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Microbiologia Geral Professores Disciplinas GBI 111 e 132 • Eustáquio Souza Dias: esdias@dbi.ufla.br • Cristina Ferreira Batista: cristinafsb@dbi.ufla.br • Patrícia Gomes Cardoso: patricia@dbi.ufla.br • Rosane Freitas Schwan: rschwan@dbi.ufla.br • Victor Pylro: victor.pylro@gmail.com • Whasley Ferreira Duarte: whasleyduarte@dbi.ufla.br • Professores voluntários Nadia Nara Batista Pamela Martins 2 mailto:esdias@dbi.ufla.br mailto:cristinafsb@dbi.ufla.br mailto:patricia@dbi.ufla.br mailto:rschwan@dbi.ufla.br mailto:victor.pylro@gmail.com mailto:whasleyduarte@dbi.ufla.br Microbiologia Avenida Norte (paralela à rodovia para Ijaci) MICROBIOLOGIA – DBI/UFLA 3 Biologia Cronograma da aula Importância dos microrganismos Áreas de atuação de pesquisa - UFLA Microbiologia como carreira Histórico da microbiologia 5 Microbiologia como ciência Estudo das células vivas (microrganismos) e seu funcionamento Diversidade e evolução dos microrganismos → surgimento de diferentes tipos e as razões para isso O papel dos microrganismos no mundo → sociedade humana, corpo humano, animais e plantas ✓Maior parte do oxigênio que respiramos é resultante de atividades microbianas → cianobactérias ✓Relação com homens, outros animais e plantas → degradação da matéria orgânica Um homem de 20 a 30 anos, com 1,70 m de altura e 70 kg -- abriga cerca de 39 trilhões de bactérias e possui cerca de 30 trilhões de células. • Identificação de novas doenças. • Tratamento, cura e prevenção Taxas de mortalidade para as principais causas de morte nos Estados Unidos: em 1900 e atualmente. Mas e dai? Qual impacto isso tem na economia? Entenda os impactos do avanço do coronavírus na economia global e brasileira • Desaceleração da economia global e da China • Economia chinesa, pois tem fechado fábricas e lojas, colocado regiões inteiras em quarentena e deixado muitos cidadãos trancados em suas casas por medo do contágio, reduzindo dessa forma o consumo e a atividade econômica. • Empresas projetam lucros menores • Dezenas de multinacionais passaram a alertar seus acionistas que o surto afetará suas finanças, incluindo empresas como Apple, United Airlines, Mastercard, Toyota, Danone. No Brasil, a Petrobras será impactada. • Impacto no PIB do Brasil • Produção de celulares suspensa em fábricas do Brasil • A fábrica da LG em Taubaté (SP) e unidades da Samsung e da Motorola na região de Campinas tiveram produção suspensas, por falta de componentes eletrônicos que deveriam vir da China. • Soja, minério e carne • Exportação - o principal impacto de curto prazo tem sido nos preços das principais commodities vendidas pelo Brasil. As cotações da soja, do petróleo e do minério de ferro têm recuado diante do temor de uma desaceleração da economia chinesa. • Preços do petróleo em queda; ouro em alta • Biocombustíveis gás natural (metano, CH4) é um produto do metabolismo anaeróbio de um grupo de arqueias, chamadas de metanogênicas. Etanol como biocombustível • Biorremediação os microrganismos são utilizados para consumir óleo derramado, solventes, pesticidas, e outros poluentes tóxicos ao ambiente. • Poluentes orgânicos – CO2 • Compostagem é um processo utilizado na jardinagem para converter resíduos de plantas em um equivalente de humus natural. Ácido acético Etanol + CO2 Ácido lático Ácido propiônico Ácido acético CO2 • Patógenos de origem alimentar • Segurança alimentar Trato gastrointestinal Humano Larga escala para a produção de grandes quantidades de artigos de valor relativamente baixo, como antibióticos, enzimas e vários compostos químicos. Emprega microrganismos geneticamente modificados para sintetizar produtos de elevado valor comercial, como a insulina ou outras proteínas humanas, normalmente em menor escala. Microbiologia básica Microbiologia aplicada Medicina Agricultura Indústria -Sistemática microbiana -Fisiologia microbiana -Genética bacteriana -Bioquímica microbiana -Citologia BIOTECNOLOGIA SUSTENTABILIDADE $$$$$$$$$ Microbiologia Agrícola BIOTECNOLOGIA DE MICRORGANISMOS APLICADA À AGROPECUÁRIA E AO MEIO AMBIENTE ECOLOGIA, GENÉTICA E FISIOLOGIA DE MICRORGANISMOS QUALIDADE E SEGURANÇA MICROBIOLÓGICA DE ALIMENTOS BIOTECNOLOGIA DE MICRORGANISMOS APLICADA À AGROPECUÁRIA E AO MEIO AMBIENTE Controle biológico microbiano Microrganismos simbiontes ou indutores de crescimento de plantas Metabólitos primários e secundários microbianos para aplicação biotecnológica Fertilizantes orgânicos a partir de subprodutos agrícolas e agroindustriais Cultivo de Cogumelos comestíveis Recuperação de água residuária e solos contaminados ECOLOGIA, GENÉTICA E FISIOLOGIA DE MICRORGANISMOS Microrganismos de importância no agronegócio Metagenômica, proteômica de microrganismos na alimentação e saúde animal e humana Melhoramento genético de fungos de importância agroindustrial QUALIDADE E SEGURANÇA MICROBIOLÓGICA DE ALIMENTOS Patógenos em alimentos, formação de biofilmes microbianos e controle com agentes sanitizantes. Fungos toxigênicos durante o processamento de vários produtos agrícolas. 1. Biologia e genética de fungos Agaricus subrufescens Agaricus bisporus Pleurotus ostreatus Shiitake 1. Genética de Fungos Genética de Saccharomyces Controls Asc o 1 Asc o 2 Asc o 3 Asc o 4 Aα Genética de Basidiomicetos 30 Laboratório de Cogumelos Comestíveis 31 Prof. Eustáquio Souza Dias 2. Estudo das fermentações industriais e rudimentares • Conhecimento e papel da microbiota envolvida nos processos de: • Fermentação de cacau • Fermentação de caldo de cana de açúcar • Fermentação de café • Fermentação de frutas nativas • Fermentação de forrageiras para silagem • Fermentação de carnes • Fermentação de alimentos e bebidas indígenas e kefir Laboratório de Microbiologia das Fermentações Profª. Rosane Freitas Schwan Laboratório de Microbiologia das Fermentações Profª. Rosane Freitas Schwan 3. Metabolômica microbiana Caracterização de metabólitos primários e secundários importantes em processos fermentativos e para a indústria Fisiologia e Genética de microrganismos Profª. Rosane Freitas Schwan Laboratório de Fisiologia e Genética de Microrganismos 37 Profª. Rosane Freitas Schwan Coleção de culturas da Microbiologia Agricola – CCMA Profª. Rosane Freitas Schwan 4. Microrganismos como agentes de biocontrole e de tratamento e reaproveitamento de resíduos agro-industriais. A- Seleção de bactérias ferro-tolerantes para remediação em solos multicontaminados B- Seleção de leveduras para produção de bioaromas usando vinhoto como substrato C - Seleção de bactérias para produção de pigmentos utilizando resíduos do processamento do café Agua residuaria do processamento de cafe Profª. Cristina Ferreira Silva 5. Bioprospecção de fungos filamentosos Seleção e caracterização de fungos filamentosos isolados de plantas e cavernas brasileiras responsáveis pela produção de metabólitos importantes na indústria. 41 Laboratório de Prospecção e Genética de Fungos Filamentosos 42 Profª. Patrícia Cardoso 6. Ecologia microbiana molecular e bioinformática • Ecologia microbiana do solo: Agricultura de precisão • Bioprospecção molecular • Bioinformática Laboratório de Ecologia Microbiana e Bioinformática Prof. Victor Pyrlo Microbiologia como Carreira 46 AGRONOMIA Controle de doenças causadas por microrganismos Manejo do solo Inoculantes em plantas comerciais Aumento da produtividade Produção de alimentos Produção de alimentos Engenharia de Alimentos e Nutrição 47 Produção de alimentos Controle sanitário de microrganismos patogênicos ou deterioradores nos alimentos Inoculantes e alimentos fermentados diferenciados Probioticos Biologia Estudo da diversidadedos microrganismos nos diferentes ambientes Biologia e Genética de Microrganismos Recuperação de áreas degradadas Propostas de manejo de áreas conservadas 49 Engenharia Florestal Controle de doenças causadas por microrganismos Recuperação de áreas degradadas Propostas de manejo de áreas conservadas Engenharia ambiental e sanitária 50 Utilização dos microorganismos