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& GEjNETICA MOLECULAR COMO INDICACAO PRECOCE OU UMA FERRAMENTA DA GENETIC A QDANTITATIVA.i1 Luciana Correia de Almeida Regitano - Pesquisadora Embrapa - CPPSE■ r 7. Introdugao Progresses excepcionais Ibrani experiinentados no campo da genetica molecular nos 10 ultimos anos. Antes deste periodo, poucos projetos cientificos nessa area cram voltados para animais domesticos. Alem disso, as razoes que norteavam tais estudos eram as mais diversas, gcralmente nao relacionadas a produ^ao animal, como por exemplo o desenvolvimento de modelos para estudo de doenpas hereditarias cm humanos. produgao de proteinas para a industria larmacologica, estudos de evolugao e tllogenia das especies. Grande parte dcsse progresso. mais particularmenle aquelc veriflcado nos ultimos 5 anos, oconeu na area da pesquisa genomica c pode ser atribuida aos desenvolvimentos metodologicos e cientificos alcanqados pelo projeto genoma humano. Projetos de mapeamento genomico em animais domesticos aliados ao mapeamento comparativo deverao Ibrnecer as bases para a manipulapao do genoma dos animais de acordo as necessidades e exigencias do mercado. Em bovinos, aproximadamente 400 encontram-se mapeados em grupos sintenicos. sendo todos os grupos atribuidos Mapas de ligagao compostos por cerca de 1.600 marcadores posicionados a intervales medics intendcs a 2,5 ccntimorgans (Barendse et al., 1097; Kappes et al . 1907) permitem a localizagao de genes envoividos na heranga de caracteres de importancia economica (ETLs), tanto qualitativos quanto quantitativos Apesar do evidente progresso alcangado na tecnologia genomica e da identificapao de varias regibes cromossomicas respensaveis pela herain^a de algumas caracteristicas ja ser uma realidade, a questao do mapeamento de ETLs e complexa. A natureza poligenica da grande maioria dos caracteres de interesse economico diflculta a identifica^ao de marcadores ligados a ETLs com efeitos que justiliquem sua aplica^o no m el bora men to animal. Porem, considerando a velocidade do desenvolvimento desta tecnologia. e possivcl vi si umbra r a futura identificagao e clonagem dos ETLs em si. Alem disso. a aplica^io de marcadores moleculares no diagnostico de doen^as hereditarias, na identificaqao individual e de patermdade vein deixando sua contribui^ao como ferramenta auxiliar melhoramento. com genes a cromossomos. / nos programas de 2 Aplicagdo dos marcadoresgeneticos no mapeamento de OTLs O melhoramento genetico animal tern side conduzido sob os principios da genetica quantitativa. alcangando ganhos signiflcativos em todas as especies Uma linhagem de (range deQorte de 1001 c iega a ser tres vezes mais pesada do que urn linhagem de 1057 sob a rnesma dieta e a mesma idade a e>s I ^5). A taxa de ciescimento da produpao anual de leite por vaca tern aumentado nos ultimos anos na America do Norte. Os valores de DEP de temeas nascidas em 1086 foram aproximadamente 135 kg superiores aos das temeas nascidas em 1085 (Wiggans, 1991) A existencia de genes principals, que contribuem com grande parte da variagao fenotipica de urn carater quantitative, tern sido demonstrada Aiguns exemplos sao o gene da hipertrofia muscular Genetica molecular como ... SP-PP-1999.00074 PR0CI-1999.000741999 REGlili iilli 1993 SP-PP-1999.00074 i'll A CPPSE-12393-1 54 (/;//;) cm bovinos (Nott & Rollins. 