Micro Topográfica

Prévia do material em texto

A Microbiologia dos Diferentes 
Sítios Anatômicos 
Prof. Marcelo Pilonetto 
PUCPR 
Microbiologia - PUCPR 2 
Introdução 
Perguntas essenciais no estudo das infecções: 
• Quem causa? 
• O que causa? 
• Como causa? 
• Quem está predisposto? 
• Como diagnosticar? 
• Como tratar? 
Microbiologia - PUCPR 3 
Como analisar amostras no Laboratório? 
 
• Sinais e Sintomas 
 
• De onde e como coletar ? 
 
• Como transportar? 
 
• Onde semear e isolar? 
 
• Quais microrganismos valorizar? 
 (patógenos x microbiota normal) 
Microbiologia - PUCPR 4 
Introdução 
Importância da topografia 
• Invasor ou microbiota? 
• Patogênico ou comensal? 
• Valorizar o isolado? 
– Sim: Realiza-se id. e antibiograma – induz 
antibioticoterapia 
– Não: conclui-se análise 
 - racionaliza custos, evita antibioticoterapia desnecessária 
 
 
Microbiologia - PUCPR 5 
Introdução 
• Sítios a serem estudados 
– Trato Genitourinário, 
– Trato Gastrointestinal, 
– Trato Respiratório, 
– Peles e Ferimentos, 
– Sistema Circulatório, 
– Líquidos Estéreis, 
– Sistema Nervoso Central 
Microbiologia - PUCPR 6 
Referências 
• Experiência profissional 
– Rotina do HC - UFPR 
– Rotina do Laboratório GR e do HGeC 
– Rotina e Direção do Laboratório Evangélico 
– Rotina e Direção do LACEN, outros hospitais 
• Koneman, E. - Diagnostic Microbiol. 6 ª ed. 2005 
• Murray, P. - Manual of Clin. Microbiol. - 9 ª ed. 2007 
• Pilonetto - Manual de Procedimentos Laboratoriais em 
Microbiologia - 1998 
Microbiologia - PUCPR 7 
TRATO 
URINÁRIO 
Microbiologia - PUCPR 8 
TRATO URINÁRIO 
O que causa? 
Sintomas: 
• Cistite 
– Dor / ardência 
– Disúria/ polaciúria / 
– Urgência 
 
• Pielonefrite 
– Febre alta / lombalgia (Sinal de Giordani +) 
– Mal-estar geral 
Microbiologia - PUCPR 9 
TRATO URINÁRIO 
Quem causa? 
• “Microbiota normal”/ contaminantes 
– Difteróides Lactobacilos ECN Estrepto viridans 
• Patógenos 
– Enterobactérias (E. coli, Proteus spp., grupo KESC...) 
– Estafilococos (S. aureus, S. saprophyticus) 
– Estreptococos (S. agalacitae, E. faecalis,) 
– Não fermentadores (P. aeruginosa); 
– Candida spp. 
Microbiologia - PUCPR 10 
TRATO URINÁRIO 
Como causa? 
Contato 
 
• Microbiota fecal 
• Colonização vaginal/uretral 
• Ascensão uretral 
 
Adesão 
• Fímbria – células uroepiteliais 
• Receptores - Manose 
 
Multipli -
cação 
• Uma geração a cada 20 minutos 
• Bacteriúria: superior a 105 UFC/mL 
• > 102 UFC/mL e < 105 UFC/mL - avaliar 
Microbiologia - PUCPR 11 
TRATO URINÁRIO 
Como causa? 
Resposta 
• Leucócitos 
• Inflamação 
Sinais e 
sintomas 
• Dor / Ardência / Disúria / Urgência... 
Evolução 
• Eliminação (uso de atb) ou 
• Disseminação 
• Rins (pielonefrite), sangue (urosepsis) 
Microbiologia - PUCPR 12 
TRATO URINÁRIO 
Quem está predisposto? 
• Mulheres jovens, sexualmente ativas 
• Homens com < 2 anos e > 65 anos 
• Diabéticos 
• Uso de sonda vesical - anestesias 
• Cálculo renal 
• Grávidas 
• Má formação congênita (ex.: prega ureteral) 
 
