Bioinformatica- Simulado 2

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14/11/2023, 09:34 Estácio: Alunos
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Teste seu conhecimento acumulado
Disc.: BIOINFORMÁTICA   
Aluno(a): NAYARA LIMA SOARES 202104456581
Acertos: 1,4 de 2,0 25/09/2023
Acerto: 0,2  / 0,2
Desde a descoberta da estrutura do DNA e do desenvolvimento da biologia molecular, o homem vem buscando
novas alternativas que o auxiliem na busca por maior �uidez nos trabalhos de pesquisa, acelerando a geração de
processos e produtos. A bioinformática tem contribuído para avanços na pesquisa básica, mas também na
ciência aplicada (....).
Fonte: adaptado de ARAÚJO, N. D.; et al. A era da bioinformática. Estud Biol. 2008 jan/dez;30(70/71/72):143-8.
Sobre a bioinformática, analise as a�rmativas a seguir:
I. O projeto Genoma Humano tinha como objetivo a detecção dos genes que compõem o DNA humano.
Concluído em 1990, esse projeto contou com o apoio decisivo da bioinformática.
II. A biologia computacional é um campo de pesquisa diferente ao da bioinformática.
III. Uma das aplicações da bioinformática é o alinhamento de sequencias que tem como objetivo principal da
comparação de sequências biológicas é encontrar o(s) alinhamento(s) de maior escore de similaridade.
É correto o que se a�rma em:
I e II.
I e III.
I. 
II. 
 III. 
Respondido em 25/09/2023 14:49:32
Explicação:
Bioinformática e a biologia computacional são duas utilizadas como sinônimos e tem como objetivo a aplicação de
ferramentas computacionais para coletar, armazenar, analisar, manipular, apresentar e compartilhar dados biológicos.
Mas é importante ressaltar que segundo o NCBI a Biologia computacional é uma área de pesquisa que tem como foco
principal problemas de pesquisa especí�cos em biologia. O projeto genoma foi iniciado na década de 90, e tinha como
objetivo o desvendar por completo o DNA do ser humano. Após 13 anos para a conclusão desse projeto, a
bioinformática mais uma vez foi essencial, pois a partir de programas de computador especí�cos, os pequenos trechos
sequenciados eram adicionados a um grande banco de dados e encaixados no seu devido lugar, formando um único
arquivo editável em que todos os participantes do trabalho.
Acerto: 0,0  / 0,2
 Questão / 1
a
 Questão / 
2
a
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javascript:voltar();
javascript:voltar();
14/11/2023, 09:34 Estácio: Alunos
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Julgue as a�rmativas a seguir sobre a ferramenta BLAST, usada para alinhamento de sequências e disponível no
portal do NCBI.
I. Muito usada para sequências com apenas alguns trechos/locais conservados.
II. Importante utilizá-la quando duas sequências têm tamanhos próximos, pois toda extensão da sequência será
comparada.
III. O alinhamento é feito par a par, comparando apenas duas sequências por vez.
IV. Usada para busca em banco de dados de sequências.
É correto o que se a�rma em:
 II e IV.
 I, III e IV.
II, III e IV.
I e II.
II e III.
Respondido em 25/09/2023 14:50:01
Explicação:
O BLAST é uma ferramenta utilizada para o alinhamento de sequências simples (duas sequências) e local (comparadas
regiões de maior similaridade). É indicado para sequências mais divergentes e com tamanhos distintos. O BLAST é
aplicado em vários bancos de dados de sequência de nucleotídeos ou aminoácidos como uma ferramenta de busca.
Acerto: 0,2  / 0,2
Julgue as a�rmativas abaixo usando seus conhecimentos sobre bancos de dados biológicos.
I - Existem diversos bancos de dados biológicos disponíveis, e o tipo de informação disponível costuma ser
diferente, como sequências, estruturas e vias metabólicas.
II - Os bancos de dados biológicos só podem ser acessados mediante o pagamento de uma mensalidade pelo
usuário.
III - Quanto mais detalhado o processo de curadoria dos dados disponibilizados por um banco, mais con�áveis
eles são.
 As a�rmativas I e III são proposições verdadeiras, e a II é uma proposição falsa.
A a�rmativa I é uma proposição verdadeira, e II e III são proposições falsa.
As a�rmativas I e II são proposições verdadeiras, enquanto a III é falsa.
A a�rmativa III é uma proposição verdadeira, enquanto I e II são proposições falsas.
As a�rmativas I, II e III são proposições verdadeiras.
Respondido em 25/09/2023 14:51:07
Explicação:
A maioria dos bancos de dados biológicos mais conhecidos e utilizados são aqueles cujo acesso é livre, isto é, qualquer
um pode acessar e obter os dados armazenados. Eles são muito úteis para o compartilhamento de informações e
veri�cação da veracidade de dados divulgados por cientistas. No entanto, existem diversos bancos de dados
biológicos disponíveis, e o tipo de informação disponível costuma ser diferente, como sequências, estruturas e vias
metabólicas, e quanto mais detalhado for o processo de curadoria dos dados disponibilizados por um banco, mais
con�áveis eles são.