1979), a muta^ao no receptor da Ryanodina dos suinos (MacLeenan & Phillips, 1992) e o gene de fertilidade (Fee) dos ovinos (Lanneluc el a/., 1994). Essa situa(?ao, entretanto, pode ser considerada como excegao uma vez que a maioria dos caracteres quantitativos deve ser controlada por um grande numero de genes, cada um corn pequeno efeito sobre o carater (Massey & Georges, 1992) Thoday (1961) formulou a hipotese de que se a segregaqao de um gene marcador pudesse ser utilizada para identificar e estimar o efeito de um poligene, e se um numero suficiente de marcadores estivesse distribuido pelo genoma de uma especie, seria possivel mapear e caracterizar todos os poligenes que afetam um carater quantitativo O desenvolvimento de marcadores para alcanyar esse objetivo tern se valido basicamente de duas estrategias. A primeira utiliza marcadores aleatorios para a construpao de mapas gencticos saturados. Esses marcadores sao entao avaliados em cstudos de conelaqao com caracteristicas de interesse economico e utilizados na identificayao de locos que afetam caracteres quantitativos ou QTLs (Gcldermann, 1975). O sucesso dessa estrategia depende primariamente da construqao de mapas de ligaqao detalhados, com marcadores dispostos a intervalos inferiores a 20 cM construcao de tais mapas tornou-se possivel com a utilizayao de marcadores altamente polimorficos, particularmente aqueles que exploram o polimorflsmo de sequencias repetitivas de DNA Em bovinos, mapas geneticos publicados por Bishop et al. (1994), Barendse et al (1994), Barendse et al. (1997) e Kappes et al. (1997) fornecetn marcadores suficientes para uma cobertura superior a 95% do genoma a uma distancia media inferior a 2,5 cM. Os primeiros resultados do emprego desses marcadores em analises de intervalo tern sido relatados. Ron et al. (1994) identificaram um QTL no cromossomo 21 dos bovinos com um efeito de 0,2 desvios-padroes fenotipicos para produqao de leite e 0,16 desvios-padroes para proteins total Georges et al. (1995). encontraram fortes evidencias da presents de QTLs para caracteristicas de produgao de leite nos cromossomos 1, 6, 9, 10 e 20 dos bovinos. Os efeitos dos diferentes QTLs contribuiram com 11 a 52% da variancia total dentro de famihas de mcios-irmaos. A O sucesso desses experimentos pode tambem ser atribuido ao desenvolvimento de metodos estatisticos e dclineamentos geneticos adequados (Weller et al., 1990). Em bovinos de leite, a disponibilidade de grandes familias dc touros tambem tern contribuido para um maior a van go no mapeamento de QTLs para caracteristicas dc produgao de leite. Alem dessas familias. cruzamentos direcionados. coordenados pelo USDA, CS1RO e pela Universidade Texas A&M tern sido utilizados para a produgao de familias de referenda de bovinos Informagoes sobre esses projetos podem ser obtidas na internet acessando as paginas http://sol.marc.usda.gov./, http://spinal.tag.csiro.au/.. http://bos.cvm.tamu.edu/bovgbase. A segunda estrategia de identificagao de QTLs consiste na deteegao de polimorfismo genes efue estao diretamente relacionados com a caracteristica de produgao, denominados genes candidates. Por exemplo, a variagao genetica nos locos que controlam fatores de crescimento tern sido associada a diferengas no desenvolvimento ponderal, em caracteristicas de qualidade da came e de produgao de leite dos bovinos. Na raga Hereford, Moody el al. (1994) verificaram efeitos significativos e positives da substituigao de aides do gene IGF-I na DEP" para peso ao nascimento, peso a desmama e a um ano de idade. O polimorfismo Jtiql no gene do hofmonio de crescimento foi associado a caracteristicas de produgao e qualidade da carne (Taylor et al.,. 