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Disciplina: BIOINFORMÁTICABIOINFORMÁTICA  AVAV
Aluno: DANIELLE DA SILVA SIQUEIRA GARCIADANIELLE DA SILVA SIQUEIRA GARCIA 202107200359202107200359
Turma: 90049004
SDE4449_AV_202107200359 (AG)   03/04/2023 10:54:47 (F) 
Avaliação: 8,008,00 pts Nota SIA: 9,509,50 pts
 
02265 - ANÁLISE FILOGENÉTICA02265 - ANÁLISE FILOGENÉTICA  
 
 1.1. Ref.: 6069792 Pontos: 1,001,00  / 1,001,00
A construção da árvore filogenética começa no tempo atual e vai estimando as relações no tempo
passado. Os fósseis servem como retratos de um período da evolução e fornecem importantíssimas
compreensões. Numa árvore filogenética, o fóssil é representado por um ramo em que seu ponto terminal
está numa idade anterior a atual. Todas as espécies vivas, entretanto, terminam alinhadas na parte mais
extrema do gráfico, representando a idade atual. Para a construção de uma árvore uma metodologia
empregada é a máxima parcimônia. Assim, uma matriz de táxon/caracter produz uma única árvore
parcimoniosa de comprimento 43. A que se refere o número 43?
É a probabilidade posterior de uma árvore ser escolhida.
É o número de clados da árvore mais parcimoniosa.
É a maior probabilidade de uma árvore ser escolhida.
É o número de caracteres previamente escolhidos.
 É o número de mudanças de estado do caractere necessárias para explicar todos os dados na
árvore.
 2.2. Ref.: 6069588 Pontos: 0,000,00  / 1,001,00
Analise a figura abaixo:
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Imagem: Leandro Pederneiras
De acordo com a figura, são estabelecidas várias relações entre as espécies. Analise as alternativas e
assinale a que retrata essa relação de forma correta.
O grupo A B C é monofilético e está mais próximo filogeneticamente do grupo L M do que do grupo
F G.
 H G F é mais próximo filogeneticamente de I J do que de U V.
 O grupo T S é parafilético e seria um grupo polifilético se incluísse as espécies Q P O N.
O grupo Z Z é irmão do clado I J K L M, não existindo nenhuma outra linhagem entre eles.
O grupo J K é polifilético e possui maior relação de aproximação do grupo L M do que do grupo X Y.
 3.3. Ref.: 6069489 Pontos: 1,001,00  / 1,001,00
Na figura a seguir vemos uma matriz com 3 táxons (A ao C) e 4 caracteres (1 ao 3).
A seguir são listadas 5 topografias de árvores diferentes (A ao E). Analise a alternativa que está de acordo
com a matriz táxon × caractere.
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02925 - NCBI E ALINHAMENTO DE SEQUÊNCIAS02925 - NCBI E ALINHAMENTO DE SEQUÊNCIAS  
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 4.4. Ref.: 6045539 Pontos: 1,001,00  / 1,001,00
Uma árvore filogenética busca desvendar a história evolutiva de um grupo de organismos. Isso pode ser
feito a partir da comparação de sequências biológicas. Uma boa estratégia é escolher um gene que todas
as espécies comparadas possuam, e identificar a partir de alinhamentos as similaridades entre as
sequências de cada espécie. Supondo que você irá comparar a sequência completa do gene para DNA
polimerase de 50 espécies bacterianas diferentes, qual o tipo de alinhamento é o mais adequado nessa
situação?
Alinhamento simples e múltiplo.
Alinhamento simples e local.
Alinhamento múltiplo e local.
 Alinhamento múltiplo e global.
Alinhamento local e global.
 5.5. Ref.: 6045575 Pontos: 1,001,00  / 1,001,00
Sobre a figura abaixo, é correto afirmar que:
Fonte: LarsonGCD/Wikimedia.org/CC BY 3.0  https://commons.wikimedia.org/wiki/File:FAM149A_Promoter_region_(FASTA_format).png
 Apresenta o formato FASTA de uma sequência de nucleotídeos.
Representa o formato Docx de uma sequência de aminoácidos.
Ilustra uma sequência de aminoácidos no formato FASTA.
Exibe uma sequência de nucleotídeos em formato PDB.
Mostra uma sequência de nucleotídeos no formato PDF.
 6.6. Ref.: 6045336 Pontos: 1,001,00  / 1,001,00
Qual ferramenta é uma das mais comuns em bioinformática para alinhamento múltiplo de sequências
biológicas de forma heurística?
GenBank.
BLAST.
PubMed.
Primer3.
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 Clustal.
 