 Questão / 3
a
14/11/2023, 09:34 Estácio: Alunos
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Acerto: 0,2  / 0,2
A árvore �logenética é uma hipótese sobre relações evolutivas, mas para construir precisamos usar
características que sejam indicadores con�áveis de ancestralidade comum. Nesse contexto utilizamos para
construção das árvores as características homólogas. A seguir estão listadas algumas propriedades das
características ditas homólogas. Analise a alternativa que NÃO se refere a essa característica:
Ponto de origem em local similar
 Linhagens diferentes com traços similares
Funções similares
Desenvolvimento similar
Estrutura e composição similar
Respondido em 25/09/2023 14:51:23
Explicação:
Gabarito: Linhagens diferentes com traços similares
Justi�cativa: A homologia é o estudo das semelhanças entre a estrutura de diferentes organismos que apresentam.
Dois caracteres são ditos homólogos quando apresentam a posição (ponto) de origem, estrutura, composição,
desenvolvimento e função similares. A homologia é observada em caracteres, e não em linhagens, por isso que
diferentes linhagens com traços similares não podem ser classi�cadas como homólogas.
Acerto: 0,0  / 0,2
A bioinformática é uma disciplina interdisciplinar que apresenta diferentes aplicabilidades e tem sido bastante
empregada para o desenvolvimento de novas metodologias de análise e garantindo diferentes avanços
cientí�cos. Durante o desenvolvimento do seu trabalho de conclusão de curso você estuda todas as possíveis
interações entre a proteína S do coronavírus (receptor) e possíveis moléculas (ligantes) que serão empregadas
em estudos clínicos para o tratamento da doença em um modelo chave-fechadura. Qual é essa técnica?
 QSAR
 Ancoramento molecular
Alinhamento molecular
Dinâmica molecular
Modelagem molecular
Respondido em 25/09/2023 14:51:35
Explicação:
O ancoramento molecular utiliza o modelo chave-fechadura, pois a variável tempo não é levada em consideração.
Durante a análise, é fornecida uma pontuação de um ancoramento que signi�ca que aquele algoritmo encontrou uma
interação favorável dentro dos seus parâmetros, não é possível extrapolar que isso signi�que uma melhor interação
entre ligante e receptor, a pontuação é apenas um indicador. O alinhamento molecular visa identi�car genes que
compartilham funções ou determinada ancestralidade, podemos também usar o alinhamento para encontrar
proteínas moldes, durante a etapa de modelagem molecular. O ancoramento molecular infere a modelagem molecular,
para construir um modelo tridimensional e é utilizado para obter uma pose do ligante com o alvo e a dinâmica
molecular para analisar como as interações acontecem, mimetizando o organismo. O QSAR é uma técnica estatística
de tratamento de dados a partir de descritores, visa buscar uma equação que quando resolvida tenta prever a
atividade de uma molécula nova contra determinado receptor.
Acerto: 0,2  / 0,2
 Questão / 4
a
 Questão / 5
a
 Questão / 6
a
14/11/2023, 09:34 Estácio: Alunos
https://simulado.estacio.br/alunos/4/6
Durante um noticiário na televisão que falava sobre notícias na área de ciência e tecnologia, o repórter citou
o termo NCBI. Dona Rosângela, curiosa, perguntou a seu neto o signi�cado daquele termo. Qual seria a
resposta correta que o neto de Dona Rosângela deveria dar?
 O NCBI é um portal que apresenta bancos de dados e ferramentas importantes para a área
biotecnológica.
O NCBI é um programa on-line para o desenho de primers.
O NCBI é uma ferramenta usada para o alinhamento de sequências biológicas.
O NCBI se trata apenas de um banco de dados de artigos cientí�cos da área biomédica.
O NCBI é um banco de dados de sequências de nucleotídeos curadas e sem redundância.
Respondido em 25/09/2023 14:52:18
Explicação:
O NCBI (Centro Nacional para Informação Biotecnológica) é uma organização que controla o portal mais famoso da
bioinformática. Dentro desse portal, estão disponíveis diferentes bancos de dados biológicos e ferramentas para
analisá-los. O NCBI se propõe a reunir o resultado do trabalho de pesquisadores ao redor do mundo em um só lugar,
facilitando o acesso e manipulação desses registros. Essa iniciativa impulsiona o avanço do conhecimento na área
biotecnológica.  Dentro do NCBI, temos o GenBank e PubMed, que são bancos de dados disponíveis no portal do
NCBI, mas esse não é o único propósito desse portal. A ferramenta BLAST, usada para o alinhamento de sequências,
também está implementada nesse portal.
Acerto: 0,2  / 0,2
(Adaptado de VUNESP - 2020 - EBSERH - Farmacêutico) A revolução biotecnológica tem fornecido informações
extremamente úteis para a descoberta de fármacos. O su�xo "ômica"  indica uma série de novas disciplinas e
procedimentos que visam à identi�cação funcional e/ou estrutural de tecidos, de células, de padrões de
expressão gênicos e de características metabólicas (Bhogal & Balls, 2008), dentre elas:
BHOGAL, N.; BALLS, M. Translation of new technologies: from basic research to drug discovery and
development. Curr. Drug Discov. Technol., v.5, n.3, p.250-62, 2008.