1998). Outro bom exemplo da estrategia de utilizagao de genes candidatos e encontrado em em sumos. Estudos do tamanho da leitegada em suinos da raga Meishan demonstraram o acrescimo de mais de 1 leitao por leitegada associado a um polimorfismo do receptor do estrogenio. A ocorrencia deste polimorfismo em linhagens comerciais foi posteriormente verificada e sen efeito nessas linhagens foi de aproximadamente 0,5 leitao por leitegada (Short et al, 1997) I 55 0 panorama atual da investigagao de QTLs para caracteristicas de produgao de leite pode ser visualizado na Tabela I E possivel observar que em alguns cromossomos. como por exemplo, Bta E Bta 6 e Bta 11, evidencias da presenga de QTLs foram obtidas em diferentes populagoes e em diferentes condigoes experimentais, o que aumenta a consistencia desses resultados. j. I)etec\do tie (Joen^as: Shuster et al. (1992) identificaram uma doenga hereditaria em bovinos que causa deficiencia na adesao de leucocitos (BEAD). A doenga so ocorrc em animais homozigotos recessivos, nos quais a redugao na expressao de beta-2 integrina resulta em leucocitos anormais que nao conseguem penctrar nos tecidos para desiruir os agentes patogenicos Animais homozigotos para esta doenga raramente sobrevivem, causando perdas signillcativas para produtores. A Irequencia do gene causador desta doenga foi determinada no rebanho de gado Holandes norte americano e e de 15% entre os touros e de 6% entre as vacas. Todos os animais portadores desta doenga sao relacionados com urn unico touro, Osborndale Ivanhoe. Como este touro apresenta boas caracteristicas de produgao, o sen semen tern sido utilizado em varios paises. inclusive o Brasil Calcula-se que esta doenga cause perdas em torno de USS 5 milhoes por ano nos Estados Unidos. O diagnostico pode ser realizado utilizando a tecnica de PCR nas condigoes descritas por Shuster et al. (1992). Urn tragmento de DNA de 58 pares de bases, que content o nucleotideo 383 do gene que codifica a proteina CD 18 em bovinos. e amplificado. E nesta posigao que ocorrc a substituigao de uma adenina por guanina cm animais portadores da doenga. Esta substituigao causa uma mudanga no codon e resulta na substituigao de urn acido aspartico por uma glicina no DNA dos animais mutantes. A nuitagao pode ser detectada pela digestao DNA amplificado com diferentes enzimas de restrigao. A digestao do fragmento amplificado com a enzima TaqI resulta em fragmentos de 26 e 32 pares de bases em animais normais. Em animais com a doenga (BEAD), o DNA nao e digerido por TaqI Por oulro lado. em animais portadores da doenga, fragmentos de 58, 32 e 26 pares de bases sao observados. Atualmente as empresas de inseminagao artificial nos Estados Unidos testam rotineiramente sens reprodutores para esta doenga Outra doenga hereditaria de grande interesse, denominada Weaver, e encontrada quase que exclusivamente em bovinos da raga Suiga Parda e caracteriza-se por paresia progressiva dos membros pelvicos e ataxia. A doenga foi atribuida a urn unico gene recessivo de penetrancia completa. 0 interesse pelo estudo desse gene foi despcrtado pelo aumento da frequencia da mutagao em rebanhos melhorados, que poderia ser resultante de uma vantagem seletiva dos individuos portadores da mutagao. Essa teoria foi rcforgada por Hoeschele & Meinert (1990) ao descreverem uma associagao entre a doenga e produgao de leite. A diferenga estimada entre individuos portadores e nao portadores foi de 690 kg de leite e 26.2 kg de gordura. A magnitude do efeito sobre a produgao sugere que a mutagao deve estar proxima a urn gene com grande efeito na produgao de leite. Dessa forma, a identificagao de individuos portadores e essencial para evitar que, como consequencia da sclegao para produgao, o aumento na frequencia do genejcoloque em risco a sobrevivencia da raga. Urn marcador de DNA microssatelite foi mapeado muito proximo ao gene responsavel pela doenga (Georges et al . 