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AULA_6_TRANSCRIÇÃO ACH4157 – Genética Molecular GENÉTICA CLÁSSICA GENÉTICA MOLECULAR X Geração P GeraçãoF1 GeraçãoF2 3 : 1 BIOLOGIA MOLECULAR •A partir de 1953, definitivamente estabelecido que o DNA é a molécula responsável pela informação genética; •Que é transmitida de um indivíduo para o outro ou de uma célula para outra. GENÓTIPO (POTENCIAL) FENÓTIPO (CONCRETIZAÇÃO) DNA (GENES) PROTEÍNAS • Qual a base molecular para a geração dos fenótipos? 5 FLUXO DA INFORMAÇÃO GENÉTICA (GÊNICA) • Existe um fluxo da informação genética do DNA para a proteína; • Que não é direto! DNA (GENE) RNA PROTEÍNAS TRANSCRIÇÃO TRADUÇÃO REPLICAÇÃO • Do genótipo para o fenótipo, existe uma etapa intermediária! 6 FLUXO DA INFORMAÇÃO GENÉTICA (GÊNICA) 7 EXPRESSÃO GÊNICA = atividade, funcionamento do gene Gene 8 • Polimerização de uma molécula de RNA; • Cadeia sintetizada a partir de uma cadeia molde de DNA; • Nucleotídeos complementares; • Cadeia sintetizada no sentido 5’ para o 3’ pela RNA polimeraze. TRANSCRIÇÃO GÊNICA 9 TRANSCRIÇÃO GÊNICA 10 • Processo realizado em 3 etapas: - INCIAÇÃO - ALONGAMENTO - TERMINAÇÃO TRANSCRIÇÃO GÊNICA 11 TRANSCRIÇÃO GÊNICA • Enzima que atua ativamente para cada uma das etapas da transcrição; • Reconhece e se liga no gene para iniciar a transcrição; • Abre a cadeia de DNA no início e ao longo de toda síntese; • É responsável pela síntese e sua desestabilização no DNA determina o término da transcrição. • RNA POLIMERASE 12 • INICIAÇÃO • Como a RNA polimerase sabe onde iniciar a transcrição? TRANSCRIÇÃO GÊNICA 13 • Promotor nas bactérias é formado por dois blocos de sequências de DNA conservadas, assim como as distâncias entre esses dois blocos; • Isso determina não só onde a RNA polimerase liga o DNA mas também; • A posição onde será iniciada a transcrição, bem como a direção da transcrição. TRANSCRIÇÃO GÊNICA BACTÉRIA • INICIAÇÃO 14 • O primeiro nucleotídeo que será transcrito é definido + 1; • As sequências a montante (antes) do início da transcrição recebem numeração negativa enquanto a jusante recebem numeração positiva; • A convenção é de que a fita (cadeia) 5’ para 3’ do DNA é utilizada para representar o gene (fita codificadora); • A fita codificadora tem a mesma sequência do RNA enquanto a fita molde é complementar. TRANSCRIÇÃO GÊNICA BACTÉRIA • NOTAÇÃO 15 TRANSCRIÇÃO GÊNICA BACTÉRIA • ALONGAMENTO • Uma única enzima transcreve todos os genes das bactérias; • A holoenzima é composta por 5 subunidades. • A extensão da cadeia é efetiva após a incorporação dos primeiros 9 nucleotídeos; • E da liberação do fator sigma da holoenzima; • A RNA polimerase desfaz as pontes de hidrogênio a sua frente; • Que são refeitas logo após sua passagem e; • A enzima atua até encontrar o sinal de parada da transcrição. 16 TRANSCRIÇÃO GÊNICA BACTÉRIA • ALONGAMENTO • A enzima se mantém ligada a fita de DNA molde durante toda transcrição; • A passagem da enzima forma uma bolha encobrindo em torno de 30 nucl., tendo regiões desemparelhadas e regiões formando híbrido DNA/RNA; • Também são formados canais para entrada de nucleotídeos livres e saída da cadeia de RNA. 17 TRANSCRIÇÃO GÊNICA BACTÉRIA • TERMINAÇÃO • A RNA polimerase continua aumentando a cadeia até o sítio de parada (de terminação/ término) da transcrição; • Na verdade a enzima estende a cadeia incorporando o sítio de parada na cadeia do RNA; • E sequências do sítio de terminação geram estruturas secundárias; • Que desestabilizam a polimerase fazendo-a se desligar do molde e interromper a transcrição logo em seguida. 18 • Processo mais complexo; TRANSCRIÇÃO GÊNICA EUCARIOTO • Contendo muito mais subunidades que em bactéria, comuns e diferentes entre as três polimerases; • Com 3 RNA polimerases responsáveis pela transcrição de diferentes categorias de genes; 19 TRANSCRIÇÃO GÊNICA EUCARIOTO • Ainda assim, a transcrição para as três polimerases; • Depende de outras proteínas, os fatores gerais da transcrição; • Que reconhecem sequências de DNA na região promotora, se ligando a elas, e auxiliando na desnaturação do DNA e no recrutamento da polimerase; • Vão se juntando sequencialmente no promotor gerando o complexo de pré- iniciação da transcrição. 20 TRANSCRIÇÃO GÊNICA EUCARIOTO • As sequências reconhecidas na região promotora são diferentes para cada polimerase; • E com maiores possibilidades para a modulação dos genes transcritos pela RNA polimerase II; • Que transcrevem os genes codificadores para proteínas. 21 TRANSCRIÇÃO GÊNICA EUCARIOTO • Nos genes classe II, existem diferentes regiões para reconhecimento na região central do promotor; codificadorareguladora p ro m o to ra enhancers (módulos) • E em regiões afastadas mas ainda próximas do promotor; • Assim como em regiões muitas vezes distantes dezenas de kb da região promotora, em módulos da região reguladora. 22 TRANSCRIÇÃO GÊNICA EUCARIOTO • Todas essas regiões são formadas por sequências de DNA reconhecidas por proteínas que ao se ligarem no DNA e recrutam ainda outras proteínas; • Nas regiões mais distantes nos módulos reguladores ligam-se proteínas que especificam as condições para a transcrição diferencial de genes; • Assim como as proteínas que interagem com as regiões mais próximas do promotor, que também formam uma ponte para a comunicação das proteínas dos módulos com o complexo de início da transcrição na região central do promotor. 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