01-AVA_BIOMEDICINA

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04/11/2023, 15:11 Estácio: Alunos
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Avaliando
Aprendizado
 
Teste seu conhecimento acumulado
Disc.: BIOINFORMÁTICA   
Aluno(a): CLEBER MAX VIEIRA GASQUES 202103145078
Acertos: 1,8 de 2,0 04/11/2023
Acerto: 0,0  / 0,2
Em 2017 a revista "Nature" publicou o artigo "Physical properties of the HIV-1 capsid from all-atom molecular
dynamics simulations" de Perilla & Schulten (2017), onde um supercomputador conseguiu fazer uma simulação
de todos os átomos presentes no capsídeo do vírus HIV-1 por 400 nanossegundos, foram cerca de 4 milhões de
átomos. Qual técnica da bioinformática permite realizar essa análise?
 Dinâmica molecular
Alinhamento molecular
 Modelagem molecular
Ancoramento molecular
QSAR
Respondido em 04/11/2023 14:12:56
Explicação:
A dinâmica molecular é um modelo de ajuste induzido que tenta mimetizar o que acontece no ambiente real. Na
dinâmica molecular cada átomo, seja da proteína, do ligante ou da água é levado em consideração para calcular a
movimentação de todo o sistema por alguns nano ou milissegundos e entender as movimentações existentes e assim
concluir como as interações acontecem. O ancoramento molecular utiliza o modelo chave-fechadura, pois a variável
tempo não é levada em consideração. O alinhamento molecular visa identi�car genes que compartilham funções ou
determinada ancestralidade, podemos também usar o alinhamento para encontrar proteínas moldes, durante a etapa
de modelagem molecular. O QSAR é uma técnica estatística de tratamento de dados a partir de descritores, visa
prever a atividade de uma molécula nova contra determinado receptor.
Acerto: 0,2  / 0,2
Escolha a opção que justi�que por que é importante que o comprimento do produto ampli�cado pela reação de
PCR seja maior que 150 pares de bases (pb).
 Produtos ampli�cados menores que 150pb podem se confundir com restos de primers que não se
ligaram ao DNA e �cam no �nal da eletroforese.
Primers que se ligam ao redor de regiões menores que 150pb formam estruturas secundárias com maior
facilidade.
A enzima Taq DNA polimerase não consegue ampli�car seguimentos de DNA menores que 150pb.
Estabelecer um comprimento mínimo do produto aumenta a especi�cidade da reação.Primers que se
ligam ao redor de regiões menores que 150pb formam estruturas secundárias com maior facilidade.
 Questão1
a
 Questão2
a
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javascript:voltar();
javascript:voltar();
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A temperatura de anelamento para ampli�car uma região menor que 150pb é maior que 72°C.
Respondido em 04/11/2023 14:14:08
Explicação:
O tamanho do produto ampli�cado não interfere na especi�cidade, na formação de estruturas secundárias ou na
temperatura de anelamento. O tamanho ideal do produto da PCR está entre 150 e 1.000 pares de bases (pb).
Fragmentos muito pequenos podem ser confundidos com restos de primers que não se ligaram ao alvo e aparecem no
�nal do gel da eletroforese. Por outro lado, se a região ampli�cada for muito grande, a DNA polimerase pode não
conseguir adicionar todos os nucleotídeos necessários, e nesses casos a PCR não vai funcionar. A Taq tem di�culdade
para ampli�car produtos maiores que 1000pb.
Acerto: 0,2  / 0,2
(CESPE/UNB - INMETRO - 2010- Biotecnologia Molecular)
Microarranjo é uma técnica empregada em biologia molecular que permite medir os níveis de expressão de
transcritos em larga escala. Com relação a essa técnica, assinale a opção correta.
A detecção é realizada por meio de eletroforese em gel de agarose.
 O microarranjo de DNA consiste em um arranjo prede�nido de moléculas de DNA quimicamente ligadas
a uma superfície sólida.