1993). Esse marcador devera pcrmitir a identificagao de individuos portadores. sem a necessidade de teste de progcnic. Alem disso, esse marcador devera contribuir para o mapeamento da regiao cromossomica responsavel pelo acrescimo na produgao de leite, que podera ser realizado rnesmo em ragas que nao apresenlam a doenga Weaver. Outras doengas hereditarias dos bovinos como a deficiencia de uridina monofosfato sintetase (DUMPS) e Citrulinemia tambem ja podem ser diagnosticadas pela analise do DNA Uma ( 56 revisao detalhada sobre esse assume e enconlrada em Buitkamp & Epplen (1996). 4. Considcra^oes Finals Os primeiros esforgos no sentido de identificar genes que controlam caracteristicas de interesse econdmico em animals foram limitados pela lalta de marcadores genetieos informativos. Com o dcsenvolvimento da genetica molecular, bons resultados vem sendo obtidos. demonstrando a existencia de QTLs para diferentes caracteristicas nos diversos cromossomos dos bovinos. Saliento aqui que sequer comentei sobre genoma mitocondrial, para o qual ja existem evidencias de associate com ETLs. No atual estado de conhecimento sobre o genoma bovino, a descoberta de muitos outros QTLs e eminente. Entretanto, sua utiliza^ao em programas de melhoramento dependera ainda de uma serie de fatores, entre os quais a viabilidade economica. Os conhecimentos acumulados na area da genetica molecular devem-se em grande parte ao dcsenvolvimento cientifico decorrente dos projetos de mapeamento do genoma humano. A utiliza^ao dessas informagoes por meio de mapeamento comparativo e homologia de sequencias tern contribuido, e devera ser fundamental para futuro desenvolvimento dos projetos na area animal. 5. Referencias Amlcrsson-Hkliuicl L. Dunell B, Rondel J Associations Ivlweon blood groups, blood protein |X>l\inor)-)hisins and breeding values for production trails m Swedish Red and White Dain bulls Animal Genctics,21:361-76. I‘MU Andersson-Kklimd I- Rondel .1 l.inkage tvlweeu annlase-1 locus and a major gene for milk tin content in cattle. Animal Genetics, 24:101-3. !‘>93 Barendse W . Annitage S. M . Kossarek I. M.. Shalom A . Kirkpatnck B W.. Rvan A M , Clauon I). l.i 1... Neilx’rg H. I... Zhang N.. Grosso W M . Weiss .1 . Creighton I’. McCarthy 1 . Ron M.. Teale A .1,. I Ties R . McGraw R A.. Moore S S.. Georges M . Sol lor J I... Womack J. I .. 1 lel/el. I) .1 S A genetic linkage map of the bovine genome (Nature Genetics, 6: 227-241. l‘)‘)4. Barendse. W.. Vaiman. I).. Kemp. S.J . Sugimoto. 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'siindrii^ 0661 'LiiZ ~ bZ<Z :fZ. ‘OJH^PS I'-U-Uiof sj^juiu .-iipund duisu 0[iJiP viinp hi snail PAipiuuinihjo Ximldimi .->ipuod joj sudisnp Piqrimippuiud., pun jou^nnp.. jo jr>\\oci v\ ppc'S A !MS,!>I' I T '^ll-AW 1961 •()Z.t-X9t :161 souooAiod io uoiitpo-1 ^ f ^’poiLL X661 'I0c‘l'6l :(f)6Z s-AHOiioo lummy .'’[iiuo jo uoiusodiuoA ssuujip pm: qiwojd uo spopo joj iho jo sisa[uui; ouod oiupipuu.j >is si\i!(| jwf [|o.M!S ">1>] HS ipims ‘AVI' J^O-inj 'Of sjopuus N .Piunji ’V)! uoupiupjh Jf s'CI .ioi|dt![p!0 ‘tm diau.