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Diferenças na tradução entre procariotos e eucariotos. Nos procariotos não existe separação geográfica entre transcrição e tradução, à medida que o RNAm é transcrito, ele também é traduzido Existem também diferenças estruturais nos ribossomos. Nos eucariotos a separação geográfica entre o núcleo e o citoplasma torna os dois processos independentes, e no RNAm existem sequências que sinalizam para o início e o término da tradução. Nos procariontes possui uma sequência conservad de 6 nucleotídeos, denominada sequência de Shine Delgarno. Esta sequência pode parear com algumas bases do rRNA 16S da sub- unidade menor do ribossomo procarioto. A interação entre os dois RNAs é fundamental para a eficiência do início da tradução. Os mRNAs de eucariontes não possuem a sequência de Shine Delgarno, nem nada semelhante. A decisão pelo uso de um determinado códon AUG fica dependente de sua proximidade com o cap da extremidade 5’ do RNAm. Os nucleotídeos próximos ao AUG funcional também têm influência.
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