DO016-CP-CO-Por_v1r0

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DO016 - Metodologia da Pesquisa Científica
Atividade prática - Respostas
Caso Prático - Aplicado
Para responder à atividade, você deve usar o modelo fornecido no anexo.
Primeiramente, você deve pesquisar na literatura científica, por exemplo, na base de dados PubMed, um artigo científico original (não selecione revisões da literatura de qualquer tipo) relacionado ao campo de estudo a que pertence o programa que está desenvolvendo. O artigo selecionado deve ter sido publicado nos últimos 5 anos. 
Você precisará definir uma estratégia de busca (combinando palavras-chave, etiquetas e operadores booleanos) que lhe permitirá pesquisar o artigo. Para fazer isso, é recomendável que você assista à aula: "Como fazer uma busca efetiva de informações" disponível sob o ícone Conteúdo Multimídia. cuidado! Você não deve utilizar o mesmo exemplo de estratégia de busca mencionado na classe "Como fazer uma busca de informação eficaz" (ou uma estratégia muito semelhante). A originalidade da proposta será valorizada.
Uma vez selecionado o artigo científico, você deve apresentar as seguintes informações (ver anexo):
A estratégia de busca que você utilizou no banco de dados para encontrar o item selecionado. 
 Detalhes do artigo (título, autor principal, revista, ano de publicação).
A referência do artigo selecionado no estilo Vancouver.
Indicar o enfoque desta pesquisa.
Extrair do artigo qual foi a idéia dos pesquisadores e escrevê-la em uma ou duas sentenças.
Um resumo (mínimo 150 e máximo 250 palavras) da levantamento do problema.
Indicar o(s) objetivo (s) do estudo (escreva-os em uma ou duas sentenças). 
Se os autores incluíram sua hipótese, identifique-a e anote-a. Se você não encontrar a hipótese no artigo, você mesmo deve deduzi-la e escrevê-la. Em seguida, escreva a hipótese nula e uma possível hipótese alternativa. Escreva cada hipótese em uma frase.
Um resumo da justificativa da pesquisa em uma ou duas sentenças.
Indicar qual é a variável dependente e a variável independente no estudo selecionado.
Indicar quais eram os critérios de inclusão e exclusão dos participantes do estudo.
Indicar quais foram os resultados mais relevantes do estudo.
Indicar quais eram as limitações do estudo.
Indique quais informações adicionais você contribuiria para o referencial teórico em aproximadamente 150-200 palavras; inclua neste texto um mínimo de 5 e um máximo de 10 referências bibliográficas (incluindo citações no texto e no final do texto a lista de referências em estilo Vancouver). 
Uma nova hipótese para novas pesquisas e um novo objetivo. A originalidade da proposta será valorizada.
Para gerenciar referências bibliográficas, você pode usar o gestor bibliográfico Mendeley (ver Capítulo 3. Ferramentas de busca e acesso às informações de conteúdo e veja o vídeo explicativoa seguir).
cuidado! Você vai extrair informações de uma publicação científica, o que não significa que elas possam ser copiadas literalmente. Você deve escrever as seções solicitadas da contribuição em suas próprias palavras. 
Exigências obrigatórias
O comprimento indicado em número de palavras deve ser respeitado.
O modelo no anexo deve ser usado e as respostas devem ser escritas em letra Times New Roman, tamanho 10, espaçamento simples .
 As referências devem ser incluídas no estilo Vancouver e devem ser citadas tanto no desenvolvimento do trabalho(citações em texto), ao escrever um texto, quanto na seção de bibliografia ao final da atividade. O rigor científico das fontesserá valorizado. Somente fontes acadêmicas e científicas válidas e confiáveis devem ser utilizadas. Os cursos de graduação não devem ser usados como fonte de informação.
O documento deve ser escrito corretamente, formalmente e sem erros ortográficos.
Deve ser seu próprio trabalho original. Somente serão aceitos trabalhos com 0% de plágio ou cópia de conteúdo.
