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25/05/2023, 17:39 Estácio: Alunos https://simulado.estacio.br/alunos/ 1/7 Meus Simulados Teste seu conhecimento acumulado Disc.: BIOINFORMÁTICA Aluno(a): JÉSSICA DOS SANTOS ROCHA 202202829781 Acertos: 8,0 de 10,0 07/04/2023 Acerto: 1,0 / 1,0 Nos organismos __________ a expressão de um determinado gene é dependente do quão enovelado o DNA está, as ___________ regulam essa compactação. A reação de _________ ocorre o maior enovelamento, já a reação de ____________ faz com que o DNA �que mais relaxado, possibilitando sua expressão. eucariotos / polimerases / acetilação / metilação procariotos / polimerase / metilação / acetilação procariotos / polimerase /acetilação / metilação eucariotos / histona / metilação / acetilação procariotos / histona / metilação /acetilação Respondido em 07/04/2023 17:09:14 Explicação: Nos organismos eucariotos a expressão de um determinado gene é dependente do quão enovelado o DNA está, as histonas regulam essa compactação. A reação de metilação ocorre o maior enovelamento, já a reação de acetilação faz com que o DNA �que mais relaxado, possibilitando sua expressão. Os organismos procariotos apresentam outro tipo de regulação, como a presença do operon lac. As polimerases são enzimas responsáveis enzima que catalisa a reação de polimerização de ácidos nucleicos a partir dos seus monômeros. Acerto: 1,0 / 1,0 Desde a descoberta da estrutura do DNA e do desenvolvimento da biologia molecular, o homem vem buscando novas alternativas que o auxiliem na busca por maior �uidez nos trabalhos de pesquisa, acelerando a geração de processos e produtos. A bioinformática tem contribuído para avanços na pesquisa básica, mas também na ciência aplicada (....). Fonte: adaptado de ARAÚJO, N. D.; et al. A era da bioinformática. Estud Biol. 2008 jan/dez;30(70/71/72):143-8. Sobre a bioinformática, analise as a�rmativas a seguir: I. O projeto Genoma Humano tinha como objetivo a detecção dos genes que compõem o DNA humano. Concluído em 1990, esse projeto contou com o apoio decisivo da bioinformática. II. A biologia computacional é um campo de pesquisa diferente ao da bioinformática. III. Uma das aplicações da bioinformática é o alinhamento de sequencias que tem como objetivo principal da comparação de sequências biológicas é encontrar o(s) alinhamento(s) de maior escore de similaridade. Questão1 a Questão2 a https://simulado.estacio.br/alunos/inicio.asp javascript:voltar(); 25/05/2023, 17:39 Estácio: Alunos https://simulado.estacio.br/alunos/ 2/7 É correto o que se a�rma em: II. I e II. I. I e III. III. Respondido em 07/04/2023 17:31:03 Explicação: Bioinformática e a biologia computacional são duas utilizadas como sinônimos e tem como objetivo a aplicação de ferramentas computacionais para coletar, armazenar, analisar, manipular, apresentar e compartilhar dados biológicos. Mas é importante ressaltar que segundo o NCBI a Biologia computacional é uma área de pesquisa que tem como foco principal problemas de pesquisa especí�cos em biologia. O projeto genoma foi iniciado na década de 90, e tinha como objetivo o desvendar por completo o DNA do ser humano. Após 13 anos para a conclusão desse projeto, a bioinformática mais uma vez foi essencial, pois a partir de programas de computador especí�cos, os pequenos trechos sequenciados eram adicionados a um grande banco de dados e encaixados no seu devido lugar, formando um único arquivo editável em que todos os participantes do trabalho. Acerto: 1,0 / 1,0 (ADAPTADA DE ENADE 2013- biomedicina) Os mecanismos envolvidos na expressão e interação dos genes, assim como a compreensão das redes funcionais estabelecidas pelas proteínas, fazem com que, no cenário cientí�co atual, a genômica e a proteômica