A expressão dos genes é acompanhada com o emprego de sondas marcadas com brometo de etídio.
A técnica em questão é empregada em estudos proteômicos, visto que permite a identi�cação direta das
proteínas expressas.
As lâminas de vidro utilizadas são revestidas por moléculas de lipídios.
Respondido em 04/11/2023 14:15:47
Explicação:
A técnica em questão é empregada em estudos transcriptômicos, visto que permite a identi�cação direta das RNAs
expressas. Para a técnica, são utilizadas lâminas de vidro revestidas com sondas de DNA. A expressão dos genes é
acompanhada com o emprego de sondas marcadas com corantes �uorescentes. A detecção é realizada por meio de
detecção da �uorescência.
Acerto: 0,2  / 0,2
Observe o cladograma abaixo:
 Questão3
a
 Questão4
a
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Imagem Leandro Pederneiras
A seguir são listadas alguns grupos de espécies. Analise as alternativas que, segundo o cladograma, se refere a
um grupo para�lético.
O conjunto de espécies G H I.
O conjunto de espécies A F.
 O conjunto de espécies J K L M.
O conjunto de espécies U V H.
O conjunto de espécies P Q R.
Respondido em 04/11/2023 14:18:02
Explicação:
Gabarito: O conjunto de espécies J K L M.
Justi�cativa: Grupos para�léticos são aqueles que faltam poucos descendentes, menos da metade, para se
transformar em mono�lético. Assim, na imagem da árvore �logenética, o grupo para�lético é o conjunto de espécies J
K L M porque para ser mono�lético só falta uma espécie I. O conjunto de espécies G, H, I; A e F; P, Q, R; U, V e H,
precisariam incluir muito mais grupos para ser um grupo mono�lético, pois alguns espécies do conjunto não
apresentam um ancestral comum próximo, como é o exemplo do conjunto de espécies J K L M. Lembre-se que para
descobrir o ancestral comum de dois táxons basta caminhar sempre para trás da �logenia iniciando do terminal (onde
está o nome da espécie).
Acerto: 0,2  / 0,2
As proteínas são biomoléculas construídas a partir de ligações peptídicas formadas no ribossomo, com a sua
sequência dada pela ordem dos códons de RNAm, que foram transcritos do DNA. A forma que as proteínas se
consolidam depende dos resíduos de aminoácidos que as compõem. Dentre os aminoácidos existem quatro
classes: com carga (positivo ou negativo), polares (sem carga), apolares e os casos especiais (que se comportam
de forma única). Sobre esse assunto analise as a�rmativas a seguir:
I. Os aminoácidos são classi�cados em dois grandes grupos, são eles polares ou apolares.
II. O conjunto total das interações entre os resíduos forma a conformação �nal da proteína (basicamente a
forma tridimensional que ela assume) e esta é fundamental para sua função.
III. A interação entre os aminoácidos ligações de hidrogênio formando α-hélices ou dobrando sua estrutura.
 É correto o que se a�rma em:
 Questão5
a
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I e III, apenas.
II, apenas.
I e II, apenas.
I, apenas.
 II e III, apenas.
Respondido em 04/11/2023 14:21:42
Explicação:
Existem quatro classes que os aminoácidos podem se incluir são eles: com carga polares (positivo ou negativo), polares
sem carga, apolares e os casos especiais (que se comportam de forma única). Dependendo da carga dos aminoácidos
que compõem uma sequência de peptídeos pode ocorrer uma interação do tipo ligação de hidrogênio e assim formar
uma α-hélice ou dobrar a sua estrutura, ou uma repulsão. Essas interações podem irão fornecer a estrutura de cada
proteína. Cada conformação tridimensional é de extrema importância para o funcionamento da proteína, pois irá
possibilitar interação com enzimas, cofatores, funcionar como um canal para a passagem seletiva de alguma
substância, entre outras funções.
Acerto: 0,2  / 0,2
 (UFSM, 2006, Biólogo) As temperaturas são essenciais para realização da ampli�cação do DNA por PCR.
