2a Enzimas Nomen e Class Vera

Prévia do material em texto

II ÁREA 
ENZIMAS 
 NOMENCLATURA E 
CLASSIFICAÇÃO 
Vera 
 Sufixo ase ao nome do substrato ou uma expressão que descreva a 
sua ação catalítica: 
Ex: uréia  urease 
 DNA  DNA polimerase 
 
 
7. Nomenclatura e Classificação das 
enzimas 
Vera 
DNA polimerase 
 Sufixo ase ao nome do substrato ou uma expressão que descreva a 
sua ação catalítica: 
Ex: uréia  urease 
 DNA  DNA polimerase 
 
 Nome relacionado a função ampla a qual estão inseridas: 
Ex.: lisozima  lise das paredes bacterianas 
 pepsina  do grego pepsis (digestão) 
 
 
7. Nomenclatura e Classificação das 
enzimas 
Vera 
 Sufixo ase ao nome do substrato ou uma expressão que descreva a 
sua ação catalítica: 
Ex: uréia  urease 
 DNA  DNA polimerase 
 
 Nome relacionado a função ampla a qual estão inseridas: 
Ex.: lisozima  lise das paredes bacterianas 
 pepsina  do grego pepsis (digestão) 
 
 Nome de acordo com sua fonte: 
Ex.: Tripsina  do grego tryein (corroer, o tecido pancreático) 
 
 
7. Nomenclatura e Classificação das 
enzimas 
Vera 
 Sufixo ase ao nome do substrato ou uma expressão que descreva a 
sua ação catalítica: 
Ex: uréia  urease 
 DNA  DNA polimerase 
 
 Nome relacionado a função ampla a qual estão inseridas: 
Ex.: lisozima  lise das paredes bacterianas 
 pepsina  do grego pepsis (digestão) 
 
 Nome de acordo com sua fonte: 
Ex.: Tripsina  do grego tryein (corroer, o tecido pancreático) 
 
 Nome alternativo ou trivial: “apelido” , pois o sistemático é longo 
 
7. Nomenclatura e Classificação das 
enzimas 
Vera 
 Sufixo ase ao nome do substrato ou uma expressão que descreva a 
sua ação catalítica: 
Ex: uréia  urease 
 DNA  DNA polimerase 
 
 Nome relacionado a função ampla a qual estão inseridas: 
Ex.: lisozima  lise das paredes bacterianas 
 pepsina  do grego pepsis (digestão) 
 
 Nome de acordo com sua fonte: 
Ex.: Tripsina  do grego tryein (corroer, o tecido pancreático) 
 
 Nome alternativo ou trivial: “apelido” , pois o sistemático é longo 
 
 Nome sistemático segue a classificação sistemática 
 
7. Nomenclatura e Classificação das 
enzimas 
Vera 
 Sistema oficial da União Internacional de 
Bioquímica 
 As enzimas são classificadas e denominadas de 
acordo com a natureza da reação química que 
catalisam. Existem 6 classes, várias sub-classes e 
sub-subclasses 
• Cada enzima - no de código (EC - Enzyme 
Comission) com 4 dígitos que caracterizam o tipo 
de reação: 
 
 
7. Nomenclatura e Classificação das 
enzimas 
http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/ 
 1º dígito - classe 
 2º dígito - subclasse 
 3º dígito - sub-subclasse 
 4º dígito - indica o substrato 
Vera 
Sites sugeridos 
 
http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/ 
 
http://www.expasy.org/enzyme/ 
 
http://www.brenda-enzymes.org/ 
 
http://www.wwpdb.org/ 
 
http://merops.sanger.ac.uk/ 
7. Nomenclatura e Classificação das enzimas 
Evita ambiguidades 
Identificação da enzima através da reação que ela catalisa 
ATP + Glicose  ADP + Glicose-6P 
nome alternativo, trivial ou recomendado: Hexocinase 
 nome sistemático: ATP-glicose fosfotransferase 
 E.C. 2.7.1.1 
 2. classe: transferases 
 7. subclasse: fosfotransferase 
 1. fosfotransferase com grupo hidroxil de aceptor 
 1. glicose como substrato 
Vera 
 hidreto : H
- 
Enzimas - Classificação 
 
