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23/08/2023 21:44 Estácio: Alunos https://simulado.estacio.br/alunos/ 1/6 Exercício por Temas avalie sua aprendizagem Julgue as a�rmativas abaixo usando seus conhecimentos sobre bancos de dados biológicos. I - Existem diversos bancos de dados biológicos disponíveis, e o tipo de informação disponível costuma ser diferente, como sequências, estruturas e vias metabólicas. II - Os bancos de dados biológicos só podem ser acessados mediante o pagamento de uma mensalidade pelo usuário. III - Quanto mais detalhado o processo de curadoria dos dados disponibilizados por um banco, mais con�áveis eles são. BIOTECNOLOGIA E BIOINFORMÁTICA Lupa DGT0945_202211411085_TEMAS Aluno: NATHALIA MACEDO SILVA Matr.: 202211411085 Disc.: BIOTECNOLOGIA E BI 2023.3 FLEX (G) / EX Prezado (a) Aluno(a), Você fará agora seu EXERCÍCIO! Lembre-se que este exercício é opcional, mas não valerá ponto para sua avaliação. O mesmo será composto de questões de múltipla escolha. Após responde cada questão, você terá acesso ao gabarito comentado e/ou à explicação da mesma. Aproveite para se familiarizar com este modelo de questões que será usado na sua AV e AVS. 03015 - ANOTAÇÃO GÊNICA 1. A a�rmativa I é uma proposição verdadeira, e II e III são proposições falsa. As a�rmativas I e II são proposições verdadeiras, enquanto a III é falsa. As a�rmativas I, II e III são proposições verdadeiras. As a�rmativas I e III são proposições verdadeiras, e a II é uma proposição falsa. A a�rmativa III é uma proposição verdadeira, enquanto I e II são proposições falsas. Data Resp.: 23/08/2023 21:43:42 Explicação: A maioria dos bancos de dados biológicos mais conhecidos e utilizados são aqueles cujo acesso é livre, isto é, qualquer um pode acessar e obter os dados armazenados. Eles são muito úteis para o compartilhamento de informações e veri�cação da veracidade de dados divulgados por cientistas. No entanto, existem diversos bancos de dados biológicos disponíveis, e o tipo de informação disponível costuma ser diferente, como sequências, estruturas e vias metabólicas, e quanto mais detalhado for o processo de curadoria dos dados disponibilizados por um banco, mais con�áveis eles são. javascript:voltar(); javascript:voltar(); javascript:diminui(); javascript:aumenta(); 23/08/2023 21:44 Estácio: Alunos https://simulado.estacio.br/alunos/ 2/6 Diferentes tipos de dados biológicos podem ser armazenados em bancos de dados computacionais. Em relação aos tipos de bancos de dados biológicos, relacione as duas colunas. 1. Curado. 2. Acesso livre. 3. Especializado 4. Primário. ( ) Armazenam informações biológicas originais, resultados de experimentos cientí�cos. ( ) Banco que contém informações processadas por um pro�ssional com uma boa experiência no assunto. ( ) Reúnem todo conteúdo que atende a um interesse em particular, por exemplo, sobre o HIV. ( ) Está disponível para qualquer tipo de usuário, sem restrição de acesso. Qual a sequência correta? (CESPE/UNB - INMETRO - 2010- Biotecnologia Molecular) Microarranjo é uma técnica empregada em biologia molecular que permite medir os níveis de expressão de transcritos em larga escala. Com relação a essa técnica, assinale a opção correta. 2. 2-4-1-3. 4-3-2-1. 1-3-2-4. 4-1-3-2. 1-2-3-4. Data Resp.: 23/08/2023 21:43:46 Explicação: Os bancos de dados podem ser categorizados de acordo com a disponibilidade de acesso, com o conteúdo dos dados armazenados e com a qualidade deles. O acesso pode ser livre ou restrito; o conteúdo pode ser de dados brutos ou processados, referindo-se a sequências biológicas, estruturas 3D, anotação funcional de proteínas, dentre outros. No que diz respeito à qualidade, um banco curado é aquele que passou pela análise de pro�ssionais especialistas no assunto. Um banco primário é aquele que armazena informações biológicas originais, resultados de experimentos cientí�cos, e um banco especializado reúne todo conteúdo que atende a um interesse em particular, por exemplo, sobre o HIV. 3. A detecção é realizada por meio de eletroforese em gel de agarose. A técnica em questão é empregada em estudos proteômicos, visto que permite a identi�cação direta das proteínas expressas. A expressão dos genes é acompanhada com o emprego de sondas marcadas com brometo de etídio. As lâminas de vidro utilizadas são revestidas por moléculas de lipídios. O microarranjo de DNA consiste em um arranjo prede�nido de moléculas de DNA quimicamente ligadas a uma superfície sólida. Data Resp.: 23/08/2023 21:43:51 Explicação: A técnica em questão é empregada em estudos transcriptômicos, visto que permite a identi�cação direta das RNAs expressas. Para a técnica, são utilizadas lâminas de vidro revestidas com sondas de DNA. A expressão dos genes é acompanhada com o emprego de sondas marcadas com corantes �uorescentes. A detecção é realizada por meio de detecção da �uorescência. 