Associe a segunda coluna com a primeira.
 
1. de 0°C a 10°C
2. de 35°C a 65°C
3. 72°C
4. 82°C
5. de 90°C a 96°C
(  ) Maior probabilidade de alinhamento dos primers com a �ta molde.
(  ) Formação de �tas-molde a partir de todos os seguimentos.
(  ) Ideal para ação da enzima Taq-DNA-polimerase.
() Ideal para extensão dos primers a partir da extremidade 3'.
(  ) Estabelecimento de ligações - pontes de hidrogênio, o DNA da amostra e os primers.
 
3 - 4 - 5 - 4 - 2.
5 - 4 - 1 - 5 - 3.
2 - 3 - 1 - 3 - 4.
 2 - 5 - 3 - 3 - 2.
4 - 2 - 3 - 2 - 1.
Respondido em 04/11/2023 14:22:02
Explicação:
Durante a etapa de desnaturação, a temperatura está entre 90-96°C e a dupla �ta do DNA se separa, por
desnaturação, etapa em que ocorre a formação de �tas-molde a partir de todos os seguimentos. O anelamento ocorre
entre 35°C a 65°C, quando os primers se anelam na região complementar do molde, esse é o momento de
estabelecimento de ligações ¿ pontes de hidrogênio, o DNA da amostra e os primers. Após, a DNA polimerase pode
 Questão6
a
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adicionar os nucleotídeos, em 72°C, essa é a temperatura ideal para extensão dos primers a partir da extremidade 3¿.
Durante o ciclo do PCR, a faixa entre 0°C a 10°C e as temperaturas de 82°C não são utilizadas.
Acerto: 0,2  / 0,2
Julgue as a�rmativas abaixo usando seus conhecimentos sobre bancos de dados biológicos.
I - Existem diversos bancos de dados biológicos disponíveis, e o tipo de informação disponível costuma ser
diferente, como sequências, estruturas e vias metabólicas.
II - Os bancos de dados biológicos só podem ser acessados mediante o pagamento de uma mensalidade pelo
usuário.
III - Quanto mais detalhado o processo de curadoria dos dados disponibilizados por um banco, mais con�áveis
eles são.
A a�rmativa III é uma proposição verdadeira, enquanto I e II são proposições falsas.
A a�rmativa I é uma proposição verdadeira, e II e III são proposições falsa.
As a�rmativas I, II e III são proposições verdadeiras.
As a�rmativas I e II são proposições verdadeiras, enquanto a III é falsa.
 As a�rmativas I e III são proposições verdadeiras, e a II é uma proposição falsa.
Respondido em 04/11/2023 14:24:30
Explicação:
A maioria dos bancos de dados biológicos mais conhecidos e utilizados são aqueles cujo acesso é livre, isto é, qualquer
um pode acessar e obter os dados armazenados. Eles são muito úteis para o compartilhamento de informações e
veri�cação da veracidade de dados divulgados por cientistas. No entanto, existem diversos bancos de dados
biológicos disponíveis, e o tipo de informação disponível costuma ser diferente, como sequências, estruturas e vias
metabólicas, e quanto mais detalhado for o processo de curadoria dos dados disponibilizados por um banco, mais
con�áveis eles são.
Acerto: 0,2  / 0,2
Para compreender o que diz uma árvore �logenética diversas terminologias e conceitos são empregados. A
seguir são listados diferentes conceitos sobre a �logenia. Assinale a alternativa que retrata de forma correta um
conceito das árvores �logenéticas:
Topologia signi�ca o táxon terminal, aqueles nomes que estão inseridos no topo da árvore �logenética.
Terminal, num cladograma, signi�ca um ramo com dois nós (duas divergências) nas extremidades.
Quando queremos apontar um táxon duplicado dentro da árvore �logenética dizemos que existe um
grupo irmão.
O ponto no qual o grá�co se inicia é denominado clado inferior, onde está a raiz da árvore.