AH2 + B A + BH2 
 
Exemplo Ácido Lático Desidrogenase 
 
 
COOH NADH NADox COOH 
   
CO H-C- OH 
   
CH3 CH3 
 
Ácido Pirúvico Ácido Lático 
1. Oxidoredutases – transferência de elétrons, íons 
hidreto (H-), átomos de H 
Lactato desidrogenase EC 1.1.1.27 
Vera 
+ H+ 
Oxidado Reduzido 
RED 
Enzimas - Classificação 
1. Oxidoredutases – transferência de elétrons 
Etanol Acetaldeído 
Álcool desidrogenase EC 1.1.1.1 
Vera 
Enzimas - Classificação 
Exemplo: Hexocinase 
2. Transferases 
 transferência de grupos 
EC 2.7.1.1 
Vera 
2. classe: 
 transferases 
 
 7. subclasse: 
 fosfotransferase 
 
 1. subsubclasse: 
 fosfotransferase com hidroxil de aceptor 
 
 1. substrato: 
 glicose 
 
Enzimas - Classificação 
Exemplo: Aminotransferase – TGP 
Transaminase glutâmico pirúvica EC 2.6.1.2 
2. Transferases - transferência de grupos 
Vera 
Enzimas - Classificação 
Exemplo: Glicogênio Sintase 
2. Transferases 
 transferência de grupos 
EC 2.4.1.11 
Vera 
Enzimas - Classificação 
3. Hidrolases - reações de hidrólise 
Exemplo: Lactase EC 3.2.1.23 
Lactose 
(-D-glicopironosil--D-
galactopiranose ) 
H2O 
Glicose + Galactose 
Vera 
Enzimas - Classificação 
3. Hidrolases - reações de hidrólise 
Exemplo: Quimiotripsina EC 3.4.21.1 
Vera 
Enzimas - Classificação 
4. Liases – 
adição ou remoção 
de grupos (H2O, 
NH4
+, CO2). 
Ex: Fumarase 
EC 4.2.1.2 
Vera 
Enzimas - Classificação 
5. Isomerase – transferência de grupos dentro da mesma 
 molécula, formação de isômeros 
EC 5.3.1.1 
Triose Phosphate 
Isomerase 
 
Vera 
Enzimas - Classificação 
6. Ligases – reações de síntese com consumo de ATP 
Exemplo: Piruvato carboxilase EC 6.4.1.1 
Vera 
3. Hidrolases 
3.1 Ésteres 
3.2 Ligações glicosídicas 
3.4 Ligações peptídicas 
3.5 Outras ligações C-N 
 
 
5. Isomerases 
5.1 Racemases 
 
 
 
6. Ligases 
(consumo de ATP) 
6.1 CO 
6.2 CS 
6.3 CN 
6.4 CC 
 
 
4. Liases 
4.1 CC 
4.2 CO 
4.3 CN 
 
 
 
2. Transferases 
2.1 Grupos de C1 
2.2 Grupos aldeídos e cetonas 
2.3 Grupos acil 
2.4 Grupos glicosil 
2.7 Grupos fosfato 
2.8 Grupos contendo S 
 
1. Oxido-redutases 
1.1 Atuam em CHOH 
1.2 Atuam em CO 
1.3 Atuam em CCH 
1.4 Atuam em CHNH2 
1.5 Atuam em CHNH 
1.6 Atuam em NADH, NADPH 
CLASSIFICAÇÃO DE ENZIMAS 
Vera 
1. Óxido-redutases 
1.1. Agindo sobre o grupo CH-OH dos doadores 
1.1.1. com NAD ou NADP como aceptor (álcool 
 desidrogenase, lactato desidrogenase) 
1.1.3. com O2 como aceptor (glicose oxidase) 
1.2. Agindo sobre a carbonila aldeído ou cetona dos doadores 
1.2.1. com NAD ou NADP como aceptor (gliceraldeído-3-fosfato 
desidrogenase) 
1.2.3. com O2 como aceptor (xantina oxidase) 
1.3. Agindo sobre o grupo CH-CH dos doadores 
1.3.1. com NAD ou NADP como aceptor (diidrouracil-
desidrogenase) 
1.3.3. com um citocromo como aceptor (acil-CoA desidrogenase) 
1.4. Agindo sobre o grupo CH-NH2 dos doadores 
1.4.3 . com O2 como aceptor (aminoácido oxidases) 
 