03015 - ANOTAÇÃO GÊNICA03015 - ANOTAÇÃO GÊNICA  
 
 7.7. Ref.: 6054821 Pontos: 0,000,00  / 1,001,00
Eduarda é bioinformata e trabalha com a análise de genomas. Seu chefe lhe enviou um arquivo com várias
sequências de genes separadas. Ele disse que precisava que ela terminasse o processo de anotação
genômica, e que estava faltando apenas a última etapa, de anotação funcional. O que Eduarda precisa
fazer com esses dados para realizar a anotação funcional?
Comparar as sequências dos genes entre si, identificando o maior número de similaridade entre
elas.
 Comparar a sequências de proteínas traduzidas a partir dos genes com sequências presentes em
bancos de dados curados como o UniProtKB/Swiss-Prot.
Armazenar as sequências de nucleotídeos correspondentes aos genes em um arquivo de
sequência, como o formato FASTA.
Encontrar regiões de sobreposição entre as sequências dos genes, a fim de montar o genoma final.
 Determinar a estrutura tridimensional das proteínas codificadas pelos genes por meio da técnica
de Ressonância Magnética Nuclear (RMN).
 8.8. Ref.: 6055045 Pontos: 1,001,00  / 1,001,00
A Doença dos Legionários é causada por bactérias do gênero Legionella, principalmente por Legionella
pneumophila, sendo caracterizada por uma pneumonia severa que afeta geralmente pessoas suscetíveis,
tais como idosos e fumantes, por meio da inalação de aerossóis que contenham a bactéria. Um surto da
Doença dos Legionários ocorrido em Vila Franca de Xira, Portugal, ganhou notoriedade pelo fato de ter
estado associado à primeira forte evidência de transmissão pessoa a pessoa dessa doença.
As mais de 400 pessoas infectadas no período do surto revelaram ser moradoras ou trabalhadoras da Vila
Franca de Xira, ou ter estado naquela região no período do surto. No entanto, uma mulher de 74 anos,
moradora da zona do Porto (outra região de Portugal), que contraiu a Doença dos Legionários nesse
período, revelou não sair da sua zona de residência há muitos meses. O inquérito epidemiológico permitiu
saber, no entanto, que o seu filho, trabalhador em Vila Franca de Xira e um dos responsáveis pela
manutenção de uma torre de refrigeração indiciada como potencial causa do surto, tinha contraído a
Doença dos Legionários uns dias antes e tinha se deslocado para a casa da mãe durante o período agudo
da doença.Amostras respiratórias de mãe e filho foram enviadas para o laboratório, e a bactéria isolada foi
sujeitada a estudo detalhado de sequenciamento. Foi possível verificar que as amostras de L. pneumophila
isoladas dos dois doentes (mãe e filho) eram idênticas e não apresentavam qualquer mutação no DNA
quando comparado às amostras do surto de Vila Franca de Xira. A ausência, na casa, de equipamentos
potencialmente geradores de aerossóis, os resultados negativos para Legionella após coleta das amostras
nas torneiras e chuveiro, associados ao elevado tempo de contato entre mãe e filho numa casa pequena e
com pouco arejamento, permitiram concluir como única explicação possível para a infecção da mãe a
existência de transmissão pessoa a pessoa da Doença dos Legionários. O estudo detalhado feito para
desvendar esse caso da Doença dos Legionários contou com um tipo de análise ômica. Qual foi ela?
Metabolômica.
Lipidômica.
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 Genômica.
Transcriptômica.
Proteômica.
 
03017 - INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA03017 - INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA  
 
 9.9. Ref.: 6075100 Pontos: 1,001,00  / 1,001,00
(adaptado de CESPE -2013-Química) O excesso de peso e uma alimentação rica em gordura podem
causar alterações genéticas, segundo um estudo que analisou o genoma de 703 pessoas obesas, magras e
com excesso de peso. Nesse estudo, os pesquisadores mostraram que o gene LY86, possível contribuidor
da obesidade, sofreu uma metilação sobre vários substratos. Os resultados revelam uma mudança
química no genoma, como se o organismo se adaptasse ao "novo" ambiente. Considerando as informações
apresentadas, é correto afirmar que a alteração sofrida pelo gene LY86 está relacionada.À replicação.
Ao aumento do splicing.
 À taxa de transcrição gênica.
À sequência de bases nitrogenadas.
Ao número de cópias de DN.
 10.10. Ref.: 6075099 Pontos: 1,001,00  / 1,001,00
Adaptada de UPENET/IAUPE - 2017 - UPE ¿ Biólogo) Ao compararmos um gene e uma proteína, ficamos
restritos a tratar da sequência de DNA, que se estende entre os pontos correspondentes às extremidades
da proteína. O processo pelo qual um gene dá origem a uma proteína é chamado expressão gênica. Nesse
contexto, observe as sequências selvagem (esquerda) e mutante (direita) da cadeia β da hemoglobina.
Para responder, utilize a tabela de códons a seguir:
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Após analisar as sequências de nucleotídeos normal e selvagem e a tabela de códon, analise a relação
entre as assertivas a seguir:
I. A diferença entre o DNA selvagem e mutante da cadeia β da hemoglobina, é devido a uma mutação
silenciosa após a troca do nucleotídeo A pelo T.
PORQUE
II. A alteração no nucleotídeo de A pelo T não altera o aminoácido que é adicionado na cadeia peptídica,
sendo nos dois casos adicionados a alanina.
A respeito dessas asserções, assinale a opção correta:
A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa.
As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I.
 As asserções I e II são proposições falsas.
As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justificativa da I.
A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira.
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