estejam cada vez mais em evidência. Quatro são os principais bancos de dados utilizados para as diferentes análises de nucleotídeos. Um deles é o INSDC (INTERNATIONAL NUCLEOTIDE SEQUENCE DATABASE), que disponibiliza um repertório de sequências e é resultado da associação de três bancos de dados parceiros, o DDBJ (DATA BANK OF JAPAN), o EMBL (EMBL NUCLEOTIDE SEQUENCE DATABASE) e o GenBank. Devido à sua designação como provedor de dados primários, EMBL/DDBJ/GenBak é fonte inicial de muitos bancos de dados em biologia molecular. Como exemplos de bancos de dados de sequências genômicas secundárias, pode-se citar o Ensembl, o RefSeq e o Genome Review, que representa uma versão da sequência original de um cromossomo ou plasmídeo, com informações importadas de fontes que incluem o UniProt (UNIVERSAL PROTEIN RESOURCE), o Gene Ontology (GO), o projeto GOA (GO ANNOTATION), o InterPro e o HoGenom, além de serem disponibilizadas referências cruzadas com 18 bancos de dados. Fonte: ESPINDOLA, F. S. et al. Recursos de bioinformática aplicados às ciências ômicas como genômica, transcriptômica, proteômica, interatômica e metabolômica. Bioscience Journal, Uberlândia, v. 26, n. 3, p. 463- 477, Maio/Junho 2010 (adaptado). I. As informações disponíveis nos bancos de dados de sequências possibilitam o desenvolvimento de pesquisas in sílico (realizadas em programas de computador), dependendo dos métodos interpretativos e programas de análises envolvidos. PORQUE II. Os bancos de dados de sequências fornecem informações sobre diversos genes, que podem ser utilizadas de forma rápida, independentemente do tipo de processamento. A respeito dessas asserções, assinale a opção correta: As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justi�cativa da I. A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira. A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa. As asserções I e II são proposições falsas. As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justi�cativa da I. Respondido em 07/04/2023 17:32:29 Questão3 a 25/05/2023, 17:39 Estácio: Alunos https://simulado.estacio.br/alunos/ 3/7 Explicação: Em relação a proposição I e II são verdadeiras, pois as informações disponíveis nos bancos de dados, como sequências de genes, quanto proteínas) possibilitam a sua utilização em pesquisa in sílico de forma rápida. Acerto: 1,0 / 1,0 Muitos programas de computador já foram e vêm sendo desenvolvidos para auxiliar no desenho de primers usados na PCR (Reação em Cadeia de Polimerase). Dentre eles, podemos citar o Primer3, que pode ser usado de forma on-line por qualquer pessoa. Qual das opções abaixo contém uma informação essencial que o usuário precisa fornecer obrigatoriamente, para que um programa consiga desenhar primers? Temperatura de melting. Tamanho do produto ampli�cado. Conteúdo GC. Temperatura de anelamento. Sequência de nucleotídeos do alvo no DNA. Respondido em 07/04/2023 17:34:26 Explicação: Os primers são uma sequência de nucleotídeos que é complementar à sequência molde, que queremos ampli�car. Essas sequências moldes podem ser obtidas em bancos de dados biológicos de sequências de nucleotídeos, como GenBank e RefSeq, disponíveis no portal no NCBI. Nos programas utilizados para desenhar esses oligonucleotídeos, é impossível desenhar uma sequência complementar de primers sem ter essa sequência. As outras alternativas da questão são todos parâmetros para o desenho de primers, mas o usuário não precisa alterar as con�gurações do programa, só se ele achar necessário. Acerto: 1,0 / 1,0 (UFSM, 2006, Biólogo) As temperaturas são essenciais para realização da ampli�cação do DNA por PCR. Associe a segunda coluna com a primeira. 1. de 0°C a 10°C 2. de 35°C a 65°C 3. 72°C 4. 