Anexo
Nome e sobrenome: 
Estratégia de busca utilizada (com palavras-chave, etiquetas e operadores booleanos): 
Resposta:
	Câncer de tireoide e biópsia com agulha fina e mulheres e estudo randomizado
Dados do artigo: 
	Título: Desenvolvimento de um ensaio molecular para detecção e qualificação da variação BRAF em tecido residual de amostras de biópsia por aspiração com agulha fina de nódulo de tireoidiano.
Autor principal: Guodong Fu
Revista (nome completo, não abreviado): Jaman Network Open
Ano de publicação: 2021
Referência bibliográfica do artigo selecionado (Vancouver):
Resposta:
	Fu G, Chazen RS, MacMillan C Witterick IJ. Developmente of a Molecular Assay for Detection and Quantification of the BRAF Variation in Residual Tissue From Thyroid Nodule Fine-Needle Aspiration Biopsy Specimens. JAMA Netw Open.2021 Oct 1,4(10): e2127243.doi: 10.1001/jamanetworkopen.2021.27243. Erratum in: JAMA Netw Open. 2022 Mar 1;5(3): e225698. PMID: 34613404; PMCID: PMC8495535.
Qual é o enfoque desta pesquisa? Justifique sua resposta.
Resposta:
	Desenvolver um ensaio molecular sensível para detecção de BRAF V600E em tecido remanscente de biopsias de PAAF da tireoide para identificar pacientes com câncer portadores de uma variação BRAF
Qual foi a idéia dos pesquisadores? (máximo 2 sentenças).
Resposta:
	Este estudo diagnóstico utilizou tecido tumoral de amostras cirúrgicas fixadas em formalina e embebidas em parafina (FFPE) e tecido residual de biópsias de PAAF da tireoide para isolar o DNA genômico. Amostras FFPE foram usadas como conjunto de validação e tecido residual da biópsia de PAAF foi usado como conjunto de teste. Um teste molecular foi desenvolvido para detectar com precisão a variante BRAF V600E usando a reação em cadeia da polimerase digital (dPCR) baseada em sonda de ácido nucleico bloqueada (LNA) e o teste foi validado e identificado por coloração imuno-histoquímica (IHC) do BRAF V600E. O estudo foi realizado de fevereiro de 2019 a maio de 2021.
Levantamento de problema (mínimo 150 e máximo 250 palavras):
Resposta:
	Nódulos tireoidianos são detectados em 70% da população, enquanto apenas 7-15% deles são malignos.1,2 A citologia aspirativa por agulha fina guiada por ultrassom (PAAF) foi usada como padrão pré-operatório. Diagnóstico de nódulos tireoidianos. Cada CAAF da tireoide é classificada em 1 de 6 categorias diagnósticas: (1) não diagnóstico ou insatisfatório (ND), (2) benigno, (3) atípico de significado indeterminado/lesão folicular negativa de significado indeterminado (AUS/FLUS), (4) neoplasia folicular/suspeita de cisto de tireoide (FN/SFN), (5) suspeita de malignidade (SFM) e (6) malignidade calculada, de acordo com o Bethesda Thyroid Pathology Reporting System.3 Felizmente, a maioria das lesões da glândula tireoide pode ser detectada com precisão. diagnosticado como benigno (70% a 75%) ou maligno (5% a 10%). No entanto, o exame citológico não permite distinguir nódulos benignos de nódulos cancerígenos em aproximadamente 30% das PAAF, classificando-os como AUS/FLUS, FN/SFN ou SFM, que são referidos como nódulos não tireoidianos.) ou (tireoidectomia total é necessária.) para acompanhamentos subsequentes. exame histopatológico. Dos nódulos tireoidianos indeterminados, aproximadamente 20% serão considerados malignos após excisão diagnóstica4,5, sugerindo que os 80% restantes dos pacientes serão submetidos a procedimentos cirúrgicos desnecessários. Para pacientes cujas biópsias de PAAF ND contêm células foliculares insuficientes ou insuficientes para o diagnóstico citológico padrão, biópsias adicionais de PAAF são necessárias para repetir a avaliação citológica, resultando em diagnóstico tardio, ao mesmo tempo em que aumenta o estresse e os custos para esses pacientes. No entanto, pacientes com nódulos ND persistentes são encaminhados para cirurgia diagnóstica e aproximadamente 12% dos nódulos apresentam histopatologia maligna. Portanto, surge a questão: O tecido residual da biópsia tireoidiana aspirativa com agulha fina (PAAF) é clinicamente útil em testes moleculares para auxiliar no diagnóstico de nódulos tireoidianos com resultados?