Microbiologia - PUCPR 13 
Curso de Especialização em Microbiologia - PUCPR 14 
TRATO URINÁRIO 
Como diagnosticar? 
Pré-Analítico 
• Higiene dos genitais: 
– Lavar com água e sabonete 
• Coleta de material: 
– Urina de jato médio 
– Urina de coletor 
– Aspirado de sonda urinária 
– Punção supra púbica 
• Transporte: refrigeração (se > 30 min) 
15 
TRATO URINÁRIO 
Como diagnosticar? 
Analítico 
• Exame direto (Microscopia) 
– Gram – gota não centrifugada 
• bactérias, leucócitos e células epiteliais 
• Processamento 
– Alça calibrada 1:1000 (1 microlitro) 
– CLED / MAC ou Meio Cromogênico 
– Incubação - 35º C / 24h 
– Identificação e Antibiograma (mais 24 - 48h) 
– TAT – 48 a 72h (24h, se negativa) 
Microbiologia - PUCPR 16 
 
 
Microbiologia - PUCPR 17 
TRATO URINÁRIO 
Quem está predisposto? 
• Mulheres jovens, sexualmente ativas 
• Homens com < 2 anos e > 65 anos 
• Diabéticos 
• Uso de sonda vesical - anestesias 
• Cálculo renal 
• Grávidas 
• Má formação congênita (ex.: prega ureteral) 
 
Microbiologia - PUCPR 18 
TRATO URINÁRIO 
Como tratar? 
• Quinolonas e Fluorquinolonas 
– Ácido nalidíxico, Norfloxacin 
• Ácido Pipemídico 
• Nitrofurantoína 
• Sulfazotrim 
• Cefalosporinas de 1, 2ª geração 
• Aminoglicosídeos 
• Pielonefrite/ Septicemia 
– Amicacina ou Cefalo de 3ª Geração ou Ciprofloxacina 
 
 
Microbiologia - PUCPR 19 
TRATO GASTROINTESTINAL 
Microbiologia - PUCPR 20 
TRATO GASTROINTESTINAL 
O que causa? 
• Sintomas 
– Superior 
• Gastrite / Úlcera péptica 
– Inferior 
• Diarréia (perda de líq. e eletrólitos) / Desidratação 
• Disenteria (pus / muco / sangue) 
• Caimbra abdominal / tenesmo 
• Vômitos 
 
Microbiologia - PUCPR 21 
TRATO GASTROINTESTINAL 
Quem não causa? 
• Microbiota normal 
– Enterobactérias 
• E. coli, Klebsiella, Proteus, Enterobacter... 
– Enterococcus faecalis e E. faecium 
– Bacteroides fragilis, Bifidobacterium (Anaeróbios) 
– Lactobacillus spp., entre outros 
– Pós – antibioticoterapia: Pseudomonas, Acinetobacter, VRE 
Microbiologia - PUCPR 22 
TRATO GASTROINTESTINAL 
 Quem causa? 
• Patógenos 
– Sorotipos enteropatogênicos de E. coli 
• EPEC, EIEC, EAEC, EHEC/VTEC, ETEC, DAEC 
– Salmonella, Shigella, Yersinia, 
– Campylobacter spp. 
– Aeromonas, Plesiomonas 
– Vibrio spp. 
– Vírus: Rotavírus, Adenovírus, Norovírus, Astrovírus, HAV 
– H. pylori (gastroduodenal) 
Microbiologia - PUCPR 23 
TRATO GASTROINTESTINAL 
Como causa? 
 
Contato 
(7 Fs) 
 
• Água ou alimentos contaminados 
• Falta de higiene pessoal 
• Contaminação fecal 
 
Adesão 
• Fímbria – células do epitelio intestinal 
• Permanece na luz ou invade células 
 
Multipli -
cação 
 
•I - Destruição celular 
•T - Produção de Toxinas ou 
 
Microbiologia - PUCPR 24 
TRATO GASTROINTESTINAL 
Como causa? 
Resposta 
• I - Invasão – Leucócitos – Inflamação 
• T- Secreção de AMPc, Cl-, Na+ e H2O 
Sinais e 
sintomas 
• I – pouco volume, vários episódios, muco 
e sangue 
• T – volumosos, pouco episódios 
Evolução 
• Eliminação - TRO ou uso de atb 
• Portador sadio (Salmonella) 
25 
TRATO GASTROINTESTINAL 
Como diagnosticar? 
• Diagnóstico de Rotina 
– Salmonella, Shigella 
– Laboratórios avançados: 
• EPEC, EIEC, ETEC 
– Culturas especializadas: 
• Campylobacter / Aeromonas 
– Lab. Saúde Pública: 
• Todas acima mais: Vibrio spp., EHEC, Plesiomonas 
26 
TRATO GASTROINTESTINAL 
Como diagnosticar? 
• Coleta do Material 
– Biopsia (gastrite, úlcera) 
– Fezes / Swab retal – valorizar muco/sangue 
– Outros: Hemocultura, urina 
– Transporte: 
• H. pylori - BHI (biopsia), NÃO usar formol 
• Fezes/Swab: Cary-Blair ou Glic. Tamponada, 
• Vibrio spp: Água peptonada 
27 
Exame direto 
– Leucócitos – invasão (disenteria) 
– BGN curvos - Campilo? Vibrio? 
– Leveduras - desequilíbrio da microbiota / alergia/ 
imunosupressão ? 
– BGP esporulados – pós uso de atb? C. difficille ? 
TRATO GASTROINTESTINAL 
Como diagnosticar? 
28 
• Semeadura e Isolamento 
– Meio pouco seletivo (MAC / EMB) 
– Meio mod. seletivo (HE / SS / XLD) 
– Caldo de enriquec. (GN, SEL, TET.) 
• Repique para HE ou SS ou XLD 
• Observar tempo de incubação 
– Outros (TCBS, com ATB...)– Incubação - 35º C / 24 h 
TRATO GASTROINTESTINAL 
Como diagnosticar? 
29 
Diarréias não complicadas 
– Terapia de reposição oral 
Diarréias complicadas 
– Salmonella: ciprofloxacina 
– Outros: sulfazotrim, gentamicina 
– Vibrio: tetraciclina + soro glicosado EV 
 