82°C 5. de 90°C a 96°C ( ) Maior probabilidade de alinhamento dos primers com a �ta molde. ( ) Formação de �tas-molde a partir de todos os seguimentos. ( ) Ideal para ação da enzima Taq-DNA-polimerase. ( ) Ideal para extensão dos primers a partir da extremidade 3'. ( ) Estabelecimento de ligações - pontes de hidrogênio, o DNA da amostra e os primers. Questão4 a Questão5 a 25/05/2023, 17:39 Estácio: Alunoshttps://simulado.estacio.br/alunos/ 4/7 2 - 5 - 3 - 3 - 2. 4 - 2 - 3 - 2 - 1. 2 - 3 - 1 - 3 - 4. 3 - 4 - 5 - 4 - 2. 5 - 4 - 1 - 5 - 3. Respondido em 07/04/2023 17:35:22 Explicação: Durante a etapa de desnaturação, a temperatura está entre 90-96°C e a dupla �ta do DNA se separa, por desnaturação, etapa em que ocorre a formação de �tas-molde a partir de todos os seguimentos. O anelamento ocorre entre 35°C a 65°C, quando os primers se anelam na região complementar do molde, esse é o momento de estabelecimento de ligações ¿ pontes de hidrogênio, o DNA da amostra e os primers. Após, a DNA polimerase pode adicionar os nucleotídeos, em 72°C, essa é a temperatura ideal para extensão dos primers a partir da extremidade 3¿. Durante o ciclo do PCR, a faixa entre 0°C a 10°C e as temperaturas de 82°C não são utilizadas. Acerto: 1,0 / 1,0 O PubMed é um dos bancos de dados disponíveis no portal do NCBI. A partir dele, podemos buscar por artigos cientí�cos da área biomédica publicados por cientistas em todo o mundo. Caso você queira direcionar a sua busca para obter artigos mais adequados ao seu interesse, o que poderia ser feito? Não existe a possibilidade de direcionar a busca, é necessário avaliar todos os títulos que aparecem como resultado para escolher aqueles mais adequados. Cadastrar seus dados pro�ssionais e receber uma autorização para acessar a parte restrita do PubMed que permite buscas avançadas. Acessar o PubMed por meio de rede de Internet de instituição pública, como universidades ou bibliotecas. Só assim é possível direcionar a busca por artigos. Utilizar os �ltros de busca, que incluem ano e tipo de artigo, por exemplo, ou, ainda, optar pela busca avançada. Pagar uma assinatura mensal ao PubMed para que ele direcione automaticamente suas buscas de acordo com os critérios que você deseja. Respondido em 07/04/2023 17:19:52 Explicação: Qualquer usuário pode acessar ao PubMed, via NCBI, e fazer buscas direcionadas usando �ltro ou o modo avançado. Pode acontecer de alguns dos artigos que aparecem como resultados não estejam disponíveis para leitura de todo o conteúdo, mas isso depende da revista em que o artigo foi publicado, e não do PubMed. Acerto: 1,0 / 1,0 Depois de resultados do sequenciamento genômico, um pesquisador agora deseja analisar a expressão dos genes e comparar o resultado de dois pacientes, um saudável e outro com câncer pulmonar. Para isso ele analisou o conjunto completo de RNAs da biópsia do pulmão dos pacientes. Como é chamada a abordagem ômica utilizada pelo pesquisador na fase atual de sua pesquisa? Transcriptômica. Lipidômica. Genômica. Metabolômica. Questão6 a Questão7 a 25/05/2023, 17:39 Estácio: Alunos https://simulado.estacio.br/alunos/ 5/7 Proteômica. Respondido em 07/04/2023 17:26:14 Explicação: As ciências ômicas estudam todo o conjunto de um determinado tipo de moléculas produzido pelas células. O nome dado à abordagem ômica vai de acordo com o tipo de molécula estudada. Proteômica estuda o conjunto de proteínas; genômica, o DNA; metabolômica, os metabólitos; transcrptômica, os transcritos (RNA); e lipidômica; os lipídeos. Acerto: 0,0 / 1,0 A química de produtos naturais tem empregado novas metodologias com o objetivo de acelerar a descoberta e o isolamento de novos compostos que são originários das plantas e que podem ser empregados com �ns terapêuticos. Entre eles, técnicas de separação