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LORRANE DE OLIVEIRA BRAGA RANGEL LXIX - UFG Análise da proteína SPIKE • É a proteína que facilita a entrada do vírus na célula, interagindo com as proteínas da superfície celular. A célula encontra a proteína SPIKE e envolve o vírus, o englobando em forma de vacúolos. Porém, antes do vacúolo digerir o vírus a proteína expressa seu gene. • Essa proteína tem pequenas variações, o que promove uma alta variabilidade genética. • Um único aminoácido pode alterar a função da proteína. Ex: anemia falciforme • A SPIKE interage com as proteínas de membrana, permitindo a entrada do vírus na célula. • O vírus ao entrar na célula altera a comunicabilidade celular, pois ele se replica rapidamente, impedido a homeostase. Além do vírus drenar a energia celular, ele interfere nos sinalizadores celular. - Interatividade Aminoácidos Características dos aminoácidos - Todos são alfa-aminoácidos - Grupo alfa- ácido: COO- (carboxila) - Grupo alfa-amino: H3N+ - Hidrogênio - Radical: É o que diferencia os aminoácidos, variando em estrutura, tamanho e carga elétrica. - Forma tridimensional - Zwiterions: Tem duas cargas opostas nas mesmas quantidades em uma mesma molécula, o que faz q o aminoácido seja excelente para o tamponamento do sangue. Assim, os aminoácidos auxiliam na manutenção do PH no sangue. - O carbono é um centro quiral, com exceção da glicina. -O carbono está ligado a 4 diferentes grupos e forma 2 arranjos espaciais, assim eles apresentam 2 estereoisômeros, uma vez que são imagens especulares não sobreponíveis. - Essenciais: Não produzimos ➢ Fenilalanina, Valina, Treonina, Lenina, Leucina, Isoleucina, Metionina, histidina e triptofano. - Naturais: o organismo humano é capaz de sintetizar: Analina, asparagina, aspartato, arginina, cisteína, glicina, glutamina, glutamato, prolina, serina e tirosina. - Todos os aminoácidos são (levogiros) L-aminoácidos, sendo só eles ativos. Pois as células são capazes de sintetizar especificamente os isômeros L de aminoácidos, porque os sítios ativos de enzimas são assimétricos, tornando Estero específicas as reações por elas catalisadas. -D-aminoácidos encontram-se nas bactérias e aminoácidos. - A proteína SPIKE o lado de fora é polar e a parte transmembrana é hidrofóbica, por isso ela fica presa no envelope viral Polaridade e carga o grupo R ✓ Apolares, alifáticos: (alanina, valina, leucina) Eles tendem a se agrupar no interior das proteínas, estabilizando a estrutura proteica por meio de interações hidrofóbicas. Prolina: é uma exceção, seu grupo amino é mantido em uma configuração cíclica que reduz a flexibilidade. Glicina: possui um H como radical Metionina: grupo tioéter (contém enxofre) ✓ Aromáticos: (Fenilalanina, tirosina e triptofano) Eles são relativamente apolares. Introdução Tipos de aminoácidos Classificação LORRANE DE OLIVEIRA BRAGA RANGEL LXIX - UFG ✓ Polares, não carregados: São solúveis em água (serina, cisteína, glutamina...) ✓ Carregados positivamente (básicos): São mais hidrofílicos (lisina, arginina, histidina) ✓ Carregados negativamente (ácidos): (aspartato e glutamato) ✓ Polares neutros: podem ser ionizáveis, mas em ph 7 eles não se ionizam. Os radicais tendem a formar pontes de hidrogênios. Atuam como ácidos ou bases Os grupos amino e carboxila de aminoácidos, em conjunto com os grupos ionizáveis R, funcionam como ácidos e bases fracas. Quando um aminoácido sem um grupo R ionizável é dissolvido em água em pH neutro, ele permanece na solução como um íon bipolar, ou zwitteríon, que pode agir como ácido ou base. A titulação ácido-base envolve a adição ou remoção gradual de prótons. • O Pk1 equivale à parte ácida do aminoácido (COO-) e o Pk2 à parte básica (NH3+). O pl é o ponto onde a glicina está em grande parte como seu íon bipolar zwitterion (+N3H ----CH2- ---COO-). • No ponto inicial PH=1 a glicina está na sua forma mais protonada, pois em Ph ácido a concentração de H+ é muito alta, o que impede e desprotonação do aminoácido. • Com a adição de base, o PH começa a subir, assim no pK1 (COOH = COO-) o aminoácido começa a agir como ácido, liberando o H+ do COOH. • No ponto Pl a glicina está na forma do seu íon zwitterion (ponto isoelétrico). O próximo estágio é a titulação do grupamento amino, que vai ser desprotonado, chegando no PK2 (+NH3=NH2). • Observando essa curva, nota-se a existência de duas regiões com poder de tamponamento. Nos pontos próximos aos PK, pois elas seguram a variação de ph. • Na maioria das vezes o Pl = Pk1 + Pk2 /2 • A glicina tem uma carga negativa acima no seu PL, portanto, irá se deslocar na direção do eletrodo positivo (ânodo) quando colocada em um campo elétrico. • Todos os aminoácidos com um único grupo amino e carboxila, e um grupo R não ionizáveis têm curvas de titulação semelhantes à da glicina. Aminoácidos com o grupo R ionizável têm curvas de titulação mais complexas, com três estágios e três Pka. +1 0 -1 -2 • Pk1: grupamento ácido; Pkr: radical; Pk2: grupamento ácido. • Para calcular o ponto isoelétrico você pega o Pka que se localiza antes da estrutura com carga 0, o PKa do componente que está logo após e faz a média aritmética dos dois. Curvas de titulação LORRANE DE OLIVEIRA BRAGA RANGEL LXIX - UFG +2 +1 0 -1 Média aritmética dos PKs dos radicais NH3 e COOH e os PRs dos demais aminoácidos carregados e fazer uma média aritmética. Quando a carga negativa é igual a positiva aí o peptídeo precipita. Quando o molde e contramolde é mais perfeito a proteína interage mais facilmente. Se a carga for compatível vai ser mais rápido ainda Além dos 20 aminoácidos comuns, as proteínas podem conter resíduos criados por modificações de resíduos comuns já incorporados em um polipeptídeo. ➢ Hidroxiprolina, um derivado da prolina. → proteína da unha, pele. ➢ Hidroxilisina, derivada da lisina. O primeiro é encontrado em proteínas da parede celular de células vegetais e ambos são encontrados no colágeno, proteína fibrosa de tecidos conectivos. ➢ 6-N-metil-lisina: constituinte da miosina ➢ Carboxiglutamato: encontrado na prototrombina ➢ Desmosina: derivada de quatro resíduos Lys, encontrada na proteína fibrosa elastina. ➢ Selenocisteína é um caso especial. Esse raro resíduo de aminoácido é introduzido durante a síntese proteica, em vez de criado por uma modificação pós-sintética. A adição de grupos fosforil, metil, acetil, adenilil, ADP- ribosil ou outros grupos a resíduos de aminoácidos específicos pode aumentar ou diminuir a atividade de uma proteína Funções ✓ Estrutura da célula. Hormônios. ✓ Receptores de proteínas e hormônios. ✓ Transporte de metabólitos e íons. ✓ Atividade enzimática. ✓ Imunidade. ✓ Gliconeogênese no jejum e diabetes. Propriedades ortomoleculares: ✓ Antioxidante. ✓ Pro-oxidante. ✓ Metilação e remetilação. ✓ Quelante. ✓ Desintoxicante. ✓ Precursor de hormônios. Aminoácidos incomuns PI da SPIKE