TRATO GASTROINTESTINAL 
Como tratar? 
Microbiologia - PUCPR 30 
TRATO 
RESPIRATÓRIO 
Microbiologia - PUCPR 31 
TRATO RESPIRATÓRIO 
O que causa? 
• Sintomas – Pneumonia típica: 
– Dor ao respirar/inspirar 
– Tosse produtiva 
– Escarro purulento 
– Febre alta 
– Bacteremia e/ou septicemia 
– Choque séptico 
Microbiologia - PUCPR 32 
TRATO RESPIRATÓRIO 
O que causa? 
• Sintomas – Pneumonia Atípica e Pneumonia Viral 
– Dor de garganta 
– Coriza 
– Tosse seca 
– Escarro menos purulento 
– Febre moderada 
– Pode complicar com superinfecção 
Microbiologia - PUCPR 33 
TRATO RESPIRÁTORIO 
Quem não causa? 
• “Microbiota normal”/ contaminantes 
– Estrepto viridans 
– Difteróides 
– Estafilococos Coagulase Negativa (ECN) 
– Anaeróbios 
 
Microbiologia - PUCPR 34 
TRATO RESPIRÁTORIO 
Quem causa? 
• Patógenos Comunitários 
Típicos 
– Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus 
– Haemophilus influenzae, Moraxella catarrhalis 
Atípicos 
– Mycoplasma pneumoniae, Legionela pneumophila, 
– Chlamydophila pneumoniae 
- 
Microbiologia - PUCPR 35 
TRATO RESPIRÁTORIO 
Quem causa? 
• Patógenos Comunitários 
Vírus: 
- RSV, Coronavírus 
- Parainfluenza 1, 2 e 3 
- Influenza A, B e C 
- Metapneumovírus 
- Bocavírus... 
 
Microbiologia - PUCPR 36 
TRATO RESPIRÁTORIO 
Quem causa? 
• Patógenos Hospitalares 
– Staphylococcus aureus - MRSA 
– Enterobactérias 
• Klebsiella pneumoniae, Enterobacter spp. , Escherichia coli, 
Proteus spp... 
– Não fermentadores 
• P. aeruginosa, Acinetobacter baumanii , Stenotrophomonas 
maltophilia , Burkholderia cepacia... 
Microbiologia - PUCPR 37 
TRATO RESPIRATÓRIO INFERIOR 
Como causa? 
 
Contato 
 
 
•Aspiração ou Inalação 
 
•Refluxo gastroesofágico 
 
Adesão 
• Fímbrias – células do alvéolo 
• Fibronectina 
 
Multipli -
cação 
 
• No alvéolo - Fagocitose 
• Superação da defesa/fagocitose 
 
Microbiologia - PUCPR 38 
TRATO RESPIRATÓRIO INFERIOR 
Como causa? 
Resposta 
• Ativação de Macrófagos 
• Liberação de Citocinas - Inflamação 
Sinais e 
sintomas 
• Tosse produtiva 
• Grande n° de neutrófilos 
• Febre 
Evolução 
• Eliminação - Uso de antibióticos e 
• Reabsorção do derrame ou 
• Bacteremia - Septicemia 
Microbiologia - PUCPR 39 
TRATO RESPIRATÓRIO INFERIOR 
Quem está predisposto? 
• RN pré-maturos 
• Crianças 6m-2 anos 
• Idosos (>65a) 
• Uso de Ventilação Mecânica 
• Uso de antibióticos e anti-a 
• Infecção viral 
• Hospitalização prolongada (ex.: UTI) 
 