Genômica, dicotômica e proteômica.
Proteômica, lipidômica e dicotômica.
Genômica, transcriptômica e biônica.
 Genômica, transcriptômica e metabolômica.
Genômica, lipidômica e biônica.
Respondido em 25/09/2023 14:52:41
Explicação:
Genômica, transcriptômica e metabolômica são exemplos de ciências ômicas. Segundo o Dicionário Priberam da
Língua Portuguesa, a palavra "dicotômica" signi�ca "que se divide ou subdivide em dois", enquanto "biônica" signi�ca
"ciência que tem por �m o estudo de certos processos biológicos com vista a aplicar processos análogos para �ns
militares, tecnológicos etc." As demais palavras são ciências ômicas (lipidômica).
Acerto: 0,0  / 0,2
Existem diversas formas de buscarmos a melhor hipótese �logenética com uma matriz de táxons × caractere.
Dentre as possibilidades temos a máxima verossimilhança. Qual das alternativas a seguir de�ne melhor este
conceito?
A proporção das probabilidades de duas hipóteses alternativas.
 Questão / 7
a
 Questão / 8
a
14/11/2023, 09:34 Estácio: Alunos
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A probabilidade de que um evento ocorra.
 A melhor árvore calculada a partir da quantidade de passos, ou mudanças, nos ramos.
A probabilidade de que uma hipótese seja falsa através do método dos mínimos quadrados.
 A probabilidade de observar um conjunto de dados fornecido uma hipótese.
Respondido em 25/09/2023 14:53:26
Explicação:
Gabarito: A probabilidade de observar um conjunto de dados fornecido uma hipótese.
Justi�cativa: Para calcular a probabilidade de um evento ocorrer entre outros é necessário usar o teorema de Bayes.
O método dos mínimos quadrados é utilizado em métodos de distância e não em probabilidades. A máxima
verossimilhança procura a probabilidade de cada hipótese fornecida os dados. A quantidade de passos é utilizada na
parcimônia. A inferência Bayesiano é um método que avaliar a probabilidade posterior de uma árvore e incorporam
informações prévias sobre a probabilidade de hipóteses alternativas.
Acerto: 0,2  / 0,2
Em 2017 a revista "Nature" publicou o artigo "Physical properties of the HIV-1 capsid from all-atom molecular
dynamics simulations" de Perilla & Schulten (2017), onde um supercomputador conseguiu fazer uma simulação
de todos os átomos presentes no capsídeo do vírus HIV-1 por 400 nanossegundos, foram cerca de 4 milhões de
átomos. Qual técnica da bioinformática permite realizar essa análise?
Modelagem molecular
 Dinâmica molecular
Alinhamento molecular
Ancoramento molecular
QSAR
Respondido em 25/09/2023 14:53:38
Explicação:
A dinâmica molecular é um modelo de ajuste induzido que tenta mimetizar o que acontece no ambiente real. Na
dinâmica molecular cada átomo, seja da proteína, do ligante ou da água é levado em consideração para calcular a
movimentação de todo o sistema por alguns nano ou milissegundos e entender as movimentações existentes e assim
concluir como as interações acontecem. O ancoramento molecular utiliza o modelo chave-fechadura, pois a variável
tempo não é levada em consideração. O alinhamento molecular visa identi�car genes que compartilham funções ou
determinada ancestralidade, podemos também usar o alinhamento para encontrar proteínas moldes, durante a etapa
de modelagem molecular. O QSAR é uma técnica estatística de tratamento de dados a partir de descritores, visa
prever a atividade de uma molécula nova contra determinado receptor.
Acerto: 0,2  / 0,2
Aline é biomédica e trabalha em um laboratório para diagnóstico de doenças genéticas. Um dos genes mais
pesquisados é o brca1, que quando sofre mutações especí�cas está associado ao risco aumentado de câncer.
Para identi�car as mutações, é necessário comparar a sequência obtida do paciente com uma sequência
referência não mutada. Qual banco de dados, disponível no NCBI, Aline pode consultar para conseguir uma
sequência referência curada para o gene brca1?
GenBank.
KEGG.
PubMed.
BLAST.
 Questão / 9
a
 Questão / 10
a
14/11/2023, 09:34 Estácio: Alunos
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 RefSeq.
Respondido em 25/09/2023 14:54:02
Explicação:
O RefSeq é um banco de dados de sequências de nucleotídeos de referência, curado por funcionários do NCBI, que é o
banco que a biomédica deveria usar para conseguir comparar a sequência obtida do paciente com uma sequência
referência não mutada de forma curada. O GenBank também é um banco de dados de sequências de nucleotídeos,
mas ele não é curado. O PubMed é banco de dados de textos biomédicos. O KEGG é um banco de dados de vias
metabólicas, principalmente. Já o BLAST não é um banco de dados, e sim uma ferramenta para alinhamento de
sequências.