Objetivo(s) (escreva-os em uma ou duas sentenças):
Resposta:
	Desenvolverum ensaio molecular sensível para detectar BRAF V600E em tecido residual de biópsias de tireoide por PAAF para identificar pacientes com câncer portadores de variantes de BRAF.
Hipótese de pesquisa (ou de trabalho), nula e alternativa. Escreva cada um deles com uma frase:
Resposta:
	H1. O tecido residual de biópsias aspirativas com agulha fina da tireoide é clinicamente valioso em um ensaio molecular para auxiliar no diagnóstico de nódulos tireoidianos com achados indeterminados de PAAF. H0 O tecido residual de biópsias aspirativas com agulha fina da tireoide não é clinicamente valioso em um ensaio molecular para auxiliar no diagnóstico de nódulos tireoidianos com achados indeterminados de PAAF. HA O tecido tumoral de amostras cirúrgicas fixadas em formalina e embebidas em parafina (FFPE) é clinicamente valioso em um ensaio molecular para auxiliar no diagnóstico de nódulos tireoidianos com achados de PAAF.
Resumir a justificativa de pesquisa deste estudo em uma ou duas sentenças:
Resposta:
	Este estudo diagnóstico desenvolveu um ensaio molecular usando reação em cadeia da polimerase digital (dPCR) para a detecção sensível e quantificação absoluta da variação do BRAF V600E em tecido residual de biópsias de rotina de PAAF da tireoide. O teste dPCR 5 apresentou melhor sensibilidade que a coloração imuno-histoquímica e boa concordância entre tecido residual de biópsias de PAAF e peças cirúrgicas pareadas.
Qual é a variável dependente? 
Resposta:
	Variação de quantificação BRAF em amostras de tecido residual.
Qual é a variável independente? 
Resposta:
	Amostras de biópsia aspirativa por agulha fina de nódulo tireoidiano.
Quais foram os critérios de inclusão e exclusão para o estudo?
Resposta:
	Um total de 271 amostras de pacientes foram coletadas. Coletados e divididos em um conjunto de 8 conjuntos de validação, contendo 77 amostras de tecido FFPE de tumores de tireoide ressecados entre janeiro de 2010 e fevereiro de 2019, e um conjunto de teste, contendo 146 amostras de tecido residual de biópsias consecutivas guiadas por FNA guiadas por ultrassom com acompanhamento de 48 amostras correspondentes. amostra. amostra cirúrgica. As amostras foram coletadas de fevereiro de 2019 a abril de 2021. As amostras restantes das biópsias de rotina de PAAF da tireoide foram coletadas no Laboratório de Citologia do Hospital Mount Sinai 2 semanas após o exame citológico. A citologia de acordo com o Bethesda Thyroid Cytology System e essas amostras restantes (chamadas de remanescentes) foram consideradas rejeitado.
Qual foi o resultado mais relevante desta pesquisa? Uma frase.
Resposta:
	O primeiro ensaio molecular dPCR foi criado para detectar e quantificar de forma específica e precisa as variantes BRAF e BRAF no DNA de células BCPAP derivadas de carcinomas de tireoide humanos e células de carcinoma de tireoide humano. As células BCPAP se originam de carcinoma papilífero de tireoide. Este estudo diagnóstico desenvolveu um ensaio molecular sensível para detectar e quantificar a variante BRAF V600E em tecidos residuais de biópsias de tireoide por PAAF para identificar pacientes com câncer que abrigam BRAF V600E de maneira secretora. Economia de custos, destacando o valor clínico do teste. Tecido PAAF. no tratamento de tumores da tireoide.