Microbiologia - PUCPR 40 
TRATO RESPIRATÓRIO 
Como diagnosticar? 
• Material: 
– Escarro 
– Lavado brônquico 
– Aspirado de sonda traqueal 
– Aspirado trans-traqueal 
• Transporte: temperatura ambiente 
– Rápido, sem refrigerar 
Microbiologia - PUCPR 41 
TRATO RESPIRATÓRIO 
Como diagnosticar? 
• Cultura: 
– Bactérias comuns: AS/MAC/ACH 
 
– Atípicas: meios específicos 
 
– Viral: meios para isolamento de virus 
 
Microbiologia - PUCPR 42 
TRATO RESPIRATÓRIO 
Como tratar? 
• Resfriado – Sintomático 
• Gripe – Oseltamivir 
• Atípicas – Macrolídeos 
• Comunitárias – Amox/Clavulanato; Ceftriaxona 
• Hospitalares – Aminoglicosídeos + Ceftriaxona; 
 Gatifloxacin; Cefepime; Imipenem; 
 Vancomicina; Tigeciclina 
Microbiologia - PUCPR 43 
TRATO RESPIRATÓRIO INFERIOR 
• Quem causa? 
• O que causa? 
• Como causa? 
• Quem está predisposto? 
• Como diagnosticar? 
• Como tratar? 
Microbiologia - PUCPR 44 
SISTEMA NERVOSO CENTRAL 
Microbiologia - PUCPR 45 
SISTEMA NERVOSO CENTRAL 
Microbiologia - PUCPR 46 
SISTEMA NERVOSO CENTRAL 
Quem não causa? 
• Microbiota normal 
– Inexistente 
– Contaminantes: bactérias da pele e do ar 
• ECN, 
• Difteróides 
• Bacillus 
Microbiologia - PUCPR 47 
SISTEMA NERVOSO CENTRAL 
Quem causa? 
• Patógenos bacterianos 
– Neisseria meningitidis (A, B e C) 
– Streptococcus pneumoniae 
– Haemophilus influenzae 
– RN - Streptococcus agalactiae, 
 Listeria monocytogenes, Escherichia coli K1 
– Raros: sífilis, tuberculose 
Microbiologia - PUCPR 48 
SISTEMA NERVOSO CENTRAL 
Quem causa? 
 Vírus: 
 Enterovírus, HSV 1 e 2, 
 VZV, Caxumba, HIV 
 Fungos: 
 Cryptococcus neoformans 
 
Microbiologia - PUCPR 49 
SISTEMA NERVOSO CENTRAL 
O que causa? 
• Sintomas 
– Dor de cabeça 
– Rigidez na nuca 
– Confusão mental 
– Febre 
– Dor no pescoço e nas costas 
– Vômitos e náuseas 
– Torpor (até coma) 
– Petéquias (meningite meningocóccica) 
Microbiologia - PUCPR 50 
SISTEMA NERVOSO CENTRAL 
Como causa? 
 
Contato 
 
 
•Nasofaringe 
•Corrente sanguínea 
•SNC (alguns vírus) 
 
Adesão 
• Fímbrias – células do SNC 
 
 
Multipli -
cação 
 
• Superação da defesa/fagocitose 
• Bactérias capsuladas 
 
Microbiologia - PUCPR 51 
SISTEMA NERVOSO CENTRAL 
Como causa? 
Resposta 
• Ativação de astrócitos e microglia 
• Grande liberação de Citocinas – 
Inflamação aguda 
Sinais e 
sintomas 
• Edema cerebral- hipertensão craniana 
• Febre, dor de cabeça, rigidez de nuca... 
Evolução 
• Disseminação 
• Choque/Óbito - de rápida evolução 
• Eliminação 
Microbiologia - PUCPR 52 
SISTEMA NERVOSO CENTRAL 
Quem está predisposto? 
• RN e RN pré-maturos 
• Crianças 6m-2 anos 
• Idosos (>65a) 
• Cateter intra-craniano 
• Pacientes com sepsis 
• Imunocomprometidos (transplante, HIV, 
leucemias...) 
 