associadas às espectrométricas de alto desempenho, assim analisando o extrato bruto de uma planta, ou seja, sem prévio isolamento de um composto único, uma vez que esses estudos são realizados para a obtenção das informações qualitativas e quantitativas acerca da maior quantidade possível de tipos diferentes de constituintes de cada amostra. Esse tipo de estudo emprega qual abordagem ômica? Transcriptômica. Lipdômica. Proteômica. Metabolômica. Genômica. Respondido em 07/04/2023 17:45:37 Explicação: O enunciado aponta que as análises são voltadas para a maior quantidade possível de constituintes da amostra e para o isolamento de novos compostos que são originários das plantas e que podem ser empregados com �ns terapêuticos, ou seja, produtos (metabólitos) derivados do metabolismo. Além disso, cita a espectrometria como metodologia, uma das técnicas empregadas nesse tipo de estudo ômico. As demais abordagens apontadas nas opções são focadas em um determinado tipo de molécula biológica. Acerto: 0,0 / 1,0 Observe o cladograma abaixo: Questão8 a Questão9 a 25/05/2023, 17:39 Estácio: Alunos https://simulado.estacio.br/alunos/ 6/7 Imagem Leandro Pederneiras A seguir são listadas alguns grupos de espécies. Analise as alternativas que, segundo o cladograma, se refere a um grupo para�lético. O conjunto de espécies G H I. O conjunto de espécies U V H. O conjunto de espécies J K L M. O conjunto de espécies A F. O conjunto de espécies P Q R. Respondido em 07/04/2023 17:40:44 Explicação: Gabarito: O conjunto de espécies J K L M. Justi�cativa: Grupos para�léticos são aqueles que faltam poucos descendentes, menos da metade, para se transformar em mono�lético. Assim, na imagem da árvore �logenética, o grupo para�lético é o conjunto de espécies J K L M porque para ser mono�lético só falta uma espécie I. O conjunto de espécies G, H, I; A e F; P, Q, R; U, V e H, precisariam incluir muito mais grupos para ser um grupo mono�lético, pois alguns espécies do conjunto não apresentam um ancestral comum próximo, como é o exemplo do conjunto de espécies J K L M. Lembre-se que para descobrir o ancestral comum de dois táxons basta caminhar sempre para trás da �logenia iniciando do terminal (onde está o nome da espécie). Acerto: 1,0 / 1,0 Existem diversas metodologias para buscar a melhor árvore �logenética. Todas estas abordagens são fundamentais para o avanço da compreensão da evolução. Dentre estes métodos está a aplicação do neighbor- joining. Qual é a melhor de�nição desta técnica? A árvore mais curta é encontrada sob a suposição de que há uma árvore mais curta. Um algoritmo rápido que encontrará uma árvore com base em distâncias entre pares. Um protocolo para adicionar táxons a uma árvore construída por parcimônia ou máxima verossimilhança. Uma busca em árvore é conduzida para encontrar a árvore que minimiza a diferença entre as distâncias observadas e previstas. Uma árvore é estimada com base na proximidade dos táxons em uma matriz de dados. Respondido em 07/04/2023 17:06:13 Questão10 a 25/05/2023, 17:39 Estácio: Alunos https://simulado.estacio.br/alunos/ 7/7 Explicação: Gabarito: Um algoritmo rápido que encontrará uma árvore com base em distâncias entre pares. Justi�cativa: O método neighbor-joining é um método que utiliza a distância genética calculada a partir de uma matriz táxon/caracter para construir uma árvore. A árvore escolhida é aquela que minimiza a diferença entre as distâncias na matriz e as previstas pela árvore. Assim como outros métodos de distância, o método neighbor-joining conduz uma serie de cálculos em cima da matriz a partir de um algoritmo. Esse é um método rápido. As outras alternativas não se enquadram como de�nições dessa metodologia.
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