Quais são as limitações do estudo? 
Resposta:
	Este estudo tem certas limitações. Primeiro, o teste molecular dPCR limita-se à detecção de um único alvo: a variante BRAF V600E. Testes adicionais de outros genes ou variantes oncogênicos clinicamente relevantes são necessários para classificar a malignidade de tumores não-BRAF V600E. Em segundo lugar, a precisão da quantificação do VAF é sempre afetada pelo nível de células malignas na amostra, e podem ocorrer resultados falso-negativos quando as biópsias são retiradas de tecido saudável próximo ao tumor. Terceiro, não foi possível determinar a associação entre BRAFVAF em remanescentes de biópsia de PAAF e estado histopatológico na presente coorte. O teste molecular dPCR pode ser ainda validado pela análise BRAFVAF e acompanhamento de achados clinicopatológicos usando coortes maiores de vários centros clínicos.
Que informações adicionais você acrescentaria ao referencial teórico? Escreva um texto científico com as informações que você acrescentaria em aproximadamente 150-200 palavras. Neste texto você deve utilizar um mínimo de 5 e um máximo de 10 referências bibliográficas, fornecendo as citações no texto e a lista de referências no final em estilo Vancouver. Citações e referências NÃO contam para o número de palavras no texto.
Resposta:
	Nas últimas décadas, houve grandes avanços na compreensão das bases genéticas e moleculares envolvidas no desenvolvimento do câncer de tireoide.
contribui para a identificação precoce e melhor manejo de pacientes com maior risco de doença persistente ou recorrente. (1) A mutação BRAF V600E é altamente específica para carcinoma papilífero de tireoide (PTC). Este teste de mutação pode aumentar a precisão diagnóstica da citologia aspirativa por agulha fina (PAAF)(2). Com a identificação de mutações BRAF ativadoras em uma variedade de doenças malignas, os esforços valem a pena. Foram feitas considerações para projetar estratégias de tratamento seguras e eficazes. eficaz no ataque ao BRAF. Esses esforços levaram ao desenvolvimento e à aprovação regulatória de três inibidores de BRAF, bem como cinco combinações de um inibidor de BRAF e um agente adicional para controlar cânceres como tumores malignos, câncer de pulmão inflamatório de células não pequenas, câncer anaplásico de tireoide e câncer colorretal. Câncer. (3) O carcinoma papilar mutante BRAF possui diferentes características fenotípicas e biológicas. Parecem ter comportamento mais agressivo e pior prognóstico (4). A mutação BRAF V600E é a alteração genética mais comum no carcinoma papilífero de tireoide e tem sido relatada em 29 a 83% dos casos.Este tumor(5)1. Ilera V, Dourisboure R, Colobraro A. Mutação V600E de nódulos tireoidianos oncogênicos BRAF NA ARGENTINA. 2016; 2. Paek SH, Kim BS, Kang KH, Kim HS. Resultados falsos negativos da mutação BRAF V600E na citologia aspirativa com agulha fina do carcinoma papilífero da tireoide. World J Cirurgia Oncol. 13 de novembro de 2017;15(1):202. 3. Poulikakos PI, Sullivan RJ, Yaeger R. Vias moleculares e mecanismos de BRAF no tratamento do câncer. 28(21):4618-28. 4. Siegel R, Ma J, Zou Z, Jemal A. Estatísticas do Câncer, 2014. CA Cancer J Clin. 2014;64(1):9-29. 5. Mutação BRAF no câncer de tireoide - PubMe
Imagine que você vai continuar estudando esse tema em particular. Definir uma nova hipótese para pesquisas futuras e um novo objetivo. A originalidade da proposta será valorizada.
Resposta:
	Hipótese (uma frase): Tecido de biópsias aspirativas com agulha fina da tireoide é o melhor método padrão para diagnosticar câncer de tireoide.
Objetivo (uma frase): Determinar se a biópsia por agulha fina é o método padrão para diagnosticar câncer de tireoide.
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