidos para buscar em bancos de proteínas.
Acerto: 1,0  / 1,0
Julgue as a�rmativas a seguir sobre a ferramenta BLAST, usada para alinhamento de sequências e disponível no portal do
NCBI.
I. Muito usada para sequências com apenas alguns trechos/locais conservados.
II. Importante utilizá-la quando duas sequências têm tamanhos próximos, pois toda extensão da sequência será comparada.
III. O alinhamento é feito par a par, comparando apenas duas sequências por vez.
IV. Usada para busca em banco de dados de sequências.
É correto o que se a�rma em:
 I, III e IV.
II e IV.
II, III e IV.
I e II.
II e III.
Respondido em 26/04/2023 17:14:34
Explicação:
O BLAST é uma ferramenta utilizada para o alinhamento de sequências simples (duas sequências) e local (comparadas regiões de maior
similaridade). É indicado para sequências mais divergentes e com tamanhos distintos. O BLASTé aplicado em vários bancos de dados
 Questão5
a
 Questão6
a
de sequência de nucleotídeos ou aminoácidos como uma ferramenta de busca.
Acerto: 1,0  / 1,0
A sequência de Shine-Delgarno e as sequências das ¿pontas¿ dos íntrons são exemplos de sinais na sequência de DNA. Esses
sinais são sequências características conservadas, que marcam as regiões necessárias para que a transcrição e tradução
ocorram. Qual processo de bioinformática inclui a identi�cação desses sinais?
Construção de árvore �logenética.
Extração do DNA.
 Predição gênica.
Montagem do genoma.
Sequenciamento do genoma.
Respondido em 26/04/2023 17:15:15
Explicação:
Durante a etapa de predição gênica, uma das formas de identi�car a região de um gene ao longo da sequência de DNA é a busca por
sinais que indiquem que aquela sequencias será transcrita e traduzida. Alguns desses sinais são diferentes entre procariotos e
eucariotos, uma das razões de diferentes programas serem usados para predição gênica desses grupos de organismos. Montagem de
genomas é o processo de unir pequenos fragmentos sequenciados na intensão de obter sequências maiores. Extração do DNA é o
método que visa extrair o DNA da célula para futura análise, como, por exemplo, o PCR e, posteriormente, o sequenciamento de uma
determinada região desse material genético, o que permite se chegar à sequência de nucleotídeos que estamos buscando. Árvores
�logenéticas representam hipóteses sobre as relações evolutivas em um grupo de organismos. Uma árvore �logenética pode ser
construída usando-se características morfológicas (formato do corpo), bioquímicas, comportamentais ou moleculares de espécies ou
outros grupos.
Acerto: 1,0  / 1,0
A química de produtos naturais tem empregado novas metodologias com o objetivo de acelerar a descoberta e o isolamento
de novos compostos que são originários das plantas e que podem ser empregados com �ns terapêuticos. Entre eles, técnicas
de separação associadas às espectrométricas de alto desempenho, assim analisando o extrato bruto de uma planta, ou seja,
sem prévio isolamento de um composto único, uma vez que esses estudos são realizados para a obtenção das informações
qualitativas e quantitativas acerca da maior quantidade possível de tipos diferentes de constituintes de cada amostra. Esse
tipo de estudo emprega qual abordagem ômica?
Lipdômica.
Genômica.
 Metabolômica.
Transcriptômica.
Proteômica.
Respondido em 26/04/2023 17:18:41
Explicação:
O enunciado aponta que as análises são voltadas para a maior quantidade possível de constituintes da amostra e para o isolamento de
novos compostos que são originários das plantas e que podem ser empregados com �ns terapêuticos, ou seja, produtos (metabólitos)
derivados do metabolismo. Além disso, cita a espectrometria como metodologia, uma das técnicas empregadas nesse tipo de estudo
ômico. As demais abordagens apontadas nas opções são focadas em um determinado tipo de molécula biológica.
Acerto: 1,0  / 1,0
 Questão7
a
 Questão8
a
 Questão
9
a
A seguir são apresentadas diferentes árvores �logenéticas (de A ao E).
Imagem: Leandro Pederneiras
Após analisar a �gura, assinale a alternativa que retrata de forma correta a interpretação dos grá�cos.
Os ramos curvos das divergências do grá�co a signi�cam a idade evolutiva retrocedendo para a raiz.
 No grá�co e, podemos dizer que o ponto indicado pela seta laranja é pelo menos duas vezes mais antigo que o ponto
indicado pela seta azul.
Os dois pontos indicados pelas setas na �gura d, apesar de separados, possuem idades ancestrais idênticas. Podemos
interpretar dessa forma porque os pontos estão na mesma altura no grá�co.
No grá�co b, ramos mais longos signi�cam mais longo tempo decorrido em relação aos ramos curtos.
No tipo de apresentação do grá�co c a raiz é identi�cada através do clado com maior número de ramos emergindo.
Respondido em 26/04/2023 17:21:40
Explicação:
Gabarito: No grá�co e, podemos dizer que o ponto indicado pela seta laranja é pelo menos duas vezes mais antigo que o ponto
indicado pela seta azul.
Justi�cativa: No grá�co E, podemos dizer que o ponto indicado pela seta laranja na alternativa E é pelo menos duas vezes mais antigo
que o ponto indicado pela seta azul porque, ao analisar a escala de tempo, logo abaixo do grá�co, nota-se a seta azul em torno de 50
milhões de anos (Ma) e a seta laranja em torno de 100 Ma. No grá�co A, uma árvore �logenética em formato circular apresentam
comprimento ramos iguais, sem escala de tempo. No grá�co B, os comprimentos mais longos dos ramos indicam um maior número de
mudança evolutiva. O grá�co C é um tipo de grá�co não enraizado, ou seja, aquele que somente nos mostra as relações entre espécies e
suas aproximações, mas sem a raiz o que indica na árvore um ancestral comum. O Grá�co D apenas representa a relação entre as
espécies, sem escala de tempo, então não podemos avaliar se os dois ancestrais apresentam a mesma idade evolutiva.
Acerto: 1,0  / 1,0
Observe o caldograma abaixo:
Imagem: Leandro Pederneiras
A seguir são listadas alguns grupos de espécies. Analise as alternativas que, segundo o cladograma, se refere a um grupo
poli�lético.
 O conjunto de espécies H I
O conjunto de espécies S T
O conjunto de espécies N O P
O conjunto de espécies W X Y
O conjunto de espécies A B C D
Respondido em 26/04/2023 17:28:25
Explicação:
Gabarito: O conjunto de espécies H I
Justi�cativa: O grupo poli�lético é um conjunto de táxons que não inclui o ancestral comum de todos os seus membros. Ao analisar as
alternativas, aquela que representa um grupo proli�lético, é o conjunto de espécies H I porque possuem origem em linhagens
amplamente desconexas. Os conjuntos de espécies listados nas outras alternativas (conjunto de espécies N, O, P; conjunto de espécies
W X Y; conjunto de espécies A B C D e o conjunto de espécies S T) apresentam um ancestral comum.
 Questão10
a