23/08/2023 21:44 Estácio: Alunos https://simulado.estacio.br/alunos/ 3/6 O aluno Pedro está começando agora uma nova iniciação cientí�ca. Sua orientadora lhe disse que ele irá trabalhar com a enzima mieloperoxidase (MOP), mas ele ainda não compreende a importância do seu projeto. Ele precisa acessar um banco de dados biológico que reúna uma grande variedade de informações sobre essa proteína, como vias metabólicas e doenças associadas a ela. Qual banco de dados você recomendaria a ele? (Adaptado de VUNESP - 2020 - EBSERH - Farmacêutico) A revolução biotecnológica tem fornecido informações extremamente úteis para a descoberta de fármacos. O su�xo "ômica" indica uma série de novas disciplinas e procedimentos que visam à identi�cação funcional e/ou estrutural de tecidos, de células, de padrões de expressão gênicos e de características metabólicas (Bhogal & Balls, 2008), dentre elas: BHOGAL, N.; BALLS, M. Translation of new technologies: from basic research to drug discovery and development. Curr. Drug Discov. Technol., v.5, n.3, p.250-62, 2008. A sequência de Shine-Delgarno e as sequências das ¿pontas¿ dos íntrons são exemplos de sinais na sequência de DNA. Esses sinais são sequências características conservadas, que marcam as regiões necessárias para que a transcrição e tradução ocorram. Qual processo de bioinformática inclui a identi�cação desses sinais? 4. PubMed. Swiss-Prot. KEGG. PDB. GenBank. Data Resp.: 23/08/2023 21:43:55 Explicação: O KEGG é banco de dados biológico que envolve diferentes tipos de dados biológicos, possibilitando a compreensão da funcionalidade e utilidade de moléculas biológicas em nível elevado de complexidade. Os demais bancos focam em um determinado tipo de dados, como anotação de proteínas (Swiss-Prot), literatura cientí�ca (PubMed), estrutura de proteínas (PDB) ou sequências de nucleotídeos (GenBank). 5. Proteômica, lipidômica e dicotômica. Genômica, lipidômica e biônica. Genômica, dicotômica e proteômica. Genômica, transcriptômica e biônica. Genômica, transcriptômica e metabolômica. Data Resp.: 23/08/2023 21:43:59 Explicação: Genômica, transcriptômica e metabolômica são exemplos de ciências ômicas. Segundo o Dicionário Priberam da Língua Portuguesa, a palavra "dicotômica" signi�ca "que se divide ou subdivide em dois", enquanto "biônica" signi�ca "ciência que tem por �m o estudo de certos processos biológicos com vista a aplicar processos análogos para �ns militares, tecnológicos etc." As demais palavras são ciências ômicas (lipidômica). 6. Montagem do genoma. Sequenciamento do genoma. Extração do DNA. Construção de árvore �logenética. Predição gênica. Data Resp.: 23/08/2023 21:44:03 Explicação: Durante a etapa de predição gênica, uma das formas de identi�car a região de um gene ao longo da sequência de DNA é a busca por sinais que indiquem que aquela sequencias será transcrita e traduzida. Alguns desses sinais 23/08/2023 21:44 Estácio: Alunos https://simulado.estacio.br/alunos/ 4/6 A química de produtos naturais tem empregado novas metodologias com o objetivo de acelerar a descoberta e o isolamento de novos compostosque são originários das plantas e que podem ser empregados com �ns terapêuticos. Entre eles, técnicas de separação associadas às espectrométricas de alto desempenho, assim analisando o extrato bruto de uma planta, ou seja, sem prévio isolamento de um composto único, uma vez que esses estudos são realizados para a obtenção das informações qualitativas e quantitativas acerca da maior quantidade possível de tipos diferentes de constituintes de cada amostra. Esse tipo de estudo emprega qual abordagem ômica? (Adaptado de UFCE - 2015 - Engenheiro - Área Engenharia de Pesca) A transcritômica ou transcriptômica é a ciência que estuda o transcritoma produzido por determinada célula, tecido ou organismo. Sobre esse tema, é correto a�rmar que: Depois de resultados do sequenciamento genômico, um pesquisador agora deseja analisar a expressão dos genes e comparar o resultado de dois pacientes, um saudável e outro com câncer pulmonar. Para isso ele analisou o são diferentes entre procariotos e eucariotos, uma das razões de diferentes programas serem usados para predição gênica desses grupos de organismos. Montagem de genomas é o processo de unir pequenos fragmentos sequenciados na intensão de obter sequências maiores. Extração do DNA é o método que visa extrair o DNA da célula para futura análise, como, por exemplo, o PCR e, posteriormente, o sequenciamento de uma determinada região desse material genético, o que permite se chegar à sequência de nucleotídeos que estamos buscando. Árvores �logenéticas representam hipóteses sobre as relações evolutivas em um grupo de organismos. Uma árvore �logenética pode ser construída usando-se características morfológicas (formato do corpo), bioquímicas, comportamentais ou moleculares de espécies ou outros grupos. 