 Podemos rodar os ramos em seu próprio eixo sem alterar as relações de parentesco, mas se cortamos e
colarmos um ramo em outra parte dizemos que a topologia mudou.
Respondido em 04/11/2023 14:27:31
Explicação:
Gabarito: Podemos rodar os ramos em seu próprio eixo sem alterar as relações de parentesco, mas se cortamos e
colarmos um ramo em outra parte dizemos que a topologia mudou.
Justi�cativa: Terminal são os táxons que foram amostrados na árvore �logenética, também podendo ser nomes de
genes ou características de um conjunto de táxons. Não existe a terminologia clado inferior. Clado é um conjunto de
descendentes e todos os seus ancestrais. Raiz da árvore é o ponto mais antigo no tempo, onde a árvore inicia.
 Questão7
a
 Questão8
a
04/11/2023, 15:11 Estácio: Alunos
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Topologia é o conjunto de relações entre clados e ramos numa árvore �logenética. Um cladograma só possui uma
topologia que pode ser con�gurada de diversas maneiras, ou seja, ao rodar a árvore em seu próprio eixo não muda as
relações de parentescos. No entanto, ao cortar e colarmos um ramo em outra parte da árvore, a topologia muda.
Acerto: 0,2  / 0,2
Sobre a técnica de modelagem molecular analise a relação entre as a�rmativas a seguir:
I. O método de modelagem a ser escolhido depende da igualdade.
PORQUE
II. Uma igualdade superior a 25% podemos optar pela modelagem por homologia. Se for abaixo desse valor e
tivermos o enovelamento do molde conhecido usamos modelagem por ab initio, caso não, optamos pela
modelagem threading.
A respeito dessas asserções, assinale a opção correta:
 As asserções I e II são proposições falsas.
As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justi�cativa da I.
As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justi�cativa da I.
A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira.
A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa.
Respondido em 04/11/2023 14:28:59
Explicação:
O método de modelagem a ser escolhido depende da identidade, caso seja acima de 25% podemos optar pela
modelagem por homologia, se for abaixo desse valor e tivermos o enovelamento do molde conhecido usamos
modelagem por treading, caso não realizamos a modelagem por ab initio.
Acerto: 0,2  / 0,2
Em uma análise utilizando a PCR, Lucas encontrou como resultado a ampli�cação de várias regiões
diferentes do DNA das amostras analisadas. O que ele esperava era encontrar apenas uma região
ampli�cada, somente nas amostras positivas. Para solucionar o problema, seu chefe sugeriu, então, que ele
desenhasse um novo par de primers e prestasse atenção no comprimento em nucleotídeos, para melhorar a
especi�cidade. Você diria para Lucas desenhar um novo par de primers com um comprimento maior ou
menor que o par de primers que ele havia usado primeiro?
Menor, dessa forma os primers podem se ligar a diferentes regiões ao longo do genoma.
Igual, pois o comprimento não interfere na especi�cidade dos primers.
Menor, pois assim aumenta a chance dos primers se ligarem somente na região alvo.
 Maior, pois assim aumenta a chance dos primers se ligarem somente na região alvo.
Maior, dessa forma os primers podem se ligar a diferentes regiões ao longo do genoma.
Respondido em 04/11/2023 14:32:16
Explicação:
A especi�cidade de um primer garante que a região copiada seja realmente a que você deseja, e não outra qualquer.
No caso exposto, houve ampli�cação de várias sequências não desejadas e, para melhorar a especi�cidade, faz-se
necessário aumentar o número de nucleotídeos, pois quanto maior o comprimento de um primer, mais especí�co ele é.
Sequências pequenas de primers podem ocorrer aleatoriamente ao longo do DNA, e não somente na região de
 Questão9
a
 Questão10
a
04/11/2023, 15:11 Estácio: Alunos
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interesse. Quando você usa mais nucleotídeos, você especí�ca melhor o alvo e permite que ele seja ampli�cado
apenas na região desejada.