como inseticidas biológicos, não poluentes ao meio ambiente Biorremediação Microbiana Recuperação de áreas degradadas Zootecnia Pesquisa no Rúmen Melhoria da performance do animal Pesquisa e desenvolvimento de probióticos: Bactérias e Leveduras Microbiologia de forragens conservadas Silagens: Bactérias do ácido lático Feno: Fungos- Micotoxinas QUESTÃO NORTEADORA- AULA 1- HISTÓRICO DA MICROBIOLOGIA • COMO A MICROBIOLOGIA MODERNA INTERAGE COM OS EVENTOS OCORRIDOS NA IDADE DE OURO DA MICROBIOLOGIA? Histórico da Microbiologia Aula 01 http://images.google.com.br/imgres?imgurl=http://media-2.web.britannica.com/eb-media/97/12797-004-826843CA.jpg&imgrefurl=http://www.britannica.com/EBchecked/topic-art/124611/9535/Ferdinand-Cohn&usg=__GSmB6MO-Xlv_5QVAFI1l7PaB1hs=&h=300&w=208&sz=17&hl=pt-BR&start=2&itbs=1&tbnid=QjN7i7N8hYwOSM:&tbnh=116&tbnw=80&prev=/images?q=Ferdinand+Cohn&gbv=2&hl=pt-BR&sa=G http://en.wikipedia.org/wiki/File:Thomas_Cavalier-Smith.jpg Histórico da microbiologia Séculos XVII e XVIII Século XIX Era de Ouro Séculos XX Descobertas Século XXI Atualmente Robert Hooke (1664) • Invenção do Microscópio • Descreveu estruturas de frutificação Séculos XVII e XVIII Antoni van Leeuwenhoek - 1684 • Construtor amador de microscópios • Primeira pessoa a observar os microrganismos em detalhes • Observação de Bactérias > Relato à Sociedade Real de Londres • Progresso no entendimento da natureza e a importância desses minúsculos organismos ocorreu lentamente • O desenvolvimento da Micro. como ciência está ligada a 2 aspectos fundamentais: ✓ sec. XIX: 1) aperfeiçoamento da microscopia 2) técnicas laboratoriais: desenvolvimento da microbiologia Séculos XVII e XVIII Século XIX Era de Ouro Duas questões biológicas levaram ao desenvolvimento de técnicas laboratoriais essenciais: • Geração Espontânea: Diversos pensadores debateram a ideia de que materiais inanimados poderiam dar origem a seres vivos. • Natureza das doenças infecciosas: Os mecanismos da transmissão de um indivíduo para o outro eram desconhecidos. http://images.google.com.br/imgres?imgurl=http://www.ufrgs.br/alimentus/pao/imagens/saccharomyces3.jpg&imgrefurl=http://www.ufrgs.br/alimentus/pao/ingredientes/ing_fermento01.htm&usg=__uxWEzE9j7MjrDh-AssjrUz1xO9g=&h=1447&w=1285&sz=486&hl=pt-BR&start=8&tbnid=GFeMf96yQ_kIYM:&tbnh=150&tbnw=133&prev=/images?q=leveduras&gbv=2&hl=pt-BR http://images.google.com.br/imgres?imgurl=http://www.healthequalsvitality.com.au/blog/wp-content/uploads/2009/05/bacteria.jpg&imgrefurl=http://www.healthequalsvitality.com.au/blog/2009/05/infertility-and-ivf/&usg=__-BoNOpv92z4fA1NKQZ2P1Xk8C48=&h=441&w=560&sz=67&hl=pt-BR&start=3&tbnid=6repzbuF4HcZiM:&tbnh=105&tbnw=133&prev=/images?q=bacteria&gbv=2&hl=pt-BR Idade de ouro na microbiologia Ferdinand Cohn (1828-1898) “Pai da bacteriologia” • Botânico interessado em microscopia • Crescimento e divisão celular em células vegetais • “Plantas” unicelulares (algas) e posteriormente as formas de vida fotossintetizantes (cianobactérias) • Acreditava que as bactérias eram membros do reino vegetal • Descobriu o gênero Bacillus (endósporos – estruturas termoresistentes) ✓ água em ebulição não era um método tão eficiente de esterilização • Desenvolvimento de técnicas laboratoriais- tampões de algodão Século XIX - Era de Ouro http://images.google.com.br/imgres?imgurl=http://media-2.web.britannica.com/eb-media/97/12797-004-826843CA.jpg&imgrefurl=http://www.britannica.com/EBchecked/topic-art/124611/9535/Ferdinand-Cohn&usg=__GSmB6MO-Xlv_5QVAFI1l7PaB1hs=&h=300&w=208&sz=17&hl=pt-BR&start=2&itbs=1&tbnid=QjN7i7N8hYwOSM:&tbnh=116&tbnw=80&prev=/images?q=Ferdinand+Cohn&gbv=2&hl=pt-BR&sa=G Louis Pasteur (1822-1895) • Maior oponente à Teoria da Geração Espontânea • Os organismos encontrados nos materiais em decomposição eram provenientes do ar • Postulou que as células estariam constantemente depositadas em todos os objetos • Experimento: pescoço de cisne • Esterilização > Frasco de Pasteur > fim da Teoria da Geração espontânea • Acumulou vários triunfos na microbiologia e na medicina ✓Vacinas (antraz, cólera aviária e a raiva) Século XIX - Era de Ouro http://images.google.com.br/imgres?imgurl=http://bp3.blogger.com/_SW3f7beWk10/RyjMXYPgTbI/AAAAAAAABh8/D117F8YpKu4/s400/a+Pasteur,Louis.jpg&imgrefurl=http://olharcristao.blogspot.com/2008_08_01_archive.html&usg=__oqwlKHsdA1av2dDrz2XWZ5F7LvU=&h=240&w=240&sz=41&hl=pt-BR&start=15&itbs=1&tbnid=bbksPpdnvVRqtM:&tbnh=110&tbnw=110&prev=/images?q=frasco+Pasteur&gbv=2&hl=pt-BR Derrota da Teoria Espontânea Século XIX - Era de Ouro • Comprovação de que os microrganismos causavam doenças (contagiosas). • Estudou o antraz (doença do gado que ocasionalmente acomete seres humanos – Bacillus anthracis). • Injetava sangue (contendo bactérias formadoras de esporos) em camundongos sadios. • Primeiro a usar meio solido para cultivo de bactérias (gelatina, ágar) . • Postulados de Koch → demonstrar que organismos específicos causavam doenças específicas . • Desenvolvimento dos métodos básicos em microbiologia. Robert Koch (1843-1910) “Teoria das doenças causadas por germes” Postulados de Koch Postulados de Koch Outros nomes importantes Uso de fenol em feridas para controle de infecções →Microbiologia médica Joseph Lister (1860) • Cultura de enriquecimento- isolamentos de microrganismos de solos e água (seleção de microrganismos de uma amostra) • Doença do tabaco- não bactéria e sim vírus (filtração)- Virologia Martinus Beijerinck • Bactérias oxidantes de enxofre e nitrogênio • Metabolismo- quimiolitotrofia e autotrofia bacteriana Sergei Winogradsky (1899) Século XIX - Era de Ouro Walter Reed (1900) Provou que mosquitos eram transmissores da febre amarela Paul Ehrlich (1908) Cura para sífilis (bactéria) Neosalvarsan – prêmio Nobel em 1908 Século XX Penicilina Alexander Fleming (1929) Século XX método para sequenciar DNA Fred Sanger, Steven Niklen, Alan Coulson (1977) Século XX análise filogenética do rRNA 16S - Três Dominios (Archae) Carl Woese (1977) Século XX Kary Mullis – 1988 Reação de PCR Mullis e Michael Smith receberam Prêmio Nobel em 1993. Fleischmann e colab– 1995 Primeiro genoma sequenciado - Haemophilus influenza Século XX Primeiro genoma de um organismo eucarioto sequenciado: Saccharomyces cerevisiae 96 laboratórios Andre Goffeau e colaboradores (1996) Século XX Thomas Cavalier-Smith (1998) 6 Reinos (2007) 2 super-reinos e 7 Reinos (2015): Archea, Bacteria, Protozoa Chromista, Fungi, Plantae e Animalia. Século XX http://en.wikipedia.org/wiki/File:Thomas_Cavalier-Smith.jpg Leland H. Hartwell, Tim Hunt e Paul Nurse (2001) • Descoberta da regulação do ciclo celular em eucariotos • Estudando leveduras que se reproduzem por fissão • Prêmio Nobel em Fisiologia ou medicina Século XXI Descobriu que a bactéria Helicobacler pylori causa ulcera e pode ser iniciadora de câncer no estomago Prêmio Nobel em 2005 Barry Marshall and J. Robin Warren (2005) Século XXI https://en.m.wikipedia.org/wiki/File:Marshall_2008.JPG Harald zur Hausen (2008) Alemanha Descobriu o vírus HPV (human papilloma virus) causador do câncer cervical Prêmio Nobel em Fisiologia ou medicina Século XXI Françoise Barré-Sinoussi e Luc Montagnier (2008) • França • Descobriram o vírus causador de imunodeficiência HIV (human immunodeficiency virus) • Premio Nobel em Fisiologia ou medicina Século XXI Onde estudar • Microbiologia: Umaintrodução (12º edição) • Gerard J. Tortora, Berdell R. Funke, Christine L.Case. • Editora Benjamin Cummings • 2017 Onde Estudar • Microbiologia de Brock (14º edição). • Michael T. Madigan, John M. Martinko, Paul V. Dunlap, David P. Clark. • Editora Benjamin Cummings • 2016 Onde estudar • Microbiologia: An Evolving Science (4th edition) • Joan L. Slonczewski and John W. Foster. • Editora W.W. Norton & Company • 2017 Onde estudar •Apostila de aulas práticas – Microbiologia – DBI/ UFLA •Xérox Por que é importante ter conhecimento sobre microbiologia? Obrigada!!!! Até a próxima Aula
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