-'i ] ‘T| 01(1111110^ ‘ If Jo|m:j c661 '6‘Vll6:6X vsa l-’S P«!1V |1«M -^d UP1S|0(1 ill Pipnipp iioisoi{pu opoo'jnni sosnip lap loopp nnoiPo i:jo noiP|i;AOJdpun uoiunijiuiopi q^j u.>j|i;) uuiiuuojav jf ;p\ iillPM :ICI JOisiuis 7,661 •:t-Xi:iiA'7'-^^PSl‘!lu!uV.l<) |RUjnof souii did [I’ia.puiuio.i juoj ui sinui no 11.11 ipojd pun uoipnpojcbj no sipo| joicbno.i uodojiso oip jo ppu; i SO u0's,:lcl TV uimpirw 'VCI o?jsi:a f uipn •>!,) .i(ddn| ">|;) ipjt^.i.pu iuiais Jop iniA ’V op ';xi ipnr|.i|,\ '(O poowipnos ' IK PHlPs'in0>I 111 0°lIS t-661 b;c-6Cc -<Z 's-iipu.iQ luunuy uoiii;[iid(xl opiip AJinp |iippuiuup u 111 snii[|on^ojouu VNCI Mllu >001 iuui OAiiuiiiunnh riuiddiiK \ J' mo|[o\\ : \i muiua :j/\i jhiuji ‘ K lK,d 6761 \ZZ :er ‘MVvuuq opiao |rwx| 111 odi? jo jipa duo 01 qiAMud pin? iqdiow ip.iiq uo M[dojuod\i[ Ji!|insiuu joj mind i/iu oip jo i.mji;.| ,\\ 'sui|ioj| A’ !) .l O »°N t'CU'lCc‘12 P66I 'oouiuiuuv') diir/iiiurlj() :i[dir>ii() •<du|pm>.'MkJt| pppI isndny iipinu:;)'i|d|nn;) c 'NOl.l.OIKK )>ld >I.^Xl.I.SdMT O.UI UT<I<IV SOl.I.dN:I!) NO SS:l>ION()0 (N>I()M -"l oppo pjopjo) | | mii| 111 siumi iinuniuiu pin? ipwojd i||i\\ uo|u?i.iossi! 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Resumo dos resultados obtidos na identifica<?ao de QTLs para caracteristicas de produ^ao de leite. Ashton, GC 1960Friesian, Shorthorn, Ayreshire,Produgao de leiteTF (p-globulina) Bta 1 Channel Island Produgao de leite, Friesian, Ayreshire, Guernsey, Jamieson & Robertson, 1967 Produgao de gordura Shorthorn, Jersey Bta 1TF Ashton & Hewetson, 1969Jersey, GuernseyProdugao de leiteBta 1TF Georges et al., 1995Produgao de leite, Holstein Produgao de proteina Bta 1TGLA49- TGLA57 Andersson-Eklund et al., 1990 Andersson-Eklund & Rendel, 1993 Produgao de gordura Sueca Vermeiha e BrancaBta 3AMY1 Ron et al., 1996Holstein (EUA)% gorduraBta 3TGLA263 Medjugorai et al., 1997Produgao de leite, Pardo Suigo Produgao de gordura Bta 4Weaver Kuhn et al., 1996Holstein Friesian (Alemanha)Produgao de leiteBta 6ILSTS97 McLean et al., 1984Jersey, Friesian% gorduraBta 6CSN2 Holstein, Pardo Suigo X Harima Mandal & Dattagupta 1985Produgao de leite 1a lactagao Bta 6ALB J £ C3H3-TGLA3'/ Bta 6 Georges et al., 1995Produgao de leite, % gordura, % proteina' Holstein JUfvC. Tabela 1. Resumo dos resultados obtidos na identificacao de QTLs para caracteristicas de produpao de leite (continuagao). r. ’ - wmm mmi u •} L-Jl: i j fijr- "■-mm mm s^v: \sii*. TGLA37 Bta 6 Produgao de leite, Holstein (Alemanha) produgao de gordura, Produgao de proteina Kuhn et al., 1996 TGLA427- TGLA73 Bta 9 Produgao de gordura Holstein (EUA) Produgao de proteina Georges et al., 1995 TGLA111- TGLA378 Bta 10 Produgao de gordura Holstein (EUA) Georges et al., 1995 LGB Bta 11 % gordura, Solidos totals, Produgao de proteina Jersey, Friesian McLean et al., 1984 Grupo sang. J Bta 11 Produgao de leite, Sueca Vermelha e Branca gordura corrigida, Produgao de gordura, Produgao de proteina Andersson-Eklund et al., 1990 Grupo sang. B Bta 12 Gordura corrigida Sueca Vermelha e Branca Andersson-Eklund et al., 1990 CSSM66 Bta 14 % gordura, % gordura Holstein (EUA), Holstein (Israel) Ron et al., 1996 GH Bta 19 Produgao de gordura Red Dani & Norw Hoj et al,, 1993 Bta 19 Produgao de proteina Holstein Friesian Produgao de leite Produgao de gordura GH Lee et al., 1996 TGLA153- 7 Bta 20 TGLA126 % proteina Georges ei al., 1995Holstein Friesian/ / M Blood Group Bta 23 Sueca Vermelha e Branca Andersson-Eklund et al., 1990% gordura PRL Bta 23 Produgao de leite Holstein Cowan et al., 1990/