 
Microbiologia - PUCPR 53 
SISTEMA NERVOSO CENTRAL 
Como diagnosticar? 
• Material: 
– LCR – látex, cultura e PCR 
– Sangue - Hemocultura 
– Soro- látex 
• Transporte: temperatura ambiente 
– Ideal: ágar chocolate com CO2, em tubo 
– Rápido, sem refrigerar 
Microbiologia - PUCPR 54 
SISTEMA NERVOSO CENTRAL 
Como diagnosticar? 
• Cultura: 
– Bactérias comuns: Agar Sangue e Agar Chocolate 
 
– Atípicas: meios específicos 
 
– Viral: meios para isolamento de vírus 
 
Microbiologia - PUCPR 55 
SISTEMA NERVOSO CENTRAL 
Como tratar? 
• Bacterias típicas: 
– Penicilina ou Ceftriaxona 
 
• BMR: 
– Ver epidemiologia local: ERV? KPC? 
 
 
 
 
 
 
Microbiologia - PUCPR 56 
SISTEMA 
CIRCULATÓRIO 
Microbiologia - PUCPR 57 
SISTEMA CIRCULATÓRIO 
Quem não causa? 
• Microbiota normal 
– Inexistente 
– Contaminantes: 
 - bactérias da pele (ECN, Difteróides...) 
 - bactérias do ar (Bacillus) 
Microbiologia - PUCPR 58 
SISTEMA CIRCULATÓRIO 
Quem causa? 
• Patógenos 
– Gram negativos 
• E. coli, Klebsiella, Enterobacter, Proteus mirabilis, 
Salmonella 
• Pseudomonas aeruginosa, A. baumannii, S. maltophilia 
• Grupo HACEK 
– Gram positivos 
• S. aureus, S epidermidis, S. haemolyticus 
• S. pneumoniae, S. pyogenes, S. agalactiae 
• Enterococcus faecalis, E. faecium 
Microbiologia - PUCPR 59 
SISTEMA CIRCULATÓRIO 
O que causa? 
• Sintomas 
– Febre alta / Calafrios 
– Mal estar / Choque 
– Hemorragia ungueal 
– Petéquias (pele e mucosas) 
– Murmúrio cardíaco (endocardite) 
Microbiologia - PUCPR 60 
SISTEMA CIRCULATÓRIOComo tratar? 
• Bacterias típicas: 
– Ceftriaxona 
– Ceftazidima 
– Oxacilina 
 
• BMR: 
– Ver epidemiologia local: 
• Carbapenem, Vancomicina, Anfotericina... 
 
 
 
Microbiologia - PUCPR 61 
SISTEMA CIRCULATÓRIO 
Como tratar? 
• Bacterias típicas: 
– Ceftriaxona 
– Ceftazidima 
– Oxacilina 
 
• BMR: 
– Ver epidemiologia local: 
• Carbapenem, Vancomicina, Anfotericina... 
 
 
 
Microbiologia - PUCPR 62 
TRATO RESPIRATÓRIO INFERIOR 
• Como causa? 
– Infecção - pulmonar, sítio cirúrgico e de 
• Quem está predisposto? 
– Pacientes de UTI, Imunossuprimidos 
• Como diagnosticar? 
– Hemocultura (2 a 6 frascos ou outras amostras) 
• Como tratar? 
– Várai muito com suspeita clínica 
Microbiologia - PUCPR 63 
TRATO RESPIRATÓRIO INFERIOR 
• Quem causa? 
• O que causa? 
• Como causa? 
• Quem está predisposto? 
• Como diagnosticar? 
• Como tratar? 
Microbiologia - PUCPR 64 
PELE E 
FERIMENTOS 
Microbiologia - PUCPR 65 
PELE E 
FERIMENTOS 
Microbiologia - PUCPR 66 
PELE E FERIMENTOS 
• Sintomas: 
– Dor / eritema / edema/ febre 
– Secreção (serosa / purulenta) 
– Abscesso (subcutâneo / mucosa) 
– Crepitação ou Ulceração 
 
• Material: 
– Swab profundo ou punção de desc. purulenta 
– Aspirado de drenos / Aspirado de abscesso (punção) 
– Biopsia tecidual 
– Transporte: Stuart (até 24 h) 
Microbiologia - PUCPR 67 
PELE E FERIMENTOS 
• Microbiota normal / contaminantes 
– Estafilcocos Coagulase Negativa e Bacillus spp. (BGP) 
• Patógenos 
– S. aureus, S. pyogenes, fungos – pele íntegra; 
– E. coli, Proteus, Klebsiella, Enterobacter 
– Pseudomonas aeruginosa, A. baumannii 
Microbiologia - PUCPR 68 
 
Microbiologia - PUCPR 69 
Microbiologia - PUCPR 70 
Resumo 
• Ter noções clínicas 
• Saber o quê e onde coletar 
• Como devo transportar? 
• O quê devo valorizar como patógeno? 
• Quem comumente é contaminante / flora ? 
• Dúvidas? 
– Literatura, laboratórios, microbiologistas, colegas...