7. Transcriptômica. Proteômica. Lipdômica. Metabolômica. Genômica. Data Resp.: 23/08/2023 21:44:08 Explicação: O enunciado aponta que as análises são voltadas para a maior quantidade possível de constituintes da amostra e para o isolamento de novos compostos que são originários das plantas e que podem ser empregados com �ns terapêuticos, ou seja, produtos (metabólitos) derivados do metabolismo. Além disso, cita a espectrometria como metodologia, uma das técnicas empregadas nesse tipo de estudo ômico. As demais abordagens apontadas nas opções são focadas em um determinado tipo de molécula biológica. 8. A transcriptômica estuda o conjunto de proteínas. Podem haver vários transcriptomas em um único organismo. Independente de estágio de desenvolvimento, o transcriptoma é o mesmo. O transcriptoma é o mesmo em todos tecidos e órgãos. Apesar de sua aplicação em diversos campos da biologia, a transcriptômica não pode ser pesquisada a partir de técnicas de alto desempenho e sequenciamento de nova geração (NGS). Data Resp.: 23/08/2023 21:44:11 Explicação: O transcriptoma estuda o conjunto de RNAs, que varia de acordo com a condição a qual a célula está exposta, portanto, se estudar diferentes tipos de células o transcriptoma será distinto. Além disso, o transcriptoma depende do estágio de desenvolvimento e em cada indivíduo pode haver vários transcriptomas. O transcriptoma pode ser estudado pelo sequenciamento de nova geração, realizando a pré-etapa de síntese do DNA complementar. 9. 23/08/2023 21:44 Estácio: Alunos https://simulado.estacio.br/alunos/ 5/6 conjunto completo de RNAs da biópsia do pulmão dos pacientes. Como é chamada a abordagem ômica utilizada pelo pesquisador na fase atual de sua pesquisa? Um grande avanço da bioinformática aconteceu durante a execução do Projeto Genoma Humano, que durou mais de 10 anos e teve como objetivo principal determinar a ordem dos nucleotídeos de todo genoma da nossa espécie. Essa empreitada cientí�ca estimulou o aprimoramento de computadores e de programas para lidar com a grande quantidade de dados que começou a ser gerada. Hoje vivemos o que é chamado de ¿era pós-genômica¿, como o desenvolvimento e aperfeiçoamento de técnicas e programas que permitem estudar outras ciências ômicas. De acordo com as ciências ômicas, analise as a�rmativas a seguir: I. Genética é o estudo de todo o DNA de um indivíduo. II. Metabolômica estuda moléculas de baixo peso molecular produzidas por uma célula. III. Para investigar o genoma de um indivíduo, precisamos de uma amostra de seu RNA. Quais são as a�rmativas corretas? Proteômica. Genômica. Lipidômica. Metabolômica. Transcriptômica. Data Resp.: 23/08/2023 21:44:15 Explicação: As ciências ômicas estudam todo o conjunto de um determinado tipo de moléculas produzido pelas células. O nome dado à abordagem ômica vai de acordo com o tipo de molécula estudada. Proteômica estuda o conjunto de proteínas; genômica, o DNA; metabolômica, os metabólitos; transcrptômica, os transcritos (RNA); e lipidômica; os lipídeos. 10. Somente a a�rmativa de número 3 está correta. As a�rmativas 1 e 2 estão corretas. Somente a a�rmativa de número 1 está correta. Somente a a�rmativa 2 está correta. As a�rmativas 1 e 3 estão corretas. Data Resp.: 23/08/2023 21:44:25 Explicação: O estudo de todo o DNA de um indivíduo é chamado de genômica. A genética é a parte da ciência que estuda a hereditariedade, a estrutura e a função dos genes e a variação dos seres vivos. Na genética estudamos genes individuais. Às vezes, genética e genômica são usadas indistintamente, mas têm signi�cados diferentes. Para investigar o genoma de um indivíduo, precisamos de uma amostra de seu DNA. Não Respondida Não Gravada Gravada Exercício por Temas inciado em 23/08/2023 21:43:38. 23/08/2023 21:44 Estácio: Alunos https://simulado.estacio.br/alunos/ 6/6
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