CLASSIFICAÇÃO DE ENZIMAS 
Vera 
2. Transferases 
2.1. Transferindo grupos C1 
2.1.1. metiltransferases (guanidoacetato metiltransferase) 
2.1.2. hidroximetiltransferases e formiltransferases (serina-
hidroximetiltransferases) 
2.1.3. carboxiltransferases e carbamoiltransferase (ornitina 
carbamoiltransferase) 
2.3. Aciltransferases (colina acetiltransferase) 
2.4. Glicosiltransferases (maltose fosforilase) 
2.6. Transferindogrupamentos contendo N 
2.6.1. aminotransferases (transaminases) 
2.7. Transferindo grupamentos contendo fósforo 
2.7.1. fosfotransferase com uma hidroxila alcóolica como aceptor 
(glicoquinase) 
2.8. Transferindo grupamentos contendo enxofre 
2.8.3. CoA-transferases 
2.8.3.1. Acetil-CoA:propionato CoA-transferase (propionato CoA-
transferase) 
 
Vera 
3. Hidrolases 
3.1. Rompendo ligações éster 
3.1.1. hidrolases de ésteres carboxílicos (esterases, lipases) 
3.1.3. hidrolases de monoéster fosfórico (fosfatases) 
3.1.4. hidrolases de diésteres fosfóricos (fosfodiesterase de veneno de 
cobra) 
3.2. Rompendo ligação glicosídica 
3.2.1. glicosídeo hidrolases (amilase, -glicosidase) 
3.2.2. N-glicosídeo hidrolases (nucleosidases) 
3.4. Rompendo ligações peptídicas 
3.4.1. -aminopeptídeo aminoácidos hidrolases (leucina 
aminopeptidase) 
3.4.2. -carboxipeptídeo aminoácidos hidrolases (carboxipeptidases) 
3.4.4. peptídeo hidrolases ou endopeptidases (pepsina, tripsina, 
quimotripsina) 
3.5. Agindo sobre outras ligações C-N que não as ligações peptídicas 
3.5.1.5. Uréia-amido-hidrolase (urease) 
3.6. Agindo sobre ligações anidrídicas 
3.6.1.3. ATP-fosfo-hidrolase (ATPase) 
 Vera 
4. Liases 
4.1. C-C liases 
4.1.1. carboxi-liases (piruvato descarboxilase) 
4.1.2. aldeído-liases (aldolase) 
4.2. C-O liases 
4.2.1. hidroliases (fumarato-hidratase ou fumarase) 
4.3. C-N liases (histidina-amônia liase ou histidase) 
5. Isomerases 
5.1. Racemases e epimerases 
5.1.3. agindo sobre os glicídeos (ribulose-5-fosfato-epimerase) 
5.2. Cis-trans-isomerases (maleilacetoacetato-isomerase) 
5.3. Óxido-redutases intramoleculares 
 5.3.1. interconversoras aldoses e cetoses (glicosefosfato-isomerase) 
5.4. Transferases intramoleculares (metilmalonil-CoA-mutase) 
Vera 
6. Ligases 
6.1. Formando ligações C-O 
6.1.1. ligases aminoácidos-RNA (enzimas de ativação de aminoácidos) 
6.3. Formando ligações C-N 
6.3.1. ligações ácido-amônia (glutamina-sintetase) 
6.3.2. ligações ácido-aminoácido (peptídeo-sintetase, glutationa-
sintetase) 
6.4. Formando ligações C-C 
6.4.1. carboxilases (acetil-CoA-carboxilase) 
 
Vera 
3. Hidrolases 
Esterases 
Lipases 
Nucleosidases e Nucleotidases 
Peptidases 
Fosfatases 
SulftaseS 
5. Isomerases 
Epimerases 
Determinadas mutases 
Racemases 
1. Oxido-redutases 
Desidrogenases 
Desaturases 
Hidroxilases 
Oxidases 
Oxigenases 
Redutases 
GLOSSÁRIO DE ENZIMAS 
Vera 
2. Transferases 
Cinases 
Determinadas mutases 
Fosforilases 
Polimerases 
Sintases 
Transaldolases e 
transcetolases 
Transaminases 
 
4. Liases 
Aldolases 
Descarboxilases 
Hidratases 
Sintases 
6. Ligases 
Carboxilases 
Sintetases 
Atividades ilustrativas II 
Vera 
cienciaecultura.bvs.br/scielo.php